2002 Fiscal Year Annual Research Report

RNAエディティングによる遺伝情報の変換システム―葉緑体ゲノムでの網羅的解析

Research Project

Project/Area Number	14011101
Research Institution	Nagoya City University
Principal Investigator	杉浦昌弘名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 教授 (80027044)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	小保方潤一名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助教授 (50185667) 櫻井宣彦名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 講師 (00255233)
Keywords	RNAエディティング / タバコ / 葉緑体 / エンドウ / in vitro系 / mRNA / シス配列 / トランス因子
Research Abstract	葉緑体はその発生プログラムにより原色素体(種子)からエチオプラスト(芽生え)、葉緑体(葉)、クロモプラスト(果実)などへと形態的・機能的に大きく変化する。高等植物の葉緑体ゲノムからの転写産物は、RNAエディティング(C→U)によりDNAの一次情報が一部変換するため、ゲノム情報の正確な解読にはRNAエディティングの網羅的知見が必須である。 1)RNAエディティング部位の網羅的同定組織的なRNAエディティング部位の探索のため、タンパク質コード領域を集中して調べる必要がある。新たに2ヶ所の部位を発見した。従って,タバコでは合計34ヶ所のエディティング部位を同定した。ついで、エンドウ葉緑体でもタンパク質コード領域の調査を開始し、21ヶ所の部位を同定した。 2)RNAエディティングのシス配列とトランス因子の同定タバコ単離葉緑体より開発したin vitro RNAエディティング系を更に改良し、タバコ葉緑体psbE RNAとpetB RNAのシス配列をエディティング部位上流-20から-6と同定し、psbEのトランス因子は56kDaタンパク質と同定し,petBのものは70kDaタンパク質と同定した。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] Miyamoto, T.: "Recognition of RNA editing sites is directed by unique proteins in chloroplasts"Mol. Cell. Biol.. 22. 6726-6734 (2002)
[Publications] Hasegawa, K.: "Organization and transcription of the gene family encoding chlorophyll a/b-binding proteins in Nicotiana sylvestris"Gene. 289. 161-168 (2002)
[Publications] Mathieu, O.: "5S rRNA genes expression is not inhibited by DNA methylation in Arabidopsis"Plant Journal. 29. 313-323 (2002)
[Publications] Hasegawa, K.: "In vitro analysis of transcription initiation and termination from the Lhcb1 gene family in Nicotiana sylvestris"Plant Journal. 33. 1063-1072 (2003)
[Publications] Sasaki, T.: "Identification of RNA editing sites in chloroplasts transcripts from the maternal and paternal progenitors of tobacco (Nicotiana tabacum)"Mol. Biol. Evol.. (2003)
[Publications] Plader, W.: "The Shine-Dalgarno-like sequence is a negative regulatory element for translation of tobacco chloroplast rps2 mRNA"Plant Journal. (2003)
[Publications] 杉浦昌弘: "生体の科学第53巻(2号)p124-130「RNAエディティングに関与するタンパク-クロロプラストの例」"医学書院. (2002)

2002 Fiscal Year Annual Research Report

RNAエディティングによる遺伝情報の変換システム―葉緑体ゲノムでの網羅的解析

Principal Investigator

杉浦 昌弘 名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 教授 (80027044)

Research Products

[Publications] Miyamoto, T.: "Recognition of RNA editing sites is directed by unique proteins in chloroplasts"Mol. Cell. Biol.. 22. 6726-6734 (2002)

[Publications] Hasegawa, K.: "Organization and transcription of the gene family encoding chlorophyll a/b-binding proteins in Nicotiana sylvestris"Gene. 289. 161-168 (2002)

[Publications] Mathieu, O.: "5S rRNA genes expression is not inhibited by DNA methylation in Arabidopsis"Plant Journal. 29. 313-323 (2002)

[Publications] Hasegawa, K.: "In vitro analysis of transcription initiation and termination from the Lhcb1 gene family in Nicotiana sylvestris"Plant Journal. 33. 1063-1072 (2003)

[Publications] Sasaki, T.: "Identification of RNA editing sites in chloroplasts transcripts from the maternal and paternal progenitors of tobacco (Nicotiana tabacum)"Mol. Biol. Evol.. (2003)

[Publications] Plader, W.: "The Shine-Dalgarno-like sequence is a negative regulatory element for translation of tobacco chloroplast rps2 mRNA"Plant Journal. (2003)

[Publications] 杉浦昌弘: "生体の科学 第53巻(2号)p124-130「RNAエディティングに関与するタンパク-クロロプラストの例」"医学書院. (2002)

杉浦昌弘名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 教授 (80027044)

[Publications] 杉浦昌弘: "生体の科学第53巻(2号)p124-130「RNAエディティングに関与するタンパク-クロロプラストの例」"医学書院. (2002)