• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2015 Fiscal Year Research-status Report

全原子を量子論で取り扱う凝縮系化学反応動力学理論の開発

Research Project

Project/Area Number 15K05375
Research InstitutionSaitama University

Principal Investigator

高柳 敏幸  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (90354894)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Keywords反応動力学 / 量子ダイナミクス / リングポリマー分子動力学法 / 量子効果
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、主に液体中の化学反応系の全自由度を量子的に取り扱うための予備的なプログラム開発と計算環境の整備を行った。
具体的には、まず原子力研究開発機構の志賀基之氏が開発した量子ダイナミクス計算を行うPIMDコードに、当研究グループが開発した気相中のグアニン‐シトシン負イオンにおけるプロトン移動反応のポテンシャルエネルギー曲面関数とその微分関数を組み込むことを実施した。これをテストケースとして、グアニン‐シトシン間のプロトン移動反応について、リングポリマー分子動力学法を用いた量子ダイナミクス計算を実行した。特に温度効果および同位体置換効果について詳細に調べ、核を量子的に取り扱った場合では、温度が低くなると反応速度が速くなるという特異な現象を見出した。この結果を論文としてまとめ、Chemical Physics誌に投稿し、採択・掲載された。
前述の応用計算は、孤立系の気相化学反応であるため、上記計算コードとポテンシャル関数コードのリンクの妥当性を踏まえて、次に溶媒中における化学反応シミュレーションコードの開発に着手した。最初のステップとして、原子核運動の量子効果が極めて高いと考えられるヘリウム液滴(数百個から数千個からなる極低温のヘリウムクラスター)中の金属原子の励起ダイナミクス反応について、プログラム開発を行った。具体的には、ヘリウムクラスター中で銀原子の基底状態(s状態)が光吸収によって瞬間的に励起状態(p状態)に変化した後の全原子運動のダイナミクスを追跡する計算コード開発を行った。現在、リングポリマー法で用いるビーズ数の収束性の確認やヘリウム原子数の選択等を行っている状態である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度の目的は、理論計算実行のための予備的なプログラム開発と計算環境の整備であり、特に問題も発生せず、予定通りの研究活動を行うことができた。

Strategy for Future Research Activity

今後は、まずヘリウムクラスター中の化学反応ダイナミクスについて詳細なテスト計算を行う。その後、より一般的な溶液である水溶液中で起こる化学反応系へ研究を展開する予定である。そのため、具体的な反応系について十分な予備調査を行ったのち、ポテンシャルエネルギー関数の開発を行う。この場合、新たに我々のグループで包括的な電子状態計算を行う必要があることも念頭に置いている。

  • Research Products

    (16 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 4 results)

  • [Int'l Joint Research] UC Berkeley(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      UC Berkeley
  • [Int'l Joint Research] Free University of Berlin(Germany)

    • Country Name
      Germany
    • Counterpart Institution
      Free University of Berlin
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      2
  • [Journal Article] Effects of temperature and isotopic substitution on electron attachment dynamics of guanine-cytosine base pair: Ring-polymer and classical molecular dynamics simulations2016

    • Author(s)
      Yusuke Minoshima, Yusuke Seki, Toshiyuki Takayanagi, Motoyuki Shiga
    • Journal Title

      Chemical Physics

      Volume: 472 Pages: 1-8

    • DOI

      doi.org/10.1016/j.chemphys.2016.02.019

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Quantum chemical study of dissociative electron attachment to D-ribose and D-fructose2016

    • Author(s)
      Tomoki Fujita, Manami Kondo, Toshiyuki Takayanagi
    • Journal Title

      Computational and Theoretical Chemistry

      Volume: 1075 Pages: 70-76

    • DOI

      doi.org/10.1016/j.comptc.2015.11.011

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Quantum transition state dynamics of the cyclooctatetraene unimolecular reaction on ab initio potential energy surfaces2016

    • Author(s)
      Chihiro Tokizaki, Takahiko Yoshida, Toshiyuki Takayanagi
    • Journal Title

      Chemical Physics

      Volume: 469-470 Pages: 97-104

    • DOI

      doi.org/10.1016/j.chemphys.2016.02.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamics of dipole- and valence bound anions in iodide-adenine binary complexes: A time-resolved photoelectron imaging and quantum mechanical investigation2015

    • Author(s)
      Anne B. Stephansen, Sarah B. King, Yuki Yokoi, Yusuke Minoshima, Wei-Li Li, Alice Kunin, Toshiyuki Takayanagi, Daniel M. Neumark
    • Journal Title

      THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS

      Volume: 143 Pages: 104308-1-14

    • DOI

      doi.org/10.1063/1.4929995

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Electron accommodation dynamics in the DNA base thymine2015

    • Author(s)
      Sarah B. King, Anne B. Stephansen, Yuki Yokoi, Margaret A. Yandell, Alice Kunin, Toshiyuki Takayanagi, Daniel M. Neumark
    • Journal Title

      THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS

      Volume: 143 Pages: 024312-1-11

    • DOI

      doi: 10.1063/1.4923343

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] From photoelectron detachment spectra of BrHBr-, BrDBr- and IHI-, IDI- to vibrational bonding of BrMuBr and IMuI2015

    • Author(s)
      Joern Manz, Kazuma Sato, Toshiyuki Takayanagi, Takahiko Yoshida
    • Journal Title

      THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS

      Volume: 142 Pages: 164308-1-12

    • DOI

      doi: 10.1063/1.4918980

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Theoretical analysis of the transition-state spectrum of the cyclooctatetraene unimolecular reaction: Three degree-of-freedom model calculations2015

    • Author(s)
      Takahiko Yoshida, Chihiro Tokizaki, Toshiyuki Takayanagi
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters

      Volume: 634 Pages: 134-139

    • DOI

      doi.org/10.1016/j.cplett.2015.06.018

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] First-principles simulations of transition state spectra of the I + HI and I + DI reactions and vibrational bonding in IMuI2015

    • Author(s)
      Takahiko Yoshida, Kazuma Sato, Toshiyuki Takayanagi
    • Journal Title

      Chemical Physics

      Volume: 457 Pages: 51-56

    • DOI

      doi.org/10.1016/j.chemphys.2015.05.019

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Quantum Molecular Dynamics Simulations of Excess Electron Attachment to Biomolecules2015

    • Author(s)
      Toshiyuki Takayanagi
    • Organizer
      the 2nd DEA Club meeting
    • Place of Presentation
      Mumbai, India
    • Year and Date
      2015-11-18 – 2015-11-20
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Transition-state spectra of the X + HX/X + DX reactions and vibrational bonding of XMuX (X = Br, I)2015

    • Author(s)
      Toshiyuki Takayanagi
    • Organizer
      13th International Workshop on Quantum Reactive Scattering
    • Place of Presentation
      Salamanca, Spain
    • Year and Date
      2015-07-06 – 2015-07-10
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Semiclassical dynamics of electron attachment to guanine-cytosine base pair2015

    • Author(s)
      Yusuke Minoshim, Tomohiro Honda, Yuki Yokoi, Toshiyuki Takayanagi, Motoyuki Shiga
    • Organizer
      31st Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics
    • Place of Presentation
      Sapporo, Japan
    • Year and Date
      2015-06-03 – 2015-06-05
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Nuclear quantum effects in tritium diffusion in α-iron2015

    • Author(s)
      Toshiyuki Takayanagi
    • Organizer
      International workshop on Models and Data for Plasma-Material Interaction in Fusion Devices
    • Place of Presentation
      Marseille, France
    • Year and Date
      2015-05-25 – 2015-05-27
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Extreme quantum isotope effects in muonium/muon chemical reactions2015

    • Author(s)
      Toshiyuki Takayanagi
    • Organizer
      EMN Meeting on Quantum Technology
    • Place of Presentation
      Beijing, China
    • Year and Date
      2015-04-14 – 2015-04-17
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2017-01-06   Modified: 2022-01-24  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi