2003 Fiscal Year Annual Research Report

ゲノム機能の調節を指向した機能性ペプチド核酸の開発

Research Project

Project/Area Number	15011227
Research Institution	Kyoto University
Principal Investigator	岡本晃充京都大学, 工学研究科, 助手 (60314233)
Keywords	ペプチド核酸 / ゲノム機能 / 修飾核酸塩基 / オリゴヌクレオチド / メチルシトシン / 蛍光 / 一塩基多型
Research Abstract	核酸に特徴的な糖-リン酸骨格をポリペプチド骨格に置き換えたペプチド核酸(PNA)は、二重らせん構造を有するDNAを我々が望む塩基配列のみで一本鎖状態にし、そこへ強く結合して新たなPNA-DNA二重らせん構造を与える。PNAが持つ極めて高い二本鎖DNAに対する塩基配列認識能に着目し、さらにここに有機合成化学的手法を用いて機能を付加することにより、効率的かつ体系的な遺伝子発現情報の解析、遺伝子多型の解析の新たな手段を開発することを目指した。また、機能性PNAを用いて、疾患の予防や治療に向けた新たな分子システムを設計し、提案することを目指した。 1)塩基特異的蛍光発光機能を含む人工核酸による簡便な一塩基多型検出法新たな機能性人工核酸として塩基識別型蛍光性核酸塩基を含むDNAプローブ(BDFプローブ)を初めて合成した。BDFプローブは、紫外光を照射しても蛍光を生じないが、相補的DNAと二重らせんを形成するとその蛍光が顕著に強くなる。一方、ミスマッチ塩基対が存在すると、その蛍光強度はわずかになった。BDFプローブを遺伝子中の一塩基多型検出にも適用し、成功を収めた。 2)核酸配列特異的シトシンメチル化判定法の開発 PNAが二本鎖DNAに効果的に割り込むという性質を利用し、メチル化の有無を判定したい遺伝子配列を二本鎖からはじき出し制限酵素で処理することによってメチル化の有無を判定することができた。従来のbisulfite処理法や単なる制限酵素処理と比べて、正確かつ配列選択的であり、また比較的微量のサンプルに対しても応答が増幅されるため、これまでにない極めて効果的かつ正確な配列選択的メチル化法である。我々が開発した方法では、メチル化を蛍光発光で検出することができ大変有用であると思われる。この研究で開発された手法は、シトシンメチル化の判定のみならず、選択的な遺伝子機能の改変など他に利用可能であると考えられる。私は、以上のように、ゲノム機能の調節を指向した機能性PNAの開発研究において、人工核酸を利用した種々の配列特異的核酸塩基検出法を見いだすことができた。いずれの成果も高い実用性が期待され、本科学研究費は、大変有効に役立てることができたと考えている。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] Okamoto, A., Kanatani, K., Taiji, T., Saito I.: "^<15>N-NMR Study on Site-Selective Binding of Metal Ions to Guanine Runs in DNA : A Good Correlation with HOMO Distribution"Journal of the American Chemical Society. 125・5. 1172-1173 (2003)
[Publications] Okamoto, A., Tainaka, K., Saito, I.: "Clear Distinction of Purine Bases on the Complementary Strand by a Fluorescence Change of a Novel Fluorescent Nucleoside"Journal of the American Chemical Society. 125・17. 4972-4973 (2003)
[Publications] Okamoto, A., Tainaka, K., Saito, I.: "Rational Design of a DNA Wire Possessing an Extremely High Hole Transport Ability"Journal of the American Chemical Society. 125・17. 5066-5071 (2003)
[Publications] Okamoto, A., Tanabe, K., Inasaki, T., Saito, I.: "Phototriggered Drug Release from Functionalized Oligonucleotides by a Molecular Beacon Strategy"Angewandte Chemie, Internal Edition. 42・22. 2502-2504 (2003)
[Publications] Okamoto, A., Tanabe, K., Fukuta, T., Saito, I.: "Design of Base-discriminating Fluorescent Nucleoside and its Application to T/C SNP Typing"Journal of the American Chemical Society. 125・31. 9296-9297 (2003)
[Publications] Okamoto, A., Tanaka, K., Saito, I.: "A nucleobase that releases reporter tags upon DNA oxidation"Journal of the American Chemical Society. 126・2. 416-417 (2004)
[Publications] 岡本晃充, 斉藤烈: "ゲノムケミストリー"講談社サイエンティフィク. 240 (2003)

2003 Fiscal Year Annual Research Report

ゲノム機能の調節を指向した機能性ペプチド核酸の開発

Principal Investigator

岡本 晃充 京都大学, 工学研究科, 助手 (60314233)

Research Products

[Publications] Okamoto, A., Kanatani, K., Taiji, T., Saito I.: "^<15>N-NMR Study on Site-Selective Binding of Metal Ions to Guanine Runs in DNA : A Good Correlation with HOMO Distribution"Journal of the American Chemical Society. 125・5. 1172-1173 (2003)

[Publications] Okamoto, A., Tainaka, K., Saito, I.: "Clear Distinction of Purine Bases on the Complementary Strand by a Fluorescence Change of a Novel Fluorescent Nucleoside"Journal of the American Chemical Society. 125・17. 4972-4973 (2003)

[Publications] Okamoto, A., Tainaka, K., Saito, I.: "Rational Design of a DNA Wire Possessing an Extremely High Hole Transport Ability"Journal of the American Chemical Society. 125・17. 5066-5071 (2003)

[Publications] Okamoto, A., Tanabe, K., Inasaki, T., Saito, I.: "Phototriggered Drug Release from Functionalized Oligonucleotides by a Molecular Beacon Strategy"Angewandte Chemie, Internal Edition. 42・22. 2502-2504 (2003)

[Publications] Okamoto, A., Tanabe, K., Fukuta, T., Saito, I.: "Design of Base-discriminating Fluorescent Nucleoside and its Application to T/C SNP Typing"Journal of the American Chemical Society. 125・31. 9296-9297 (2003)

[Publications] Okamoto, A., Tanaka, K., Saito, I.: "A nucleobase that releases reporter tags upon DNA oxidation"Journal of the American Chemical Society. 126・2. 416-417 (2004)

[Publications] 岡本晃充, 斉藤 烈: "ゲノムケミストリー"講談社サイエンティフィク. 240 (2003)

岡本晃充京都大学, 工学研究科, 助手 (60314233)

[Publications] 岡本晃充, 斉藤烈: "ゲノムケミストリー"講談社サイエンティフィク. 240 (2003)