2002 Fiscal Year Annual Research Report
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13780522
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| Research Institution | National Institute of Advanced Industrial Science and Technology |
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Principal Investigator |
新井 宗仁 独立行政法人産業技術総合研究所, 生物機能工学研究部門, 研究員 (90302801)
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| Keywords | 蛋白質 / フォールディング / モルテン・グロビュール状態 / 反応速度論 / 遷移状態 / 構造 / 蛋白質工学 |
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| Research Abstract |
昨年度に引き続き、α-ラクトアルブミン(α-LA)のフォールディング反応における遷移状態の構造特徴づけを、Φ値解析法を用いて行った。今年度は特に、α-LAのβドメインやCヘリックス周辺に変異を導入した一アミノ酸置換体を多数作成し、α-LAの遷移状態の構造解析を行った。平衡条件下でのアンフォールディング測定の結果、変異体はどれも野生型より不安定化しており、Φ値解析に有効な試料であった。次に、ストップトフロー円二色性スペクトル法を用いてこれらの変異体の巻き戻り反応とアンフォールディング反応を測定し、Φ値を計算した結果、I89A, I89V, I55VについてはΦ=0.4〜0.6程度であったが、W60A, K93A, L96Aについては、Φ〜0となった。これらの結果は、I89, I55の周りは遷移状態において側鎖の密なパッキングが部分的に形成されているが、W60,K93,L96周辺は、遷移状態では側鎖の秩序化はまだ起きていないことを示している。
この2年間の研究結果を総合すると、α-LAの遷移状態の構造について次のような知見が得られた。(1)αドメイン内の側鎖は、天然状態様の密なパッキングをまだ形成していないが、(2)αドメインとβドメインの間、および、カルシウム結合部位近傍では、側鎖の密なパッキングが部分的に形成されている。ここで、モルテン・グロビュール(MG)状態においては、2つのドメイン間にあるCヘリックスが比較的安定なヘリックス構造を形成していることを考慮に入れると、α-LAのフォールディング反応は、MG中間体で形成され始めた構造が遷移状態に進むにつれて更に構造化していくという階層的な反応で記述できると結論づけることができる。
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Research Products
(9 results)
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[Publications] 新井 宗仁: "Fast Compaction of α-lactalbumin During Folding Studied by Stopped-Flow X-ray Scattering"Journal of Molecular Biology. 321(1). 121-132 (2002)
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[Publications] 桑島 邦博: "Two views of protein folding : what is the universal view?"蛋白質・核酸・酵素. 47(6). 657-662 (2002)
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[Publications] 桑島 邦博: "The use of the time-resolved X-ray solution scattering for studies of globular proteins"Spectroscopy. 16(3-4). 127-138 (2002)
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[Publications] 伊野部 智由: "Equilibrium and Kinetics of the Allosteric Transition of GroEL Studied by Solution X-ray Scattering and Fluorescence Spectroscopy"Journal of Molecular Biology. 327(1). 182-191 (2003)
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[Publications] 新井 宗仁: "Denaturation and Reassembly of Chaperonin GroEL Studied by Solution X-ray Scattering"Protein Science. 12(4). 672-680 (2003)
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[Publications] 新井 宗仁: "Testing the Relationship between Foldability and the Early Folding Events of Dihydrofolate Reductase from Escherichia coli"Journal of Molecular Biology. 328(1). 273-288 (2003)
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[Publications] 新井 宗仁: "Effects of the Difference in the Unfolded-State Ensemble on the Folding of Escherichia coli Dihydrofolate Reductase"Journal of Molecular Biology. (発表予定). (2003)
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[Publications] 伊野部 智由: "The Allosteric Transition of GroEL induced by Metal Fluoride-ADP Complexes"Journal of Molecular Biology. (発表予定). (2003)
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[Publications] 田之倉 優: "物理生化学"医学出版. 785 (2003)
