Genetic characterization of unclassifiable small round cell sarcomas

2017 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 15K19065
• Research Institution: National Cancer Center Japan
• Principal Investigator: 吉田 朗彦 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医員 (80574780)
• Project Period (FY): 2015-04-01 – 2018-03-31
• Keywords: 小円形細胞肉腫 / 融合遺伝子 / バイオマーカー / 免疫組織化学 / RNAシーケンス

Outline of Annual Research Achievements

昨年度までに、SMARCA4変異と発現消失を伴う胸部肉腫や、FISH偽陰性となるCIC-DUX4融合肉腫の研究を実施し論文発表したが、今年度は下記の研究を行った。
①BCORやCCNB3の免疫染色、BCOR-FISH解析を用いて、当院の分類不能肉腫コホート中におけるBCOR関連肉腫の探索を行った結果、BCOR-CCNB3融合陽性肉腫15例を同定したほか、遺伝子異常の明らかでないBCOR過剰発現を伴う肉腫を複数同定した。これらの臨床病理像や遺伝子的背景について、RNAseqを含め解析中である。②分類不能小円形細胞肉腫8例においてFFPEからのRNAseqを施行し、3例において新規融合遺伝子を同定した。新規疾患単位の可能性があり、現在類似症例の探索を進めている。③小円形細胞型の富細胞性亜型を含む骨外性粘液性軟骨肉腫の新規マーカーとしてINSM1を同定した。感度・特異度ともに比較的良好で、遺伝子検索困難な状況では診断に有用な可能性が示唆された（Yoshida, Mod Pathol. 2018）。④スペインの研究者グループと共同で、366例の典型的ユーイング肉腫組織を用いて、既知バイオマーカー（NKX2.2, ETV4, BCOR)の診断的有効性の妥当性確認を行った(Machado, Pathol Res Pract. 2017)。⑤スペインの研究グループから提供された分類不能小円形細胞肉腫41例に新規バイオマーカーや遺伝子検索を用いた検討を加え、その一部を稀な疾患単位（EWSR1-NFATC2肉腫やCIC-DUX4肉腫など）に分類するとともに、やはり分類不能となる腫瘍群を同定した(Machado, Ann Diagn Pathol. 2017)。⑥骨軟骨腫内に発生した1cm大未満の間葉型軟骨肉腫を症例報告した（Toki, Hum Pathol. 2018）。

Research Products

• [Int'l Joint Research] Instituto Valenciano de Oncologia(Spain)
  • Country Name: Spain
  • Counterpart Institution: Instituto Valenciano de Oncologia
• [Journal Article] Minute Mesenchymal Chondrosarcoma within Osteochondroma: An Unexpected Diagnosis Confirmed by HEY1-NCOA2 Fusion. (2018)
  • Author(s): Toki S, Motoi T, Miyake M, Kobayashi E, Kawai A, Yoshida A.
  • Journal Title: Hum Pathol. Volume: 印刷中 Pages: 印刷中
  • DOI: 10.1016/j.humpath.2018.03.014.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] INSM1 expression and its diagnostic significance in extraskeletal myxoid chondrosarcoma. (2018)
  • Author(s): Yoshida A, Makise N, Wakai S, Kawai A, Hiraoka N.
  • Journal Title: Mod Pathol. Volume: 印刷中 Pages: 印刷中
  • DOI: 10.1038/modpathol.2017.189.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Review with novel markers facilitates precise categorization of 41 cases of diagnostically challenging, "undifferentiated small round cell tumors". A clinicopathologic, immunophenotypic and molecular analysis. (2017)
  • Author(s): Machado I, Yoshida A, Morales MGN, Abrahao-Machado LF, Navarro S, Cruz J, Lavernia J, Parafioriti A, Picci P, Llombart-Bosch A.
  • Journal Title: Ann Diagn Pathol. Volume: 34 Pages: 1-12
  • DOI: 10.1016/j.anndiagpath.2017.11.011.
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Immunohistochemical analysis of NKX2.2, ETV4, and BCOR in a large series of genetically confirmed Ewing sarcoma family of tumors. (2017)
  • Author(s): Machado I, Yoshida A, Lopez-Guerrero JA, Nieto MG, Navarro S, Picci P, Llombart-Bosch A.
  • Journal Title: Pathol Res Pract. Volume: 213 Pages: 1048-1053
  • DOI: 10.1016/j.prp.2017.08.002.
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] CIC break-apart fluorescence in-situ hybridization misses a subset of CIC-DUX4 sarcomas: a clinicopathological and molecular study. (2017)
  • Author(s): Yoshida A, Arai Y, Kobayashi E, Yonemori K, Ogura K, Hama N, Mukai W, Motoi T, Kawai A, Shibata T, Hiraoka N.
  • Journal Title: Histopathology Volume: 71 Pages: 461-469
  • DOI: 10.1111/his.13252.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Clinicopathological and molecular characterization of SMARCA4-deficient thoracic sarcomas with comparison to potentially related entities. (2017)
  • Author(s): Yoshida A, Kobayashi E, Kubo T, Kodaira M, Motoi T, Motoi N, Yonemori K, Ohe Y, Watanabe SI, Kawai A, Kohno T, Kishimoto H, Ichikawa H, Hiraoka N.
  • Journal Title: Mod Pathol. Volume: 30 Pages: 797-809
  • DOI: 10.1038/modpathol.2017.11.
  • Peer Reviewed