ゲノムスクリーニングから獲得されたOPLL候補遺伝子CBFA2の分子遺伝学的解析

2002 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 13470301
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 井ノ上 逸朗 東京大学, 医科学研究所, 客員助教授 (00192500)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 中島 敏晶 東京大学, 医科学研究所, 寄付研究部門教員 (50307956)
• Keywords: 後縦靭帯骨化症 / ゲノム解析 / 罹患同胞対連鎖解析 / 感受性遺伝子

Research Abstract

後縦靱帯骨化症(OPLL)は整形外科領域におけるCommon Diseaseのひとつで、高齢疾患であるにもかかわらず、比較的強い遺伝背景の存在が知られている。我々はゲノム全域での罹患同胞対連鎖解析より、OPLL責任遺伝子座の特定を成功のうちに完了した。(1)140対OPLL罹患同胞対を収集できた、(2)400ケ所のマイクロサテライトによるゲノム全域での連鎖解析により数カ所に連鎖を認めた、(3)最も強い連鎖を21番染色体(21q22)D21S263で認めた(最大Lod=3.4,P=0.000009)。
連鎖を認めた領域20センチモルガンにわたり、その領域の遺伝子すべてのスクリーニングをおこなった。データベース検索により200の遺伝子を認め、その中でSNPがデータベースに登録されていた150遺伝子について検討した。領域600SNPを96名のOPLL患者、96名の非OPLL患者でアソシエーション・スタディをおこなった。膨大な量の遺伝子タイピングは化学発光でシーケンス反応をおこなうことでタイピングできるPYRSEQUENCING法を用いた。1次スクリーニングで有意差を得た74個のSNPsについてサンプル数を増やして解析した。この段階で14 SNPs、7遺伝子で有意差を得た。4つの遺伝子が750kb領域に集中していた。ただし連鎖不平衡解析をおこなったものの、これら遺伝子は独立しており連鎖不平衡ブロックにはなかった。その中で、ひとつの遺伝子について非常に強い有意差を得ることができている。家族歴のある患者群でより強い有意差を得ている(P=0.000003)ので、感受性遺伝子である可能性の高い遺伝子を同定できたといえるだろう。今後、さらに詳細な遺伝学的検討を加え得られた結果を確実にしていくとともに、機能的変化と疾患メカニズムとの関連について検討を加えていきたい。

Research Products

• [Publications] Onda, H.: "Endoglin is not a major susceptibility gene for intracranial aneurysm among Japanese"Stroke. (in press). (2003)
• [Publications] Shimo-onoda, K.: "Akaike's information criterion for an alternative measure of linkage disequilibrium"J Hum Genet. 47. 649-655 (2002)
• [Publications] Maeda, S.: "Sortilin is up-regulated during osteoblastic differentiation of mesenchymal stem cells and promotes extracellular matrix mineralization"J Cell Pysiol. 193. 73-79 (2002)
• [Publications] Nakajima, T.: "Molecular cloning and functional analysis of a factor that binds to the proximal promoter of human angiotensinogen"J. Hum. Genet.. 47. 7-13 (2002)
• [Publications] Furushima, K.: "Large scale screening for candidate genes of ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine"J. Bone Miner. Res.. 17. 128-137 (2002)