2015 Fiscal Year Annual Research Report
遺伝子解析に基づいた難聴発症メカニズムの解明および個別化医療システムの構築
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15H02565
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| Research Institution | Shinshu University |
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Principal Investigator |
宇佐美 真一 信州大学, 学術研究院医学系, 教授 (10184996)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
茂木 英明 信州大学, 医学部附属病院, 講師 (60422698)
西尾 信哉 信州大学, 医学部, 助教 (70467166)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | 難聴 / 遺伝子 / ゲノム / 内耳 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
平成27年度は、当研究室の難聴患者 DNA バンク(約 6500 名) のうち、インベーダー法を用いた難聴スクリーニング検査で原因の明らかとならなかった難聴患者 500 例を対象に、難聴の原因遺伝子として報告されている遺伝子の網羅的解析を行った。その結果、大規模集団における日本人難聴患者の原因遺伝子変異のスペクトラムを明らかにすることができた（Nishio and Usami 2015）。
また、既知難聴原因遺伝子の網羅的解析を行っても難聴の原因を特定できなかった症例のうち、比較的大きい家系５家系を対象に全遺伝子のエクソン領域を網羅的にエキソーム 解析を実施した。その結果、うち３家系より、新規の難聴原因候補遺伝子を同定することができた。これらの遺伝子に関して内耳における局在を明らかにすることを目的に、マウス内耳における発現部位を免疫組織染色で確認を行った。また抗体の入手が困難であった１遺伝子に関しては、レーザーキャプチャーマイクロダイセクション法により内耳を部位別に分断し、RNAを抽出して遺伝子発現を確認し、内耳における機能的役割について検討を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の計画どおり500例に対するターゲットリシークエンス解析が完了した。また、原因の特定できなかった家系に関してエクソーム解析を実施し候補遺伝子を同定することができた。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成28年度は前年度までに既知難聴原因遺伝子の網羅的解析を行っても難聴の原因を特定できなかった症例のうち、比較的大きい家系を対象に全遺伝子のエクソン領域を網羅的にエキソーム 解析を実施し、新規の難聴原因候補遺伝子を同定する。
また、新規の遺伝子に関しては機能や難聴発症のメカニズムが不明であることより、マウス内耳における発現部位を免疫組織染色およびレーザーキャプチャーマイクロダイセクション法により内耳を部位別に分断し、RNAを抽出して遺伝子発現を確認することにより、内耳における局在や機能的役割について検討を行い、論文として報告する。
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Research Products
(23 results)
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[Journal Article] Novel PTPRQ mutations identified in three congenital hearing loss patients with various types of hearing loss.2015
Author(s)
Sakuma N, Moteki H, Azaiez H, Booth KT, Takahashi M, Arai Y, Shearer AE, Sloan CM, Nishio SY, Kolbe DL, Iwasaki S, Oridate N, Smith RJ, Usami S.
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Journal Title
Ann Otol Rhinol Laryngol.
Volume: 124
Pages: 184S-192S.
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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