消化器癌進展に関する遺伝子変異のゲノム情報解析

2002 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 13470114
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 油谷 浩幸 東京大学, 国際・産学共同研究センター, 教授 (10202657)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 児玉 龍彦 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (90170266)
• Keywords: マイクロアレイ / 腹膜播種 / WWOX / 肝細胞癌 / ガレクチン / 胃癌

Research Abstract

胃癌及び肝細胞癌について癌進展に関する遺伝子変異のゲノム情報解析を進めた。
胃癌悪性化に伴う遺伝子 胃癌細胞株OCUM-2Mと高播種性転移株OCUM-2MD3をRDA法解析により検出された染色体ホモ欠失領域16q22~23に存在する遺伝子WWOXについてモノクロナル抗体を作製し、蛋白質の挙動について解析した。RNAには異常転写産物が高頻度に認められるものの通常は異常な蛋白質は検出できなかった。細胞及び組織の免疫染色では核及びミトコンドリアに局在することが観察されたが、癌における発現低下は決して認められなかった。また2M-D3株で2Mに対して発現亢進が見られた遺伝子ガレクチン4について、2M細胞に遺伝子導入を行い2M-D3同様に増殖能には変化がないが、浸潤能が亢進することが示された(町田、投稿準備中)。マイクロアレイ解析により、胃癌の形態学的分類やp53遺伝子変異との相関について検討した(筆宝、2002)。
肝細胞癌 最大4万個の遺伝子について肝細胞癌組織の非癌部と癌部組織においての遺伝子発現プロファイリング解析をおこない、癌と健常部との識別、予後因子の評価を行うために階層的クラスタリングや主因子分析、SVM法などのアルゴリズムの開発を進めた。「結節内結節」型の肝細胞癌では脱分化によるがん細胞の悪性化が認められるが、高分化型から中分化型への進展に関与すると思われる遺伝子群を抽出し、RT-PCRによる検証も行った(緑川、2002)。

Research Products

• [Publications] Kano M, Nishimura K, Ishikawa S, Tsutsumi S, Hirota K, Hirose M, Aburatani H: "Expression Imbalance Map : A New Visualization Method for Detection of mRNA Expression Imbalance Regions"Physiol Genomics. Jan 7(epub ahead of print). (2003)
• [Publications] Midorikawa Y, Ishikawa S, Iwanari H, Imamura T, Sakamoto H, Miyazono K, Kodama T, Makuuchi M, Aburatani H: "Glypican-3, overexpressed in hepatocellular carcinoma, modulates FGF2 and BMP-7 signaling"Int J Cancer. 103(4):. 455-465 (2003)
• [Publications] Aburatani H.: "Understanding cancer through gene expression profiling. (review)"International Congress Series. 1246. 261-270 (2002)
• [Publications] Chong JM, Sakuma K, Sudo M, Osawa T, Ohara E, Uozaki H, Shibahara J, Kuroiwa K, Tominaga SI, Hippo Y, Aburatani H, Funata N, Fukayama M: "Interleukin-1 beta Expression in Human Gastric Carcinoma with Epstein-Barr Virus Infection"J. Virol.. 76(13):. 6825-6831 (2002)
• [Publications] Midorikawa Y, Tsutsumi S, Taniguchi H, Ishii M, Kobune Y, Kodama T, Makuuchi M, Aburatani H: "Identification of genes associated with dedifferentiation of hepatocellular carcinoma with expression profiling analysis"Jpn. J. Cancer Res.. 93(6):. 636-643 (2002)
• [Publications] Hippo Y, Taniguchi H, Tsutsumi S, Machida N, Chong JM, Fukayama M, Kodama T, Aburatani H: "Global gene expression analysis of gastric cancer by oligonucleotide microarrays"Cancer Research. 62(1). 233-240 (2002)