2018 Fiscal Year Annual Research Report
Therapeutic targetable fusion genes in ovarian carcinoma
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16H06267
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
吉原 弘祐 新潟大学, 医歯学系, 研究准教授 (40547535)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 融合遺伝子 / トランスレーショナルリサーチ / ゲノム医学 / 卵巣癌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
申請者の所属する施設にすでに保管され、インフォームドコンセントにより同意の得られている婦人科癌症例の凍結癌組織より、Invitrogen 社のTRIzol を用いてtotal RNA を抽出、品質を確認後、Illumina 社のTruSeq RNA サンプル調整キットを用い、ライブラリー作成後Illumina HiSeq2500でペアエンドRNA シークエンス(100bp)を実施した。卵巣明細胞癌57症例のRNAシークエンスデータを用いて、卵巣明細胞癌の融合遺伝子リストを作成した。融合遺伝子の中でキナーゼ融合遺伝子など治療標的になるものを抽出したところ、10症例（17.5%）で少なくとも一つは治療標的融合遺伝子を有していることを明らかにした。また融合遺伝子のneoantigenとしての意義を検討するために、INTEGRATEを実施した。その結果、18症例（31.6%）で少なくとも一つはneoantigenになりうる融合遺伝子を有していることを突き止めた。卵巣明細胞癌20症例の全エクソンシークエンスの結果から、各症例における遺伝子変異頻度は他の癌腫と比較して高くなく、卵巣明細胞癌においては遺伝子変異だけでなく融合遺伝子がneoantigen発生メカニズムとして重要であることが示唆された。
また、卵巣肉腫に対する全エクソンシークエンス ＋ RNAシークエンスによるゲノム・トランスクリプトーム解析を行い、ドライバー遺伝子候補として、NUTM1融合遺伝子・PRUNE遺伝子変異を同定し、NUT1-associated tumorであることを報告した。
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| Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Novel therapeutic strategy for cervical cancer harboring FGFR3-TACC3 fusions2018
Author(s)
Tamura R, Yoshihara K, Saito T, Ishimura R, Martinez-Ledesma JE, Xin H, Ishiguro T, Mori Y, Yamawaki K, Suda K, Sato S, Itamochi H, Motoyama T, Aoki Y, Okuda S, Casingal CR, Nakaoka H, Inoue I, Verhaak RGW, Komatsu M, Enomoto T
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Journal Title
Oncogenesis
Volume: 7
Pages: 4~4
DOI
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