Identification of alopecia areata gene by GWAS (3rd stage)

2018 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 16K10177
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Dermatology
• Research Institution: Juntendo University
• Principal Investigator: Ikeda Shigaku 順天堂大学, 医学部, 教授 (40193198)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 岡 晃 東海大学, 総合医学研究所, 講師 (80384866)
• Project Period (FY): 2016-04-01 – 2019-03-31
• Keywords: 円形脱毛症 / 遺伝子解析 / マイクロサテライトマーカー / 次世代シークエンサー / 遺伝子同定 / ゲノム編集 / ノックアウトマウス / マイクロアレイ

Outline of Final Research Achievements

By next-generation sequencing of 4 Mb interval at HLA-C locus on risk and non-risk haplotypes of alopecia areata (AA), we have identified only one non-synonymous single nucleotide variant (NSSNV) which is common among 5 risk haplotype. Then we have generated genome-edited mice by Crisper Cas9 system which is carrying mouse counterpart of this SNSNV. Surprisingly, 55% mice showed AA like patchy alopecia. Next we have generated knock-our mouse by Cre/lox p system of the gene, in which this SNSNV was identified. By water avoidance stress test, 27% of the knock-out mice showed AA like lesions.

Free Research Field

分子遺伝学、皮膚科学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

これら研究により、１）多因子性疾患の遺伝子解析にマイクロサテライトマーカー法が有用であること、２）本遺伝子とそのSNSNVによりAAの18％が惹起されることが判明したこと、３）本variantを有する患者群の解析によりAAのサブタイプが判明すること、４）そのタイプ特異的治療法の開発が可能となること、５）そのタイプ以外のAAサブタイプを同定し、更なる遺伝子同定に寄与し得る点、が有意義と思われる。