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2007 Fiscal Year Annual Research Report

RNA情報発現系の時空間ネットワーク

Research Project

Project/Area Number 13051101
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

中村 義一  The University of Tokyo, 医科学研究所, 教授 (40114590)

KeywordsRNA / ネットワーク / RNA蛋白質複合体 / 高次複合機能 / 分子擬態 / ポストゲノム / ノンコーディングRNA / RNA干渉
Research Abstract

本特定領域研究では、「原子→分子→細胞→個体」と階層的に研究を推進し、それらの連携によって「RNAネットワーク」の全体的かつ有機的な理解を深めることを目的にした。これらの研究成果は、RNA研究にとどまらず、広く生命科学に対する貢献として3つに集約することができる。
・第一の貢献は、構造生物学と機能生物学を連携駆使した研究によって、RNAタンパク質複合体やRNA制御シグナルの動的な作動原理に対する学術的な理解を深めたことである。
・第二の貢献は、micro RNAを始めとするタンパク質をコードしない「小さなRNA」に関して先導的な研究を推進できたことである。ノンコーディングRNA(ncRNA)は本特定領域の開始時には全く想定されていなかった問題だが、ヒトゲノム・プロジェクトの完了によって、ヒトのRNAの98%をも占める機能未知な「RNA新大陸」として浮上した。今後の生命科学の最優先課題といっても過言ではないこの新たな問題に対して、本特定領域はその基盤研究として重要な貢献をすることができた。
・第三の貢献は、本特定領域の研究が、意図するとしないとに係らず、RNAの医工学的な基盤の確立に寄与したことである。
本特定領域は平成18年度をもって終了したが、その活動期間全体を通じた研究成果をとりまとめるに当たって、本特定領域の全班員による最終的な研究成果発表会を兼ねて平成18年12月に国際シンポジウムを開催し、平成19年6月に全班員から提出された研究業績をまとめた領域全体の成果報告書(冊子体)を作成し、本特定領域研究の事後評価ヒアリングの資料として提出した。なお、事後評価においては「A+」と評価され、本プログラムはその目的を十分に達成することができた。

  • Research Products

    (13 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (12 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Inhibition of midkine alleviates experimental autoimmune encephalomyelitis through the expansion of regulatory T cell population.2008

    • Author(s)
      Wang, J, Takeuchi H., Sonobe, Y., Jin, S., Mizuno, T., Miyakawa, S., Fujiwara, M., Nakamura, Y., Kato, T., Muramatsu, H., Muramatsu, T., Suzumura. A.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 105

      Pages: 3915-3920

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Selection of a novel class of RNA-RNA interaction motifs based on the ligase ribozyme with defined modular architecture.2008

    • Author(s)
      Ohuchi, S.P., Ikawa, Y., Nakamura, Y.
    • Journal Title

      Nucl. Acids Res. (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural and molecular basis for hyperspecificity of RNA aptamer to human immunoglobulin G.2008

    • Author(s)
      Miyakawa, S., Nomura, Y., Sakamoto, T., Yamaguchi, Y., Kato, K., Yamazaki, S., Nakamura, Y.
    • Journal Title

      RNA (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A regulatory role of the Rnq1 non-prion domain for prion propagation and polyglutamine aggregates.2008

    • Author(s)
      Kurahashi, H., Ishiwata, M., Shibata, S., Nakamura, Y.
    • Journal Title

      Mol. Cell. Biol. (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RNA aptamers targeting the C-terminal of KRAS oncoprotein generated by an improved SELEX with isothermal RNA amplification2007

    • Author(s)
      Tanaka, Y., Akagi, K., Nakamura, Y., Kozu, T.
    • Journal Title

      Oligonucleotides 17

      Pages: 12-21

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Human and mouse protein non-coding snoRNA host genes with dissimilar nucleotide sequences show chromosomal synteny.2007

    • Author(s)
      Tanaka-Fujita, R., Soeno, Y., Satoh, H., Nakamura, Y., Mori, S.
    • Journal Title

      RNA 13

      Pages: 811-816

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Channel mutations in Hsp104 hexamer distinctively affect thermotolerance and prion-specific propagation.2007

    • Author(s)
      Kurahashi, H., Nakamura, Y.
    • Journal Title

      Mol. Microbiol. 63

      Pages: 1669-1683

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The role of N-terminal domain of translational release factor eRF3 for the control of functionality and stability in S. cerevisiae.2007

    • Author(s)
      Kodama, H., Ito, K., Nakamura, Y.
    • Journal Title

      Genes Cells 12

      Pages: 639-650

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [Journal Article] Translation termination, the prion [PSI^+], and ribosome recycling. In: Sonenberg N, Hershey JWB, Mathews MB, eds.2007

    • Author(s)
      Ehrenberg, M., Hauryliuk V., Crist C.G., Nakamura, Y.
    • Journal Title

      Translational Control in Biology and Medicine. Cold Spring Harbor, New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press.

      Pages: 173-196

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reduced activity or expression of polypeptide release factors induces mRNA cleavage and tmRNA tagging at stop codons in E.coli.2007

    • Author(s)
      Li, X., Yokota, T., Ito, K., Nakamura, Y., Aiba, H.
    • Journal Title

      Mol. Micro. 63

      Pages: 116-126

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A systematic evaluation of the function of the protein-remodeling factor Hsp104 in [PSI^+] prion propagation in S.cerevisiae by comprehensive chromosomal mutations.2007

    • Author(s)
      Takahashi, A., Hara, H., Kurahashi, H., Nakamura, Y.
    • Journal Title

      Prion 1

      Pages: 69-77

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Slight sequence modifications unexpectedly alter the metal dependency of a kissing-loop interaction.2007

    • Author(s)
      Ohuchi, S.P., Nakamura, Y.
    • Journal Title

      Nucl. Acids Symp. 51

      Pages: 395-396

  • [Remarks]

    • URL

      http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/molbiol/index.html

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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