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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Molecular epidemiology studies on rare genetic disorders and pediatric cancer cohorts associated with genome instability

Research Project

Project/Area Number 15H02654
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

荻 朋男  名古屋大学, 環境医学研究所, 教授 (80508317)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 花岡 文雄  学習院大学, 理学部, 研究員 (50012670)
李 桃生  長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 教授 (50379997)
光武 範吏  長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 准教授 (50404215)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
KeywordsDNA修復 / ゲノム不安定性疾患
Outline of Annual Research Achievements

ゲノム不安定化を誘発する先天性希少疾患及び小児がん症例を海外拠点の患者家族会や研究者、臨床医、関連施設・病院の協力のもと収集し、ゲノム・分子疫学調査を実施した。DNA損傷応答・DNA修復機構の異常により小頭症や発育異常、好発がん性、早期老化症状、各種奇形などを示す症例を収集した。主に、ヨーロッパやアジア、アメリカの患者で疾患原因が未同定である症例を集めた。中国では、北京大学、上海交通大との連携を主として、DNA修復の異常により小頭症を示す症例、免疫不全・白血病等のゲノム不安定性により造血機能異常あるいは血液がん等を発症する症例サンプルの収集に力を入れた。イギリスあるいはイタリアでは、DNA修復の異常により好発がん性を示す色素性乾皮症や小頭症を示すコケイン症候群症例サンプルを、ロシアおよびベラルーシでは小児/若年性がんサンプルの収集に注力した。収集した症例は、国内にてゲノム解析及び疾患原因変異の特定を実施した。具体的には、次世代ゲノム解析 (全エキソーム解析、全ゲノム解析)およびDNA修復アッセイにより疾患原因の特定を試みた。また、これまで収集した様々なゲノム不安定性疾患のうち、コケイン症候群に関して、病態と疾患原因変異について、海外の共同研究拠点および患者家族会と協力して情報の集約を進め、迅速な臨床診断に役立てることを目指し、協議を進めた。結果の一部については論文報告した (Calmels et al. Journal of Medical Genetics, 55: 329-343, 2017)。

Research Progress Status

平成29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (37 results)

All 2019 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 4 results) Presentation (21 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 10 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Sussex Univ. GDSC/Guy's Hospital(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      Sussex Univ. GDSC/Guy's Hospital
  • [Int'l Joint Research] LUMC(オランダ)

    • Country Name
      NETHERLANDS
    • Counterpart Institution
      LUMC
  • [Int'l Joint Research] 北京大学附属病院/上海交通大学附属病院(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      北京大学附属病院/上海交通大学附属病院
  • [Int'l Joint Research] ベラルーシ小児がんセンター(ベラルーシ)

    • Country Name
      BELARUS
    • Counterpart Institution
      ベラルーシ小児がんセンター
  • [Int'l Joint Research] モスクワ内分泌研究所(ロシア連邦)

    • Country Name
      RUSSIA FEDERATION
    • Counterpart Institution
      モスクワ内分泌研究所
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      2
  • [Journal Article] JAK/STAT3 and NF-κB Signaling Pathways Regulate Cancer Stem-Cell Properties in Anaplastic Thyroid Cancer Cells2019

    • Author(s)
      Shiraiwa K, Matsuse M, Nakazawa Y, Ogi T, Suzuki K, Saenko V, Xu S, Umezawa K, Yamashita S, Tsukamoto K, Mitsutake N.
    • Journal Title

      Thyroid

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1089/thy.2018.0212

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional Comparison of XPF Missense Mutations Associated to Multiple DNA Repair Disorders2019

    • Author(s)
      Marin M, Ramirez MJ, Carmona MA, Jia N, Ogi T, Bogliolo M, Surralles J.
    • Journal Title

      Genes

      Volume: 10 Pages: 60~60

    • DOI

      10.3390/genes10010060

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A Japanese Case of Galli-Galli Disease due to a Previously Unreported POGLUT1 Mutation2019

    • Author(s)
      Kono M、Sawada M、Nakazawa Y、Ogi T、Muro Y、Akiyama M
    • Journal Title

      Acta Dermato Venereologica

      Volume: 99 Pages: 458~459

    • DOI

      10.2340/00015555-3119

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Functional and clinical relevance of novel mutations in a large cohort of patients with Cockayne syndrome2018

    • Author(s)
      Calmels N, Botta E, Jia N, Fawcett H, Nardo T, Nakazawa Y, Lanzafame M, Moriwaki S, Sugita K, Kubota M, Obringer C, Spitz MA, Stefanini M, Laugel V, Orioli D, Ogi T§, Lehmann A.
    • Journal Title

      Journal of Medical Genetics

      Volume: 55 Pages: 329~343

    • DOI

      10.1136/jmedgenet-2017-104877

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cerebellar ataxia-dominant phenotype in patients with ERCC4 mutations2018

    • Author(s)
      Doi H, Koyano S, Miyatake S, Nakajima S, Nakazawa Y, Kunii M, Tomita-Katsumoto A, Oda K, Yamaguchi Y, Fukai R, Ikeda S, Kato R, Ogata K, Kubota S, Hayashi N, Takahashi K, Tada M, Tanaka K, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Ogi T, Aihara M, Takeuchi H, Matsumoto N, Tanaka F.
    • Journal Title

      Journal of Human Genetics

      Volume: 63 Pages: 417~423

    • DOI

      10.1038/s10038-017-0408-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An XPA gene splicing mutation resulting in trace protein expression in an elderly patient with xeroderma pigmentosum group A without neurological abnormalities2017

    • Author(s)
      Takahashi Y, Endo Y, Kusaka A, Nakamaura S, Nakazawa Y, Ogi T, Uryu M, Tsuji M, Furue M, Moriwaki S.
    • Journal Title

      British Journal of Dermatology

      Volume: 177 Pages: 253~257

    • DOI

      10.1111/bjd.15051

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis of clinical symptoms and ABCC6 mutations in 76 Japanese patients with pseudoxanthoma elasticum2017

    • Author(s)
      Iwanaga A, Okubo Y, Yozaki M, Koike Y, Kuwatsuka Y, Tomimura S, Yamamoto Y, Tamura H, Ikeda S, Maemura K, Tsuiki E, Kitaoka T, Endo Y, Mishima H, Yoshiura KI, Ogi T, Tanizaki H, Wataya-Kaneda M, Hattori T, Utani A.
    • Journal Title

      The Journal of Dermatology

      Volume: 44 Pages: 644~650

    • DOI

      10.1111/1346-8138.13727

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Calcification in dermal fibroblasts from a patient with GGCX syndrome accompanied by upregulation of osteogenic molecules2017

    • Author(s)
      Okubo Y, Masuyama R, Iwanaga A, Koike Y, Kuwatsuka Y, Ogi T, Yamamoto Y, Endo Y, Tamura H, Utani A.
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 12 Pages: e0177375

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0177375

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Alterations in RNA polymerase IIo ubiquitination cause Cockayne syndrome-like premature aging phenotype in mice due to TC-NER defect.2019

    • Author(s)
      Ogi T.
    • Organizer
      International Symposium on XP and other Nucleotide Excision Repair Disorders
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Alterations in RNA polymerase IIo ubiquitination cause Cockayne syndrome-like premature aging phenotype in mice due to TC-NER defect.2019

    • Author(s)
      Nakazawa Y, Ogi T.
    • Organizer
      International Symposium on XP and other Nucleotide Excision Repair Disorders
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNA損傷依存的なRNAポリメラーゼのユビキチン化修飾の異常はDNA修復経路の欠損マウスで老化表現型を示す.2019

    • Author(s)
      荻 朋男.
    • Organizer
      国立遺伝学研究所・研究集会「ゲノムの維持継承を支える分子基盤の包括的理解とその発展」
    • Invited
  • [Presentation] マルチオミクス解析により同定した重症アイカルディ・ゴーティエ症候群の分子病態解析.2019

    • Author(s)
      岡 泰由, 荻 朋男.
    • Organizer
      第41回日本小児遺伝学会学術集会
  • [Presentation] ゲノム不安定性を示す遺伝性疾患の分子病態.2018

    • Author(s)
      中沢由華, 荻 朋男.
    • Organizer
      第3回名大医薬系3部局交流シンポジウム~岐阜薬科大学・岐阜大学G-CHAIN・ラクオリア創薬合同シンポジウム~
  • [Presentation] RNAポリメラーゼのユビキチン化修飾による転写共役ヌクレオチド除去修復の反応制御とコケイン症候群の病態.2018

    • Author(s)
      荻 朋男.
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Identification of pathogenic mutations in patients with rare diseases using multiomics approaches.2018

    • Author(s)
      Oka Y, Ogi T.
    • Organizer
      Japanese Proteomics Society 2018 Conference (JPrOS 2018), 9th Asia-Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO), and 66th Annual Conference on Mass Spectrometry
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Very mild Japanese Cockayne syndrome (type-IV) cases with a N-terminal truncation mutation in the ERCC6 / CSB gene.2018

    • Author(s)
      Ogi T.
    • Organizer
      国際シンポジウム「早老症と関連疾患」
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Human genetic disorders associated with TC-NER deficiency.2017

    • Author(s)
      Ogi T.
    • Organizer
      第2回神戸大学バイオシグナル総合研究センター国際シンポジウム
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Very mild CS type-IV cases with mutation in the CSB gene.2017

    • Author(s)
      Ogi T.
    • Organizer
      Cockayne Syndrome Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Human genetics disorders associated with DNA repair deficiency.2017

    • Author(s)
      Ogi T.
    • Organizer
      6th US-Japan DNA Repair Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] DNA損傷依存的なRNAポリメラーゼの修飾とヒト疾患.2017

    • Author(s)
      荻 朋男.
    • Organizer
      国立遺伝学研究所・研究集会「染色体構築と安定化を担う分子機構」
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム不安定性を示す遺伝性疾患の次世代マルチオミクス解析.2017

    • Author(s)
      荻 朋男.
    • Organizer
      第7回名古屋大学医学系研究科・生理学研究所合同シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] ミニレクチャー「ゲノム不安定性疾患群を中心とした希少疾患の次世代マルチオミクス病態解析」2017

    • Author(s)
      荻 朋男.
    • Organizer
      第12回東海小児遺伝カンファレンス
    • Invited
  • [Presentation] Molecular pathogenesis underlying Cockayne syndrome and UV-sensitive syndrome.2017

    • Author(s)
      Jia N, Guo C, Oka Y, Nakazawa Y, Shimada M, Miyazaki H, Ogi T.
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Very mild CS type-IV cases with mutations in the CSB gene.2017

    • Author(s)
      Jia N, Guo C, Oka Y, Nakazawa Y, Shimada M, Miyazaki H, Ogi T.
    • Organizer
      第24回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • [Presentation] DNA修復機構欠損性疾患の病態解明研究.2017

    • Author(s)
      中沢 由華、賈 楠、嶋田 繭子、宮崎 仁美、千住 千佳子、郭 朝万、岡 泰由、荻 朋男.
    • Organizer
      第2回放射線災害・医科学研究拠点カンファランス
  • [Presentation] マルチオミクス解析による希少遺伝性疾患発症責任因子の同定.2017

    • Author(s)
      岡 泰由、中沢 由華、荻 朋男.
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ゲノム不安定性を示す遺伝性疾患群の疾患責任遺伝子変異の探索.2017

    • Author(s)
      中沢 由華、千住 千佳子、岡 泰由、嶋田 繭子、宮崎 仁美、郭 朝万、賈 楠、荻 朋男.
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] A Novel Gene Mutation Of Japanese Xeroderma Pigmentosum Complementation Group F Patients.2017

    • Author(s)
      Senju C, Nakazawa Y, Ogi T.
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Identification of pathogenic mutations in patients with rare diseases using multi-omics analysis.2017

    • Author(s)
      Oka Y, Nakazawa Y, Ogi T.
    • Organizer
      日本プロテオーム学会2017年大会
  • [Remarks] 名古屋大学環境医学研究所HP

    • URL

      http://www.riem.nagoya-u.ac.jp/index.html

  • [Remarks] 名古屋大学環境医学研究所 発生遺伝分野HP

    • URL

      http://www.riem.nagoya-u.ac.jp/4/genetics/index.html

URL: 

Published: 2019-12-27  

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