ハロバクテリアの走光性レセプターフォボロドプシンの生物物理化学的研究

2002 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 13470475
• Research Institution: Hokkaido University
• Principal Investigator: 加茂 直樹 北海道大学, 大学院・薬学研究科, 教授 (10001976)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 鷲見 正人 北海道大学, 大学院・薬学研究科, 助手 (30281819) ; 奈良 敏文 北海道大学, 大学院・薬学研究科, 助手 (30241350) ; 宮内 正二 北海道大学, 大学院・薬学研究科, 助教授 (30202352)
• Keywords: 高度好塩菌 / Halobacterium halobium / フォボロドプシン / ファラオニスフォボロドプシン / 走光性 / レチナール / 膜タンパク構造維持 / 呼吸波長

Research Abstract

フォボロドプシン(pR)は高度好塩菌の負の走光性のレセプターである.ファラオニスフォボロドプシン(ppR)は高度好塩好アルカリ性菌に存在するpRに相当するレセプターである.ppRはpRよりも安定であり,また我々によって開発された大腸菌膜に機能を持った形で発現する方法があるので,研究に有利であり,ppRを研究材料に用いている.pRおよびppRは膜中でトランスジューサタンパクと相互作用しており,これらのセンサーが受けた情報はトランスジューサを介して細胞内に伝達される.今年度は次の点を明らかにした.
1)ppRは他の高度好塩菌のレチナールタンパクに比べて,吸収極大が約70nm短波長にある.この吸収波長の違いの原因を探るべく,レチナールの周りのアミノ酸残基を,長波長に吸収を持ち,非常によく研究されているバクテリオロドプシンのものに全て変換した変異体を作成したが,吸収極大の長波長への波長シフトは,約40%程度しか起こらかった.FTIRの測定より,シッフ塩基の水素結合の強さは,この置換によって不変であり,アミノ酸の置換のみでは波長制御はなされていない.
2)トランスジューサとの結合において,ppRのTry199が重要であることを明らかにした.
3)ppRのASP193の解離が,このタンパクの構造維持に重要であることを明らかにした.

Research Products

• [Publications] Johann P.Klare et al.: "Probing the Proton Channel and the Retinal Binding Site of Natronobacterium pharaonis Sensory Rhodopsin II"Biophys. J.. 82. 2156-2164 (2002)
• [Publications] Kazumi Shimono et al.: "A pharaonis phoborhodopsin mutant with the same retinal binding site residues as in bacteriorhodopsin"Biochemistry. 41. 6504-6509 (2002)
• [Publications] Yuki Sudo et al.: "Try-199 and charged residues of pharaonis phoborhodopsin are important for the interaction with its transducer"Biophys. J.. 83. 427-432 (2002)
• [Publications] Masayuki Iwamoto et al.: "Role of Aspl93 in chromophore-protein interaction of pharaonis phoborhodopsin (sensory rhodopsin II)"Biophys. J.. 83. 1130-1135 (2002)
• [Publications] Yuki Sudo: "Association between a photo-intermediate of D75N of pharaonis phoborhodopsin and its cognate transducer"J. Photochem. Photobiol.. 67. 171-176 (2002)
• [Publications] Masayuki Iwamoto et al.: "Illumination accelerates the decay of the O-intermediate of pharaonis phoborhodopsin (sensory rhodopsin)"Photochem. Photobiol. 76. 462-466 (2002)