2001 Fiscal Year Annual Research Report
OLETFにおけるNIDDM原因遺伝子のポジショナルキャンディデートクローニング
Project/Area Number |
13204049
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Research Institution | Kyoto University |
Principal Investigator |
山田 宜永 京都大学, 農学研究科, 助教授 (40253207)
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Keywords | OLETF / NIDDM / ポジショナルキャンディデート / クローニング / コンジェニック / QTL / ファインマッピング |
Research Abstract |
○NIDDM遺伝子座におけるコンジェニック系統の作製およびQTLの確証 QTL解析により、OLETFラットにおけるNIDDM発症に関与する原因遺伝子座が14個検出されている。これらのQTLについて、そのQTLゲノム領域のみがOLETF由来ゲノムとなっており、それ以外のバックグラウンドゲノムがF344のレシピエントゲノムとなっているコンジェニック系統をマーカーアシストスピードコンジェニック法により作製した。このコンジェニックをマーカー型タイピングすることにより、QTL解析で得られたゲノムインターバルがOLETF由来の移入ゲノムとなっていることを明らかにした。また、このコンジェニックの血糖値を測定したところ、14個のうち4個のQTL、Nidd1,2,8,10についてのコンジェニックはレシピエントであるF344に比べ高血糖を示し、それらのQTLの存在が確証された。それ以外の10個については、NIDDM QTLとしての確証が得られなかった。しかし、Nidd6はコンジェニック解析により肥満に影響するQTLであることが確証された。 ○Nidd QTLにおける候補遺伝子の解析 Nidd1,2,6,8 QTLのそれぞれの候補遺伝子であるHnf4g, Nkx6a, Pnlip, Pnliprp1,Pnliprp2,Capn10,Neurod遺伝子の解析を行った。Capn10,Neurod遺伝子は当該Nidd QTLのゲノム領域に存在しなかったが、それ以外の候補遺伝子は存在することが判明した。Pnlip, Pnliprp1,Pnliprp2遺伝子では、OLETFにおける変異が検出されなかった。発現レベルについては、Hnf4g, Nkx6a遺伝子ではOLETFとF344との間に差が認められなかったが、Pnlip, Pnliprp1,Pnliprp2遺伝子の予備的解析では差が検出された。 ○Nidd QTLのファインマッピング Nidd2,6 QTLのゲノム領域を限局するためには、コンジェニックとF344との間での戻し交雑群を用いた遺伝的解析が必要となる。この目的のために、(コンジェニック雌×F344雄)F1雌を作製した。また、このQTLゲノム領域に位置する多型マーカーについて検討した。
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Research Products
(7 results)
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[Publications] Tanomura, H.: "Detection of a quantitative trait locus for intramuscular fat accumulation using the OLETF rat"J.Vet.Med.Sci. (in press).
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[Publications] Umezu, Y.: "Detection of rat model useful for genetic analysis of intramuscular fat accumulation"J.Anim.Genet.. 29. 3-10 (2001)
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[Publications] Yamada, T.: "Identification of epistatic interactions involved in non-insulin-dependent diabetes mellitus in the Otsuka Long-Evans Tokushima Fatty rat"Exp.Anim.. 50. 115-123 (2001)
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[Publications] Minami, T.: "Role of Atp7b gene in spontaneous and N-diethylnitrosamine-induced carcinogenesis in a new congenic strain, WKAH.C-Atp7b rats"Jpn.J.Cancer Res.. 92. 841-847 (2001)
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[Publications] Taniguchi, Y.: "Analysis of expressed sequence tags from a cDNA library of somatic nuclear transfer-derived cloned bovine whole fetus"Anim.Genet.. 32. 1-6 (2001)
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[Publications] Minoshima, Y.: "Molecular cloning, expression analysis, promoter characterization, and chromosomal localization of the bovine PREF1 gene"Anim.Genet.. 32. 333-339 (2001)
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[Publications] 動物遺伝育種シンポジウム組織委員会(編集): "動物遺伝育種学事典"株式会社 朝倉書店. 636 (2001)