慢性関節リウマチ疾患遺伝子DR3の重複及びゲノムインプリンティングの可能性

2003 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 14657117
• Research Institution: Kobe University
• Principal Investigator: 大澤 佳代 神戸大学, 医学部, 助手 (50324942)
• Keywords: 関節リウマチ(RA) / 遺伝子重複 / FISH(fluorescence in situ hybridization)法 / DR(death receptor 3) / ゲノムインプリンティング / メチル化

Research Abstract

関節リウマチについて当研究室が同定した第1染色体に座位する遺伝子Death receptor 3(DR3)に対して次の研究を行った。
BLASTNによる遺伝子重複の検索:DR3遺伝子に関してNCBI、Sanger、DDBJ等のデータバンクを用いて行った遺伝子重複の検索において、重複の事実は認められなかった。FISH(fluorescence in situ hybridization)法を用いたマッピング:DR3遺伝子を含むクローンと近傍にあるクローンを用いてmappingを行ったところ、DR3遺伝子にのみ遺伝子重複が観察された。この遺伝子重複を確認したところ、RA患者においては特に遺伝子変異のみられたRA患者に遺伝子重複が多く認められた。
Fiber-FISH法を用いたマッピング:Fiber-FISH法によるマッピングにより、FISH法で示されたDR3遺伝子の遺伝子重複がセントロメア側の約200-300kbの位置にあることが示された。定量PCR法による遺伝子重複とSNPsの関係:SNPsに特異的なプライマーを用いて遺伝子重複とSNPsの関係を調べた。変異率の計算より、SNPsにおける遺伝子重複の確認ができた。
ゲノムインプリンティングの可能性について:DR3遺伝子のプロモーター領域のメチル化の有無を確認した。プロモーター領域の一部ではアレル特異的なメチル化が認められた。また、RA患者における滑膜細胞では、末梢血リンパ球には認められなかったプロモーター領域のメチル化が起こっていた。
学会発表:本研究の内容は第25回及び第26回日本分子生物学会年会にて発表した。
今後の展望:遺伝子重複に関しては論文投稿中であり、ゲノムインプリンティングについてはさらなる症例での確認、および転写開始点等の検索を行っている。

Research Products

• [Publications] 大澤 佳代: "第1染色体上RA疾患感受性遺伝子のDR#のduplication(遺伝子重複)に関する研究"リウマチ. 42・2. 363 (2002)
• [Publications] 高見 希: "RAの疾患遺伝子DR3の定量PCR法によるSNPs解析"リウマチ. 43・2. 266 (2003)
• [Publications] 大澤 佳代: "関節リウマチ(RA)の疾患遺伝子DR3の遺伝子重複とSNPsについて"リウマチ. 43・2. 266 (2003)
• [Publications] Kayo Osawa: "Evidence for gene duplication in a small chromosome region Ip36 containing death receptor 3 (DR3) gene : increased frequency of Gene…"Arthritis & Rheumatism. 47・9(suppple). S6778 (2003)
• [Publications] Nozomi Takami: "Evidence for gene duplication in the death receptor 3 (DR3) gene that shows genetic association with Rheumatoid arthritis."Arthritis & Rheumatism. 47・9(suppple). S142 (2003)