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2014 Fiscal Year Annual Research Report

PPRタンパク質ネットワークを基盤とした植物オルガネラのRNA編集装置の解明

Research Project

Project/Area Number 13J03052
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

一瀬 瑞穂  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Keywordsミトコンドリア / 葉緑体 / RNA編集 / PPRタンパク質 / ヒメツリガネゴケ
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、基部陸上植物であるヒメツリガネゴケを用いて、植物オルガネラの新規RNA編集因子およびRNA編集酵素を同定することを目的に行った。これらの成果により、RNA編集の分子機構の解明につながることが期待される。
1. オルガネラ部位特異的RNA編集因子の同定
ヒメツリガネゴケの葉緑体RNA編集因子を同定するために、編集因子と予想される葉緑体局在型のDYWドメインを持つpentatricopeptide repeatタンパク質(PpPPR_45)をコードする遺伝子の発現抑制株および過剰発現株を作製して解析した。その結果、PpPPR_45が葉緑体rps14 mRNAのRNA編集に働くRNA編集因子であることを明らかにし、論文発表した(Ichinose et al. FEBS Letters 2014)。これにより、ヒメツリガネゴケに存在する全12カ所のRNA編集部位にそれぞれ作用する9種のRNA編集因子が同定され、研究目標の一つである「新規オルガネラRNA編集因子の同定」を達成することができた。
2. オルガネラRNA編集におけるDYWドメインの機能領域の同定
RNA編集反応はシチジン(C)が脱アミノ化によりウリジン(U)に変換されることから、RNA編集酵素はシチジンデアミナーゼ活性を持つことが予想される。これまでにヒメツリガネゴケで同定されたRNA編集因子は全てDYWドメインを持つが、DYWドメインに保存されたシチジンデアミナーゼ活性部位の類似アミノ酸残基がRNA編集に必須であることを昨年度明らかにしている。今年度は新たにDYWドメインがRNA編集部位特異的に作用することを明らかにし、RNA編集因子のDYWドメインがRNA編集酵素活性と編集部位認識の両方を担っている可能性が示唆された。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Identification of a pentatricopeptide repeat RNA editing factor in Physcomitrella patens chloroplasts2014

    • Author(s)
      Mizuho Ichinose, Masato Uchida, Mamoru Sugita
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 588 Pages: 4060-4064

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2014.09.031

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 植物オルガネラRNA編集におけるDYWドメインの機能解析2015

    • Author(s)
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学世田谷キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-17
  • [Presentation] パーティクルガンを用いたトランジェントアッセイによるヒメツリガネゴケの生物時計遺伝子の発現解析2015

    • Author(s)
      龍 昌志、一瀬瑞穂、樋口 海杜、杉田 護、青木摂之
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学世田谷キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-16
  • [Presentation] ヒメツリガネゴケのP-type PPRタンパク質の機能解析(2)2015

    • Author(s)
      後藤誠也、一瀬瑞穂、加藤歩美、杉田千恵子、杉田 護
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学世田谷キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-16
  • [Presentation] 植物オルガネラのPPRタンパク質とRNA編集2015

    • Author(s)
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • Organizer
      第17回オルガネラワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-15
    • Invited
  • [Presentation] RNA編集におけるPPRタンパク質のDYWドメインの役割2015

    • Author(s)
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • Organizer
      第4回植物RNA研究者ネットワークシンポジウム
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2015-01-19
    • Invited
  • [Presentation] オルガネラRNA編集におけるDYWドメインの役割2014

    • Author(s)
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-13
  • [Presentation] ヒメツリガネゴケのRNAスプライシングに働く新規PLS-type PPRタンパク質の同定2014

    • Author(s)
      川口康弘、一瀬瑞穂、中島健策、杉田千恵子、杉田 護
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-13
  • [Presentation] ヒメツリガネゴケの遺伝子ターゲティングによるPPR遺伝子ファミリーの機能解析2014

    • Author(s)
      一瀬瑞穂、杉田 護
    • Organizer
      日本蘚苔類学会第43回大会
    • Place of Presentation
      青森県十和田市大字奥瀬字栃久保231星野リゾート奥入瀬渓流ホテル
    • Year and Date
      2014-08-27
  • [Remarks] 名古屋大学理学部生命理学科 論文紹介

    • URL

      http://www.bio.nagoya-u.ac.jp/paper/index.html

URL: 

Published: 2016-06-01  

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