2003 Fiscal Year Annual Research Report

"プロトンブロック法"によるDNA・RNAの究極新合成法の開拓

Research Project

Project/Area Number	14208074
Research Institution	TOKYO INSTITUTE OF TECHNOLOGY
Principal Investigator	関根光雄東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (40111679)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	清尾康志東京工業大学, フロンティア創造共同研究センター, 助教授 (20313356)
Keywords	塩基部無保護DNAの化学合成 / 活性ホスファイト法 / 修飾DDNA / 遺伝子診断 / 遺伝子治療 / DNAチップ / プロトンブロック法 / アンチジーン法
Research Abstract	本研究は、分子生物学や、医学・薬学の分野はもとより、核酸を分子工学的素材として活用する新世代の機能性核酸の研究の飛躍的な発展に不可欠な、従来の合成法を凌駕する画期的なDNA・RNAの化学合成法を開拓する基礎研究をおこなうことを目的に開始したものである。現在用いられているDNAやRNAの化学合成法は、単純な未修飾のDNAやRNAを合成するために開発されたものであり、tRNAやrRNAのように複雑な修飾塩基を含むRNAの合成には応用できないのが現状であったが、本研究ではこの現状を打開するために全く新しいコンセプトを提案し、実際に極めて将来有望と思われるDNAの化学合成法を2つ開拓することができた。ひとつはプロトンブロック法と呼ばれる合成法であり、もうひとつは活性ホスファイト法と名付けたものである。とくに、後者の方法はキャップ化反応も省きながらDNA20量体の合成を達成したものであり、これまでの常識を覆す画期的な研究成果である。ピリミジンオリゴヌクレオチドに関しては、さらに長鎖なものも合成可能と思われるので、本法はアンチジーン法への展開も期待される。プリンオリゴヌクレオチド合成に関しては、グアノシンの縮合効率の改善とアデニン塩基部位への副反応の回避がこれからの新しい課題となった。これらの問題点はグアノシンの場合には5'水酸基の保護基の脂溶化、後者の場合にはアルコール系活性化剤の開拓によって解決できる目処がたっている。今後は、この基礎研究をもとに数多くの応用を手がけ、この合成法を多種多様なハイスループット型遺伝子診断技術に効率よく活用していく予定である。

Research Products
(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] Mitsuo Sekine: "A "Proton-Block" Strategy in the Phosphoramidite Approach : A New N-Unprotected Method for the Synthesis of Oligodeoxynucleotides Based on the Principle of Simple Acid-Base Reactions"J.Org.Chem.. 68. 5478-5492 (2003)
[Publications] Mitsuo Sekine: "Synthesis of TMG-capped RNA-DNA chimeric oligonucleotides"Tetrahedron Letters. 44. 1703-1707 (2003)
[Publications] Tomohisa Moriguchi: "Synthesis and Properties of Oligodeoxynucleotides Having an N-Phosphoryl Group"Eur.J.Org.Chem.. 2260-2267 (2003)
[Publications] Itaru Okamoto: "A New Route to 2'-O-Alkyl-2-thiouridine Derivatives via 4-O-Protection of the Uracil Base and Hvbridization Properties of Oligonucleotides Incorporating These Modified Nucleoside Derivatives"J.Org.Chem.. 68. 9971-9982 (2003)
[Publications] Mitsuo Sekine: "Synthesis of Chemically Stabilized Phosmidosine Analogs and the Structure-Activity Relationship of Phosmidosine"J.Org.Chem.. 69. 314-326 (2004)
[Publications] Akihiro Ohkubo: "A New Strategy for the Synthesis of Oligodeoxynucleotides Directed toward Perfect O-Selective Internucleotidic Bond Formation without Base Protection"Tetrahedron Letters. 45. 979-982 (2004)
[Publications] 関根光雄: "ゲノムケミストリー"講談社サイエンティフィック. 240 (2003)

2003 Fiscal Year Annual Research Report

"プロトンブロック法"によるDNA・RNAの究極新合成法の開拓

Principal Investigator

関根 光雄 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (40111679)

Research Products

[Publications] Mitsuo Sekine: "A "Proton-Block" Strategy in the Phosphoramidite Approach : A New N-Unprotected Method for the Synthesis of Oligodeoxynucleotides Based on the Principle of Simple Acid-Base Reactions"J.Org.Chem.. 68. 5478-5492 (2003)

[Publications] Mitsuo Sekine: "Synthesis of TMG-capped RNA-DNA chimeric oligonucleotides"Tetrahedron Letters. 44. 1703-1707 (2003)

[Publications] Tomohisa Moriguchi: "Synthesis and Properties of Oligodeoxynucleotides Having an N-Phosphoryl Group"Eur.J.Org.Chem.. 2260-2267 (2003)

[Publications] Itaru Okamoto: "A New Route to 2'-O-Alkyl-2-thiouridine Derivatives via 4-O-Protection of the Uracil Base and Hvbridization Properties of Oligonucleotides Incorporating These Modified Nucleoside Derivatives"J.Org.Chem.. 68. 9971-9982 (2003)

[Publications] Mitsuo Sekine: "Synthesis of Chemically Stabilized Phosmidosine Analogs and the Structure-Activity Relationship of Phosmidosine"J.Org.Chem.. 69. 314-326 (2004)

[Publications] Akihiro Ohkubo: "A New Strategy for the Synthesis of Oligodeoxynucleotides Directed toward Perfect O-Selective Internucleotidic Bond Formation without Base Protection"Tetrahedron Letters. 45. 979-982 (2004)

[Publications] 関根光雄: "ゲノムケミストリー"講談社サイエンティフィック. 240 (2003)

関根光雄東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (40111679)