2004 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
15380131
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
西田 睦 東京大学, 海洋研究所, 教授 (90136896)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
宮 正樹 千葉県立中央博物館, 動物学研究科, 上席研究員 (30250137)
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Keywords | 海洋動物 / 魚類 / 甲殻類 / ミトコンドリアDNA / mtDNA / ミトコンドリアゲノミクス / 分子系統 / 種査定 |
Research Abstract |
生物多様性を維持しつつ水産生物資源の持続的利用を図ることの必要性はますます高くなっている。水圏資源生物の集団構造の把握は困難なことが多く、また卵や幼生の種識別はきわめて困難で、これらのことが合理的な資源管理方策を策定する上での妨げとなっている。こうした状況の改善のために、集団や種の信頼性の高いDNA標識が強く求められている。本研究は、DNA標識源として重要なミトコンドリア(mt)DNAを取り上げ、これまで実施して来た魚類mtDNA全塩基配列分析研究をさらに推し進めるとともに、研究対象を甲殻類にまで広げ、海洋動物のミトコンドリアゲノミクスの新たな展開を目指すものである。 2年目の今年度は、引き続き魚類および甲殻類の標本収集に努め、新たに約100種の貴重な標本試料を得た。前年度同様,魚類標本の種査定はわれわれ自身でおこない、甲殻類標本の種査定は甲殻類分類学の専門家である千葉中央博物館の駒井智幸氏の協力を得ておこなった。とくにユニークな遺伝子配置を有する徴候が認められた魚種を中心に、新たにmtDNA全塩基配列を決定を進めた。こうした魚種の塩基配列決定には種々の困難があるが、魚類約30種について新たに全塩基配列を得ることができた。得られたミトコンドリアゲノムデータは、すでに集積したデータと照らし合わせながら、その特徴や変異性について検討した。さらに、昨年度整備したデータ解析のための計算環境を活用して、いくつかの分類群に焦点を絞って分子系統解析をおこなった。得られた解析結果に総合的な考察を加え、論文化を進めた。加えて魚類ミトコンドリアゲノム・データベースMitoFishの拡充を進めた。
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Research Products
(25 results)