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2012 Fiscal Year Annual Research Report

生体内小分子によって成熟が制御されるヒトmiRNA前駆体の探索及び機能解析

Research Project

Project/Area Number 12J08188
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

寺坂 尚紘  東京大学, 大学院・理学系研究科, 特別研究員(DC1)

KeywordsSELEX / miRNA / non-coding RNA
Research Abstract

プロジェクト初年度である本年度は、ヒトsmall non-coding RNAライブラリーを用いてSELEX法を行い、小分子結合性miRNA前駆体の探索を行った。
最初にターゲット小分子の第一候補であるS-アデノシルホモシステインを、NHS基が表面にある磁気ビーズにアミノ基を介して固定化し、SELEX法を行った。6ラウンドのセレクションの結果、1種類の新規のncRNA配列が得られ、SAH-1と命名した。ノーザンプロッティング、q-PCR法によって、SAH-1はHeLa S3細胞に発現していることが確認された。またIn-line probing法・変異体解析により、SAHはSAH-1のインターナルループ構造に結合していることが分かった。SAH-1のヒト細胞内での機能解析は現在進行中である。
二つ目に、葉酸をターゲットとしたSELEX法も行った。ヒドロキシル基が表面にあるビーズに対し、葉酸のカルボキシル基をエステル結合を介して固定化した。4ラウンドのセレクションの結果、ヒトmiRNA前駆体であるpre-miRNAの配列が得られた。このpre-miRNAの葉酸結合部位や生体内での機能の解析は現在進行中である。
以上のことより本年度では、ヒトsmall noncoding RNAライブラリーを用いたSELEX法を確立した。小分子に結合するmiRNA前駆体の報告はこれまでに無く、本年度の研究成果は新規のmiRNA転写後調節機構の発見につながることが期待できる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

現在までに、ヒト由来のsmall non-codingRNAライブラリーを用いた小分子に対するセレクションを行う系を確立した。またこの系を用いて葉酸に対して結合するヒトmiRNA前駆体を発見した。これらの成果は当初の年次計画通りである。

Strategy for Future Research Activity

今後は、葉酸の結合によってmiRNA前駆体のプロセシング過程に変化があるかをin vitro系を用いて調べていく。
miRNAプロセシングに関わるDicer、Droshaの発現・精製を行う予定である。また。葉酸とmiRNA前駆体の結合定数を表面プラズモン共鳴法などを用いて測定する計画である。

  • Research Products

    (3 results)

All 2012

All Presentation (3 results)

  • [Presentation] In vitroセレクションによる生体内小分子に結合するヒトsmall non-coding RNAの探索2012

    • Author(s)
      寺坂尚紘、二井一樹、加藤敬行、後藤佑樹、菅裕明
    • Organizer
      第24回高遠シンポジウム
    • Place of Presentation
      高速さくらホテル (長野県)
    • Year and Date
      2012-08-23
  • [Presentation] In vitroセレクションを用いた生体内小分子に結合するヒトsmall-noncoding RNAの探索2012

    • Author(s)
      寺坂尚紘、二井一樹、加藤敬行、後藤佑樹、菅裕明
    • Organizer
      第14回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学川内キャンパス (宮城県)
    • Year and Date
      2012-07-18
  • [Presentation] 生体内小分子に結合するヒトsmall non-coding RNAの探索2012

    • Author(s)
      寺坂尚紘、二井一樹、加藤敬行、菅裕明
    • Organizer
      第11回新規素材探索研究会
    • Place of Presentation
      新横浜フジビューホテル (神奈川県)
    • Year and Date
      2012-06-08

URL: 

Published: 2014-07-16  

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