2018 Fiscal Year Annual Research Report
Identification of nuclear and cytoplasmic genes for overcoming crossing incompatibility of the Capsicum genus
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16H02535
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| Research Institution | Kindai University |
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Principal Investigator |
細川 宗孝 近畿大学, 農学部, 教授 (40301246)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大野 翔 京都大学, 農学研究科, 助教 (10722001)
白澤 健太 公益財団法人かずさDNA研究所, 先端研究開発部, 主任研究員 (60527026)
安井 康夫 京都大学, 農学研究科, 助教 (70293917)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | トウガラシ / 交雑障壁 / 種間交雑不和合性 / ミトコンドリア / Capsicum annuum / Capsicum chinense |
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| Outline of Annual Research Achievements |
・B遺伝子の特定：前年までに200Mbに特定したが、20組以上のdCAPsマーカーを作成し、PCRを行うことで、候補領域を数Mbまで狭めることができた。現在は本研究を継続するとともに、SNP impactによってCapsicum chinenseとの間で、交雑和合と交雑不和合の品種間で異なる遺伝子を探索し、いくつかの候補遺伝子を得ている。
・A遺伝子の特定：A遺伝子はC. chinenseとC. annuumとの間で異なるものを探索する必要があるが、遺伝子が大きく異なるので、まずはdCAPsでより候補領域を狭めることとして交雑集団を増やしているところである。また、最終年度の解析に向け、マッピング集団を準備している。
・ミトコンドリア：カリフォルニアワンダーの細胞質（ミトコンドリア）は交雑不和合性を打破する可能性がある。そこで、カリフォルニアワンダーのミトコンドリアの全ゲノムシークエンスを作成し、交雑不和合性品種と比較する必要がある。本年度はリファレンスとして用いるため、カリフォルニアワンダーの全ゲノムシークエンスを行い、解析を終了させた。
・RNase：C. chinenseとC. annuumの雑種を育成する一つの目的として、RNase活性の強さがあり、この形質は果実収穫後の植物残渣の二次利用を可能とするものである。そこで、RNase座を特定することを目的として実験を行った。前年度の科研費によって候補遺伝子の特定を行った。本年度の科研費では、RNaseの配列を特定し、品種間で比較した。
・その他：かずさDNA研究所では種間交雑による葉の形態異常がどちらの親ゲノム由来であるのかを調査するパイプラインを開発・発展させている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
A,B遺伝子の候補領域は第7、第10染色体で決定したが、その絞り込みが順調に進んでいる。残り1年の研究でいくつかの遺伝子が特定できるのではないかと考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
A遺伝子の特定が難航することが予想される。現在、A遺伝子を特定するために、マッピング集団を工夫して作成している。共同研究者と、年度内にはB遺伝子に集中するべきか、A遺伝子も特定するかを話し合っている。論文として発表する際には2遺伝子の特定があった方が大きなインパクトを期待できるが、片側だけでも十分に論文になると思われる。4月中には結論を出したい。
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