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2015 Fiscal Year Annual Research Report

膜内切断プロテアーゼRsePの選択的基質切断機構と新規細胞機能

Research Project

Project/Area Number 15H04350
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

秋山 芳展  京都大学, ウイルス研究所, 教授 (10192460)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 森 博幸  京都大学, ウイルス研究所, 准教授 (10243271)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords大腸菌 / 膜タンパク質 / 膜プロテアーゼ / ストレス応答
Outline of Annual Research Achievements

古細菌S2Pホモログの結晶構造には、進化的に保存された、細胞質側領域から膜ドメイン内部に挿入するβヘアピン様ループ構造(MRE β-loop: membrane reentrant β-loop)が存在しており、RsePも相同な領域を持つ。変異解析の結果RseP MRE β-loopのいくつかの変異は、基質特異的な切断阻害を示し、この領域が選択的基質切断に関わることが示唆された。また、共免疫沈降実験やクロスリンク実験の結果、ループ領域が基質の膜貫通領域と直接相互作用することが強く示唆された。さらに、基質膜貫通領域のヘリックス構造を不安定化させる変異により、RsePのループ領域の変異体による基質切断がアリル特異的に回復した。これらの結果等を踏まえ、「MRE β-loopは、基質の膜貫通領域とβストランド付加機構により特異的に相互作用することで切断を受にくいαヘリックス構造から伸びたβストランド構造への変化を促し、RseP活性部位へと提示する」とのモデルを提唱した。MRE β-loopの機能は、PDZフィルターに加えて第二の基質選別チェックポイントとして働くものと考えている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度の研究で、RsePのβループ領域が基質の特異的認識と切断に直接関わる事、特に基質膜タンパク質の構造変化を誘起することなど、新規の発見を含め進展があり、国際学術誌に成果を発表した。従って、概ね順調に研究が進展しているものと考える。

Strategy for Future Research Activity

本研究で計画した新規基質の探索についてもこれまでに予備的に候補を得ている。本年度は、RseP機能解析とともに、基質の探索とその切断の生理的意義の解析を進めたい。

  • Research Products

    (5 results)

All 2015

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Role of membrane-reentrant β-hairpin-like loop of RseP protease in selective substrate cleavage.2015

    • Author(s)
      Akiyama, K., Mizuno, S., Hizukuri, Y., Mori, H., Nogi, T., and Akiyama, Y.
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 4 Pages: e08928

    • DOI

      10.7554/eLife.08928

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Nascent chain-monitored remodeling of the Sec machinery for salinity adaptation of marine bacteria.2015

    • Author(s)
      Ishii, E., Chiba, S., Hashimoto, N., Kojima, S., Homma, M., Ito, K., Akiyama, Y., and Mori, H.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      Volume: 112 Pages: E5513-E5522

    • DOI

      10.1073/pnas.1513001112

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Activation of TA system toxins suppresses lethality caused by the loss of σE in Escherichia coli2015

    • Author(s)
      Daimon, Y., Narita, S.-i., and Akiyama, Y.
    • Journal Title

      J. Bacteriol.

      Volume: 197 Pages: 2316-2324

    • DOI

      10.1128/JB.00079-15.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] S2Pファミリー膜内切断プロテアーゼRsePの膜内挿入ループ領域を介した基質選別2015

    • Author(s)
      23.秋山光市郎、水野慎也、檜作洋平、森 博幸、禾 晃和、秋山芳展
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会大会・第88回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] Analysis of the conserved membrane-reentrant loop of RseP, an intramembrane-cleaving protease.2015

    • Author(s)
      19.Akiyama, K., Mizuno, S., Hizukuri, Y., Mori, H., Nogi, T., Akiyama, Y.
    • Organizer
      The 22nd East Asia Joint Symposium on Biomedical Research
    • Place of Presentation
      沖縄
    • Year and Date
      2015-11-11 – 2015-11-14
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2017-01-06  

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