2014 Fiscal Year Annual Research Report
文化財の生物劣化モニタリング－超微量試料中のカビ、キノコ由来遺伝子の定性・定量－
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12J10512
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| Research Institution | Independent Administrative Institution National Institutes for Cultural Heritage Tokyo National Research Institute for Cultural Properties |
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Principal Investigator |
和田 朋子 独立行政法人国立文化財機構東京文化財研究所, 保存修復科学センター, 特別研究員(PD)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 文化財 / モニタリング / 微生物 / 遺伝子解析 / 菌叢解析 / 分子時計解析 / 糸状菌類 / バクテリア |
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| Outline of Annual Research Achievements |
最終年度では以下の項目の通り、研究を遂行し、取りまとめを行った。
1. 文化財の生物劣化に関わる微生物群のモニタリング
本項目では、歴史的建造物から得た試料について濃度勾配ゲル電気泳動法(DGGE)法や次世代シーケンスによる解析を行い、多様な環境下にある文化財中に存在する微生物叢のモニタリングを行った。昨年度以前は、神社のこけら屋根や油画、掛軸等を対象としたが、本年度はさらに対象を拡げ、トルコ・イスタンブール大学との共同研究で木造沈没船や出土木材、京都大学との共同研究で屋久杉などの試料をご恵与頂き様々な解析手法を用いてモニタリングを行った。本年度はさらに菌類のみならず細菌類の菌叢解析を行った他、京都大学との共同研究で透過型電子顕微鏡による観察を行っている。これらの結果については、国際学会で４件発表した。旧石器時代の出土木材のモニタリング結果については保存科学誌への採録が決定しており、それ以外のサンプルについての結果は現在査読付論文に投稿準備中である。
2. ターゲットとする遺伝子の検討
昨年度以前に特定の遺伝子配列を用いることで定量解析や木材腐朽菌の特性を反映した分類ができる可能性について示した。そこで昨年度に引き続き本年度も米国クラーク大学に留学し、アメリカ農水省のゲノムデータベースを用いて菌類のハウスキーピング遺伝子や糖質加水分解酵素遺伝子配列を用いて配列解析を行った。具体的にはBeastソフトウェアを用いて分子時計解析を行い、さらにDataMonkey, Paml, HyPhyなどの解析ソフトウェアを用いてdN/dS比検定をおこなった。現在論文投稿に向けてこれらの解析結果について取りまとめている。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(10 results)
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[Journal Article] Microbial flora analysis of Neolithic tree remains from the Yenikapi excavation site in Istanbul, Turkey, using denaturing gradient gel electrophoresis2015
Author(s)
Tomoko Wada, Yuji Nakada, Dilek Dogu, Coskun Kose, Nural Yilgor, Kamile Tirak Hizal, Makoto Yoshida, Kiyohiko Igarashi, S. Nami Kartal, Ken Okada
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Journal Title
保存科学
Volume: 54
Pages: 171-184
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Presentation] A survey of microbial deterioration in archaeological wood excavated from Yenikapi, Istanbul, Turkey2015
Author(s)
Tomoko Wada，Rie Endo, Coskun Kose, Dilek Dogu, Kamile Tirak Hizal, Nural Yilgor, Junji Sugiyama, Kiyohiko Igarashi, S. Nami Kartal
Organizer
International Symposium on Wood Science and Technology 2015
Place of Presentation
Tower Hall Funabori, Tokyo, Japan
Year and Date
2015-03-15 – 2015-03-17
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