2001 Fiscal Year Annual Research Report
酵母アッセイによる遺伝子型決定に基づく神経膠腫専用個性診断DNAアレイの開発
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13557111
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
多田 光宏 北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 助教授 (10241316)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
濱田 淳一 北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 助教授 (50192703)
守内 哲也 北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 教授 (20174394)
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| Keywords | yeast assay / transcriptional factor / nution / genetic disease |
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| Research Abstract |
神経膠腫の個性診断のための低コストアレイを作製し、個々の遺伝子診断に代替する診断方法を確立することを目標とする.このため本年度は
1.任意の遺伝子のストップコドン型変異の有無について迅速な遺伝子診断が可能な酵母Universal Stop Codon Assayを開発、それの誌上発表を行った(Am J Pathol).
2.1300遺伝子を厳選し、それをナイロンフィルター上に高密度スポットした、独自のアレイを開発、119種の癌細胞株のRNAサンプルにてそのアレイによる遺伝子発現プロフィールを検討し、良好な成績を得た。
3.U251MG,SF268,SF295,SF539,SNB-75,SNB-78の6種の神経膠腫細胞株において、p53,APC,PTEN遺伝子変異の有無を検討するとともに、上記DNAアレイにて遺伝子発現プロフィールを解析し,発現が他の癌細胞株と比べ、特異な上昇または下降を示す遺伝子385種を排出した。
4.脳腫瘍を中心とする各種癌においてp53変異の化学療法感受性、放射線感受性におよぼす影響を検討、さらにdominant negative変異の意義を検討し誌上発表を行った。
これらの結果から、設計作成されたDNAアレイは本研究計画遂行上、申し分ない特性を備えていることが明らかになった。
次年度はこれらの結果をふまえ、検討する脳腫瘍細胞株の数を増やし、またそこから得られた結果をDNAアレイ改良に役立てる予定である。
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[Publications] Tada M.: "Inactivale the remaining p53 allele or the altemate p73?-Preferential selection of the Arg72 polymorphism in cancers with recessive p53 mutants but not transdominant mutants"Carcinogenesis. 22. 515-517 (2001)
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[Publications] Tsuiki H.: "Mechanism of hyperploid cell formation induced by microtubule inhibiting drug in gliomacell lines"Oncogene. 20. 420-429 (2001)
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[Publications] Ikeda J.: "Restoration of endogenous wild type p53 activity in a glioblastoma cell line with intrinsic temperature-sensitive p53 induces growth anest but not apoptosis"Int J Cancer. 94. 35-43 (2001)
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[Publications] Kataoka A.: "Development of a yeast stop codon assay readily and generally applicable to human genes"Am J Pathol. 159. 1239-1245 (2001)
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[Publications] Hamada J.: "Increased oxidative DNA damage in mammary tumor cells by continuous epidermal"J Natl Cancer Inst. 93. 214-219 (2001)
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[Publications] 多田光宏: "Transdominance assay(技術講座)"細胞. 34. 77-81 (2002)
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[Publications] 多田光宏: "脳神経外科医に必要な分子生物学"三輪書店,東京(分担). 86-99 (2001)
