骨髄異形成症候群におけるt(1;7)転座およびde1(7q)のゲノム解析

2002 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 14570962
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 小川 誠司 東京大学, 医学部附属病院, 客員助教授 (60292900)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 半下石 明 東京大学, 医学部附属病院, 助手 (20344450) ; 黒川 峰夫 東京大学, 医学部附属病院, 助手 (80312320) ; 千葉 滋 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (60212049) ; 神田 善伸 東京大学, 医学部附属病院, 助手 (30334379) ; 青木 克己 東京大学, 医学部附属病院, 助手 (40291322)
• Keywords: der(1;7)(q10;p10) / del(7q) / メチル化解析 / 骨髄異形成症候群 / 欠失解析 / アルフォイド配列 / CpGアイランド

Research Abstract

不均衡転座der(1;7)(q10;P10)およびdel(7q)は骨髄異形成症候群(MDS)にしぱしば観察される予後不良の染色体異常である。これまでの解析から、der(1;7)は1番7番両染色体のアルフォイドDNA配列間の組みかえによって引き起こされ、その結果生ずる+1qないし7q-がMDSの病態に関与する可能性が示唆された(投稿中)。そこで、本申請の研究では7qの欠失に関してその欠失の責任遺伝子の探索を行った。探索の方法としては、従来の欠失解析に加えて、CpGアイランドのメチル化による遺伝子の不活化の可能性を考慮して、7qの全域にわたるCpGアイランドのメチル化の検討を行った。まず、ヒトゲノム計画で公開されている7qのDNA配列からCpGアイランドの定義をみたす約300個の配列を同定し、Alu配列などの繰り返し配列を除く130個のCpGアイランドを解析の対象とした。50種類の腫瘍細胞および6種類の正常検体から抽出したゲノムDNAをbisulfite処理したのち、各CpGアイランドのPCR増幅産物を直接シークェンスすることにより、CpGのメチル化を定量的に同定した。解析の結果、検討した7qの領域について、(1)正常細胞ではCpGアイランドのメチル化はほとんど認められないのに対し、腫瘍細胞株では多数のメチル化領域が同定されること、また(2)メチル化の領域はしばしば7q上クラスターをなして存在していること、(3)患者由来の腫瘍検体ではメチル化は正常細胞と腫瘍細胞の中間の程度・分布を示すこと、(4)これらの分布は7qの欠失マップにおける欠失の分布とよく挿管すること、が明らかとなり、MDSの病態に7qのメチル化が関与している可能性が示唆された。現在、メチル化と遺伝子発現の関連の詳細な解析を行うとともにメチル化の集積領域からの標的遺伝子の探索を行っている。

Research Products

• [Publications] Oiao Y, Ogawa S, et al.: "Identification of a Novel Fusion Gene, TTL, Fused to ETV6 in Acute Lymphoblastic Leukemia with t(12;13)(p13;q14), And Its Implication in Leukemogenesis"Leukemia. (in press).
• [Publications] Ogawa S, flangaishi A, Hirai, H: "Identification of candidate tumor suppressor genes from critical deletions of long arm of chromosome 6 in hematopoietic neoplasm"International Congress Series. 1246. 251-260 (2002)
• [Publications] Hangaishi A, Ogawa S, et al.: "Mutations of Chk2 in primary hematopoietic neoplasms"Blood. 99. 3075-3077 (2002)
• [Publications] Suzuki T, Nakamoto T, Ogawa S, et al.: "MICAL, a novel CasL interacting molecule, associates with vimentin"Journal of Biological Chemistry. 277. 14933-14941 (2002)
• [Publications] Saito A, Ogawa S, et al.: "Establishment of a quantitative method for detecting mixed chimerism using fluorescence-based PCR amplification of short tandem repeat markers after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation in a Japanese population"Japanese Journal of Clinical Hematology. 43. 327-332 (2002)