2017 Fiscal Year Annual Research Report
SFXを用いたHIVアクセサリータンパク質と宿主制限因子の複合体の動的構造の解明
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16F16111
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Research Institution | Kumamoto University |
Principal Investigator |
大塚 雅巳 熊本大学, 大学院生命科学研究部(薬), 教授 (40126008)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
CIFTCI HALIL 熊本大学, 大学院生命科学研究部(薬), 外国人特別研究員
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Project Period (FY) |
2016-04-22 – 2018-03-31
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Keywords | HIV / MA / IP6 |
Outline of Annual Research Achievements |
①SAMHD1およびDCAF1タンパク質を発現し精製することに成功したが、アクセサリータンパク質Vpxを精製するには至らなかった。E. coliの系統を変える、GSTタグをもつVpxタンパク質を構築するなど試みたが、結晶精製スクリーニングに必要なVpx-SAMHD1-DCAF1三者複合体を形成するに十分な濃度のVpxタンパク質を得るに至らなかった。 ②MA-IP6複合体結晶を得ることができ、2つの異なった形の結晶を回折実験に供し、2.7および2.5 Åの分解能で結晶構造を解くことができた。予想したとおり、IP6分子はタンパク質の塩基性の高い領域のアミノ酸残基と相互作用していた。両結晶のパッキングについてはMAの集合とIP6分子との観点から議論することができる。現在、スタンフォード大学との共同研究により、大阪のSACLAの2018年5月のビームタイムにおいてIP6のナノ結晶の室温におけるSFX実験を行っているところである。 ③トルコ薬用植物と合成化合物を基軸とした医薬スクリーニングについては、benzyl 3-hydroxy-23-oxoolean-12-en-28-oateがBcr-Abl陽性のK562細胞に対して最も有効で(IC50は9.3 μM)、腫瘍特異性とアポプトーシス誘導活性を示した。本化合物はAblプロテインキーゼを低いマイクロモルオーダーのIC50値で阻害するが、BRK, BTK, CSK, LYN BおよびSRCキナーゼに対する阻害効果はイマチニブより高いものであった。さらに、本化合物とBcr-Ablの複合体のドッキングシミュレーションの結果ベンジルエステル部分が幾つかの重要なアミノ酸残基と結合および疎水性相互作用を持つことが示された。全体として、本研究でジプソジェニン誘導体がキナーゼ阻害剤の新しいクラスとなることを示した。
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Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(19 results)
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[Journal Article] Design, synthesis and biological evaluation of novel 1,3,4-thiadiazole derivatives as potential antitumor agents against chronic myelogenous leukemia. Striking effect of nitrothiazole moiety2018
Author(s)
Mehlika Dilek Altintop, Halil Ibrahim Ciftci, Mohamed O. Radwan, Belgin Sever, Zafer Asim Kaplancikli, Taha F.S. Ali, Ryoko Koga, Mikako Fujita, Masami Otsuka, Ahmet Ozdemir
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Journal Title
Molecules
Volume: 23
Pages: 59
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] A Dithiol Compound Binds To The Zinc Finger Protein TRAF6 and Suppresses Its Ubiquitination.2017
Author(s)
Ryoko Koga, Mohamed O. Radwan, Tomohiko Ejima, Yosuke Kanemaru, Hiroshi Tateishi, Taha F. S. Ali, Halil Ibrahim Ciftci, Yuri Shibata, Yuu Taguchi, Jun-ichiro Inoue, Masami Otsuka, Mikako Fujita
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Journal Title
ChemMedChem
Volume: 12
Pages: 1935-1941
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] A clue to non-toxic strategy to HIV eradication: “Lock-in and apoptosis”2017
Author(s)
Hiroshi Tateishi, Kazuaki Monde, Kensaku Anraku, Ryoko Koga, Halil I Ciftci, Hasan DeMirci, Taishi Higashi, Keiichi Motoyama, Hidetoshi Arima, Masami Otsuka, Mikako Fujita
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Journal Title
Scientific Reports
Volume: 8957
Pages: 8957
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Synthesis, Computational Study, and Evaluation of in vitro Antimicrobial, Antibiofilm, and Anticancer Activities of New Sulfanyl Aminonaphthoquinone Derivatives2017
Author(s)
Nilufer Bayrak, Hatice Yildirim, Amac Fatih Tuyun, Emel Mataraci Kara, Berna Ozbek Celik, Girish Kumar Gupta, Halil I. Ciftci, Mikako Fujita, Masami Otsuka, Hamid R. Nasiri
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Journal Title
Letters in Drug Design & Discovery,
Volume: 14
Pages: 647-661
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Presentation] Development of Anti-HIV and Anti-Cancer Drug Candidates2017
Author(s)
Halil I Ciftci, Kotaro Koiwai, Hiroshi Tateishi, Mehlika D Altintop, Mohamed O Radwan, Belgin Sever, Taha FS Ali, Ryoko Koga, Zafer A Kaplancikli, Ahmet Ozdemir, Fumiaki Yumoto, Toshiya Senda, Mikako Fujita, Masami Otsuka
Organizer
Turkish Japanese Workshop on Bioorganic Medicinal Chemistry and Natural Products
Int'l Joint Research
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