遺伝性眼底疾患におけるエキソントラップ法によるスプライス変異の解析

2001 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 12877279
• Research Institution: Kagoshima University
• Principal Investigator: 伊佐敷 靖 鹿児島大学, 医学部, 助教授 (70168160)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 中尾 久美子 鹿児島大学, 医学部・附属病院, 講師 (30217658)
• Keywords: 遺伝性眼底疾患 / 変異動態 / エキソントラップ法 / ゲノムDNA

Research Abstract

遺伝性眼底疾患では病変部位の発現試料を得ることが困難なので、ゲノムDNA試料にエキソントラップ法を応用して、スプライス変異例における翻訳動態の解析を試みた.
遺伝性網膜ジストロフィSorsby's fundus dystrophyの疾病遺伝子(TIMP3)のスプライス受容部位挿入変異例、REP1遺伝子のスプライス供与部位変異陽性のコロイデレミア症例およびCYP1BI遺伝子のブレームシフト変異陽性の先天緑内障症例を検索対象とした.ゲノムDNA試料から、それぞれの変異部位および周辺のエキソンを含む領域を単一断片として増幅し、エキソントラップベクターの2個のエキソンの間に挿入した.挿入型のエキソントラップベクターをCOS細胞内で発現させ、転写後のRNAからcDNA断片を回収して、その塩基配列を決定した.TIMP3変異例では、エキソン5の転写が無視されて、エキソン4の直後にエキソントラップベクター固有の第2エキソンの塩基配列が解読された.REP1遺伝子スプライス供与部位変異例ではエキソンのスキップが、CYP1BI遺伝子の一塩基挿入変異例ではフレームシフト効果による異常な終止コドンの新生がおこることが推察されるが、エキソントラップ法でみる限りでは、短縮されたcDNA断片を確認できなかった.
TIMP3遺伝子の場合には変異部位以降の遺伝子にスキップがおこることが確認され、エキソントラップ法が変異動態解析に有用であることが示された.一方、REP1遺伝子およびCYP1BI遺伝子の場合には異常断片を検出できなかった.遺伝子およびその変異の性状に応じて、メッセージを解読するような他の方法を検討する必要がある.

Research Products

• [Publications] Isashiki Y, Ohba N, Nakagawa M, Izumo S: "Optic neuropathy and cerebellar ataxia associated with a rare missense variation(A14510G) of mitochondrial DNA"British Journal of Ophthalmology. 85. 1009-1010 (2001)
• [Publications] Isashiki Y, Kii Y, Ohba N, Nakagawa M: "Retinopathy associated with Machado-Joseph disease (spinocerebellar ataxia 3 with CAG trinucleotide repeat expansion"American Journal of Ophthalmology. 131. 808-810 (2001)
• [Publications] Kakiuchi-Matsuumoto T, Isashiki Y, Ohba N, Kimura K, et al.: "Cytochrome P450 1B1 gene mutations in Japanese patients with primary congenital glaucoma"American Journal of Ophthalmology. 131. 345-350 (2001)
• [Publications] Kimura K, Isashiki Y, Sonoda S, Kakiuchi-Matsumoto T, et al.: "Genetic association of manganese superoxide dismutase with exudative age-related macular degeneration"American Journal of Ophthalmology. 130. 769-773 (2000)