2016 Fiscal Year Research-status Report
ゲノムスケール多数遺伝子配列データを用いた種の系統関係の推定
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15K07187
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| Research Institution | Kagawa University |
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Principal Investigator |
竹崎 直子 香川大学, 総合生命科学研究センター, 教授 (30398036)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 分子系統 / シーラカンス / アウトグループ / 肺魚 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
これまでに３つの多数遺伝子データセットを用いてシーラカンス、肺魚、四足動物の系統関係の推定を行った。その際、ray-finned fishはcartilaginous fishよりもこれらの３つのグループにより近縁であり、outgroupとして用いるのにより適当であると一見思われた。cartilaginous fish 及びray-finned fish, cartilaginous fishのみをoutgroupとして用いるとシーラカンスよりも肺魚が四足動物に近縁であることが強く支持されたが、ray-finned fishのみをoutgroupとして用いると、３つのグループの系統関係は曖昧になり、シーラカンスが四足動物により近縁であることが強く支持される場合も用いたデータセットや系統樹作成方法によってはあった。これはray-finned fishはcartilaginous fishよりも進化速度が速いため、rayfinned fishをoutgroupとして用いる事により、３つのグループの系統関係の推定に誤った結果がcartilaginous fishを用いるよりも出やすいことが考えられ、このことはcomputer simulationによっても支持された。今年度は進化速度の遅いrayfinned fishであるgar, bowfinをデータに加える事により、gar, bowfinをoutgroupとして用いると、cartilaginous fishをoutgroupとして用いた時と同じように肺魚と四足動物が姉妹関係にあることが強く支持されることを示した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
gar, bowfinをoutgroupとして用いた研究結果をまとめて論文として発表することができた。
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| Strategy for Future Research Activity |
シーラカンス、肺魚、四足動物の分岐時間の推定を行う。それと共に、四足動物内の主要なグループである哺乳類、鳥類などと、硬骨魚の分岐時間の推定も行う。
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| Causes of Carryover |
雑誌への論文発表にかかる掲載料（オープンアクセスの可能性もあり）を予定していたが、その費用がかからなかったため
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
本年度も研究結果の雑誌掲載料が必要となる可能性があるのでこれに使用する。
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