遺伝子発現プロファイル解析による肝細胞癌診断法の開発

2001 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 13218019
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 油谷 浩幸 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (10202657)
• Keywords: 肝細胞癌 / マイクロアレイ / モノクロナル抗体 / 悪性化 / 肝炎ウイルス / 腫瘍マーカー

Research Abstract

ゲノムレベルにおいて遺伝子発現プロファイルパターンと肝細胞癌の臨床的あるいは病理学的診断との相関を解析することにより、肝細胞癌の診断アルゴリズムの開発を行うことを目指している。さらに肝癌特異的な発現を示す遺伝子の肝発がんにおける役割を検討する。すなわち、6万個の遺伝子についてGeneChipを用いて、肝細胞癌患者の非癌部と癌部組織それぞれから抽出したmRNAについて発現プロファイリング解析をおこない、従来の少数の腫瘍マーカーによる診断ではなく、発現プロファイル解析から多数の遺伝子の発現パターンを用いて癌と健常部との識別、予後因子の評価を行うという新しい診断アルゴリズムの開発を試みた。癌組織と非癌部組織の識別は階層的クラスタリングにより容易に行われたが、組織分化度による分類には関与する因子も多いと考えられ、高分化型と中分化型肝細胞癌の識別についての分類は階層的クラスタリングや主因子分析では困難であった。ノンパラメトリックな分析法であるKruskal-Wallisテストと非階層的クラスタ解析を組み合わせることにより、新たなスコアリングシステムを作成した。高分化型肝細胞癌においても高発現するような遺伝子についてはモノクロナル抗体の作成に着手した。

Research Products

• [Publications] Takahashi M et al.: "Fish oil feeding alters liver gene expressions to defend against PPARalpha activation and ROS prcduction"Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 282(2). 338-348 (2002)
• [Publications] Hippo Y et al.: "Global gene expression analysis of gastric cancer by oligonucleotide microarrays"Cancer Res.. 62(1). 233-240 (2002)
• [Publications] Takabe W et al.: "Anti-atherogenic antioxidants regulate the expression and function of proteasome alpha-type subunits in human endothelial cells"J Biol Chem. 276(44). 40497-40501 (2001)
• [Publications] Saiura A et al.: "A comparison of gene expression in murine cardiac allografts and isografts by means DNA microarray analysis"Transplantation. 72(2). 320-329 (2001)
• [Publications] Akiyoshi S et al.: "Targets of transcriptional regulation by transforming growth factor-beta : expression profile analysis using oligonucleotide arrays"Jpn J Cancer Res. 92(3). 257-268 (2001)