島嶼部東南アジア人の集団形成に関するDNA指標による解析

2003 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 15570192
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 數藤 由美子 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 助手 (70313202)
• Keywords: 島嶼部東南アジア人類集団 / ミトコンドリアDNA / 遺伝的系統関係

Research Abstract

本年度は、当初の計画通り、インドネシア3集団およびフィリピン先住民7集団の血液試料からのDNAの抽出を終了し、試料としてのデータベースを作成した。
これらのDNAサンプルを用いて、人類集団の系統関係を調べるために、母方を反映するミトコンドリアDNAについて、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)法によってD-ループ領域のDNA増幅とその塩基配列の決定を行い、終了した。この配列データに関しては、現在公開されているデータベースのアジアおよびオセアニア地域の他集団の塩基配列データを加えて、遺伝的系統関係を求めつつある。あわせて、ミトコンドリアDNAの9塩基欠損の出現頻度についても求め、地理的勾配を分析した。
また、ミトコンドリアDNAとは別に、父方の指標としては、Y染色体上の特定ゲノム領域の指標候補として、DYS19、DYS287といった、反復配列の数やAlu配列の挿入に多型性のあるマイクロサテライトなどを選択し、前述の10集団について解析し、ほぼ終了した。
さらに、進化の過程における東南アジアの自然条件への適応を考察するために、マラリアをはじめとする疾病への耐性を反映する遺伝指標や、身体的適応を反映する成長ホルモンまたはその受容体、脂質代謝に関する遺伝子のDNA指標を候補の中から選択し、実験条件を決定しつつある。その中で、NAT1およびNAT2遺伝子についての予備的実験を終了した。

Research Products

• [Publications] Suto Y, Ishikawa Y, Hirai M他: "Gene arrangement at the Rhesus blood group locus of chimpanzees detected by fiber-FISH."Cytogenetics and Genome Research. 101. 161-165 (2003)
• [Publications] Suto Y, Ishida T, Hirai M: "Multicolor karyotyping of six Old World monkey species."CYTOLOGIA. 68. 431-436 (2003)
• [Publications] 坂手龍一, 数藤由美子, 平井百樹: "ヒトとチンパンジーの遺伝子構成の異同を探る"バイオサイエンスとインダストリー. 61. 11-16 (2003)
• [Publications] 海老原充, 数藤由美子, 吉川武男他: "良性成人型家族性ミオクローヌスてんかん原因遺伝子の探索"てんかん治療研究振興財団研究年報. 15. 57-64 (2003)
• [Publications] Sakate R, Suto Y, Hirai M他: "Analysis of 5'-end sequences of chimpanzee cDNAs."Genome Research. 13. 1022-1026 (2003)