2017 Fiscal Year Research-status Report
単一細胞解析のための, 全ゲノム増幅技術の最適化の研究
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16K11106
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| Research Institution | Keio University |
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Principal Investigator |
佐藤 卓 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 助教 (40383898)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 全ゲノム増幅法 / single cell PCR / 着床前遺伝子診断 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
特に着床前遺伝子診断の実施を目的として, 単一細胞解析のための全ゲノム増幅法(WGA)の, 基礎的な研究を行っている. 各種WGAによるDNA増幅の遺伝子変異部位と近接する遺伝子多型におけるヘテロ接合性を解析し, 特に対立アリルの一方のみが増幅される現象であるアレルドロップアウト現象の出現頻度について, 原理の異なる, 市場で利用可能な複数の試薬を用いて解析を行っている. 現在までにmultiple displacement am plification(MDA)を原理にもつ遺伝子増幅法とPCR法をベースとするWGA(GenomePlex)およびその両者の複合型であるWGA(PicoPLEX法とMALBAC法)における比較を行っている.
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
概ね順調に進展している.
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| Strategy for Future Research Activity |
WGAのバイアスのない増幅の条件を検討するために, 増幅産物における遺伝子・染色体コピー数解析を行う. 解析には各種のマイクロアレイと次世代シーケンサの使用を検討している.
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| Causes of Carryover |
遺伝子増幅のバイアスに関する検討よりは, アリルドロップアウト等の単一細胞の遺伝子解析上の特有の問題点の観察に重点を置くことになったため, 高額な費用のかかる解析系の検討は, 当初の予定よりも遅れて進行して いる. 従って故に, 次年度使用額が生じている.
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