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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Studies on acyltransferases that create the heterogeneity of biological membrane in bacteria

Research Project

Project/Area Number 15H06328
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

小川 拓哉  京都大学, 化学研究所, 助教 (40756318)

Project Period (FY) 2015-08-28 – 2017-03-31
Keywordsリゾホスファチジン酸アシル基転移酵素 / PlsC / 膜タンパク質 / リン脂質代謝
Outline of Annual Research Achievements

グラム陰性細菌Shewanella livingstonensis Ac10は南極海水から単離された低温性の細菌であり、4-25℃で生育が可能である。本菌の低温環境下での生育には多価不飽和脂肪酸の1種であるエイコサペンタエン酸 (EPA) が重要であり、EPAは主に細胞膜を構成するリン脂質のアシル鎖として含まれる。平成28年度までに、EPAをリン脂質に導入する1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase (PlsC) のホモログ酵素 (SlPlsC1) に注目し、活性型での精製、および酵素学的な機能解析を行った。その際、SlPlsC1の可溶化・精製に界面活性剤として6-cyclohexyl-1-hexyl-D-maltosideを使うことが活性の維持に重要であり、類似の構造を持つn-dodecyl-D-maltosideなどの界面活性剤を用いると失活することを見出した。そこで、これらの界面活性剤がSlPlsC1の構造に与える影響を調べる目的で、精製したSlPlsC1をゲルろ過クロマトグラフィーにより分析した。結果として、どちらの界面活性剤を用いてもクロマトグラムのピーク形状に大きな差はなく、構造的な要因で失活しているのではないことが予想された。上記のSlPlsC1の精製および特性評価を論文にまとめて報告した。
また、SlPlsC1の精製方法を応用し、結晶構造解析を目的として好熱菌Thermus thermophilus由来のPlsC (TtPlsC) の精製および特性評価を行った。結果として、TtPlsCも活性を維持したまま精製することができ、基質特異性など酵素学的な特性を明らかにすることができた。TtPlsCは収量が0.27 mg/g of wet cellsと良好であり、またSlPlsC1に比べて熱安定性が高いことがわかり、結晶構造解析に適していることが期待された。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (6 results)

All 2018 2017

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Purification and characterization of 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase with a substrate preference for polyunsaturated fatty acyl donors from the eicosapentaenoic acid-producing bacterium Shewanella livingstonensis Ac102018

    • Author(s)
      Ogawa Takuya、Tanaka Asako、Kawamoto Jun、Kurihara Tatsuo
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1093/jb/mvy025

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 好熱菌 Thermus thermophilus 由来リゾホスファチジン酸アシル基転移酵素の基質特異性の解析2018

    • Author(s)
      Nittikarn Suwanawat、小川拓哉、豊竹洋佑、川本 純、栗原達夫
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
  • [Presentation] 細菌型リゾホスファチジン酸アシル基転移酵素の精製とキャラクタリゼーション2017

    • Author(s)
      小川拓哉、田中麻子、Nittikarn Suwanawat、川本 純、栗原達夫
    • Organizer
      第64回日本生化学会近畿支部例会
  • [Presentation] Purification and characterization of a thermostable 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase (PlsC)2017

    • Author(s)
      Nittikarn Suwanawat, Takuya Ogawa, Jun Kawamoto and Tatsuo Kurihara
    • Organizer
      酵素補酵素研究会2017
  • [Presentation] Purification and characterization of a lysophosphatidic acid acyltransferase from an eicosapentaenoic acid-producing bacterium Shewanella livingstonensis Ac102017

    • Author(s)
      Takuya OGAWA
    • Organizer
      International workshop on microbes in hostile environments
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] EPA生産菌Shewanella livingstonensis Ac10のリゾホスファチジン酸アシル基転移酵素の精製と特性評価2017

    • Author(s)
      小川 拓哉,田中 麻子,川本 純,栗原 達夫
    • Organizer
      特殊環境微生物セミナー 2017

URL: 

Published: 2018-12-17  

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