2017 Fiscal Year Annual Research Report
Comprehensive analysis of druggable tyrosine kinase in idiopathic interstitial pneumonia
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16K15458
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| Research Institution | Okayama University |
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Principal Investigator |
木浦 勝行 岡山大学, 大学病院, 教授 (10243502)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大橋 圭明 岡山大学, 大学病院, 講師 (60729193)
久保 寿夫 岡山大学, 大学病院, 助教 (90726928)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | 特発性肺線維症 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
マルチキナーゼ阻害剤であるニンテダニブは、特発性肺線維症の進行抑制効果があることが複数の第Ⅲ相試験で示されている。特発性肺線維症の進展にkinase遺伝子が関連している可能性があることから、次世代シーケンサーを用いて、特発性肺線維症肺と正常肺のkinase遺伝子発現について網羅的に比較検討を行った。RNAlaterで保存した特発性肺線維症肺13サンプルおよび正常肺（肺癌手術摘出肺の残余部）8サンプルからRNAを抽出し、SureSelect Human Kinome RNA Kit（Agilent Techonologies)を用いてライブラリを作成した。MiSeq（illimina）を用いてシーケンスを行い、特発性肺線維症肺において発現量に有意な差のあるkinase遺伝子を複数見出している。これらの遺伝子発現は蛋白レベル（免疫染色）でも確認を行い、概ねシーケンス結果と矛盾の無い結果であった。
ただし、様々な細胞を含む肺組織ブロックでの遺伝子発現解析では、特発性肺線維症肺と正常肺の細胞構成の違いが、遺伝子発現解析結果に大きく影響する事が判明した。この影響を取り除くためには、単一の細胞集団を抽出して、それぞれの細胞種ごとに解析を行う必要がある。慢性的な肺胞上皮の障害が特発性肺線維症のトリガーとなるとされていることから、今回は肺胞上皮に着目した。レーザーマイクロダイセクション法（LMD7000、Leica Microsystems）を用いて、特発性肺線維症および正常肺の肺胞上皮を切り出し、RNAを抽出した。抽出したRNAを用いてTruSeq RNA access（illumina）でライブラリを作成し、遺伝子発現解析を行った（HiSeq 4000、illimina）。シーケンスはすでに終了しており、データ解析も終了し論文作成中である。
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[Presentation] Acquired resistance to the third-generation EGFR inhibitor ASP8273 is associated with MET or NRAS gene amplifications in preclinical models2017
Author(s)
Kiichiro Ninomiya, Kadoaki Ohashi, Shuta Tomida, Hiroe Kayatani, Tomoki Tamura, Hisao Higo, Go Makimoto, Takashi Ninomiya, Toshio Kubo, Eiki Ichihara, Akiko Sato, Katsuyuki Hotta, Masahiro Tabata, Katsuyuki Kiura.
Organizer
AACR Annual Meeting 2017
Int'l Joint Research
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[Presentation] A comprehensive analysis of autopsied specimens and patient-derived cell lines in ALK-positive lung cancers with rapid acquired resistance to alectinib2017
Author(s)
Go Makimoto, Kadoaki Ohashi, Kazuya Nishii, Shuta Tomida, Hiroe Kayatani, Tomoki Tamura, Hisao Higo, Kiichiro Ninomiya, Takashi Ninomiya, Toshio Kubo, Eiki Ichihara, Akiko Sato, Katsuyuki Hotta, Masahiro Tabata, Katsuyuki Kiura
Organizer
AACR Annual Meeting 2017
Int'l Joint Research
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[Presentation] Clinical Characteristics of Japanese Candidates for Lung Transplant Due to Interstitial Lung Disease and Risk Factors for Early Death While on the Waiting List2017
Author(s)
Hisao Higo , Eiki Ichihara , Takeshi Kurosaki , Kentaroh Miyoshi , Toshio Kubo , Shinji Otani , Seiichiro Sugimoto , Masaomi Yamane , Nobuaki Miyahara , Katsuyuki Kiura , Takahiro Oto
Organizer
American Thoracic Society 2017 International Conference
Int'l Joint Research
