2017 Fiscal Year Research-status Report
固有種ニホンイシガメの遺伝的多様性の解明―種内系統間及び異種間交雑の影響について
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16K18607
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| Research Institution | Tokai University |
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Principal Investigator |
鈴木 大 東海大学, 生物学部, 講師 (90647489)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | ニホンイシガメ / 和歌山県 / 紀伊水道 / ミトコンドリアDNA / 核DNA / 遺伝的多様性 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ニホンイシガメ（Mauremys japonica）の遺伝的多様性の解明に向け，集団遺伝解析を行う必要がある．これまでに入手してきたサンプル地点のうち，特に個体数の少なかった地点の一つである和歌山県において，2017年9月から10月にかけてサンプリング調査を実施した．調査の結果，県中部地域の河川にて，ニホンイシガメを2個体捕獲することができた．同河川においては，クサガメ（M. reevesii）も数多く捕獲されたが，両種の交雑個体は未確認であった．
2017年度より，本研究代表者が所属研究機関を移ったが，それに伴い実験環境設備を整える必要が生じた．そこで，これまでに解析を済ませたサンプルに対して，移動先の実験設備（シーケンサーやPCR機等）を用いて，これまでと同様の実験ならびに解析を行った．改めて実験，解析して得られた結果は，これまでのものと違いは見られなかった．そのため，従来通りに，現所属の機器を用いて解析を行うことに問題は無いと判断した．その後，未解析の試料について，特にミトコンドリアDNAのチトクロムb遺伝子やD-loop領域，核DNAのC-mos遺伝子を中心にシーケンス等の解析を行なった．以上の結果より，入手済みの試料における塩基配列データは解析に十分な数得ることができた．
本年度の研究成果の一部について，第56回日本爬虫両棲類学会大会（熊本大学），ならびに科研プロジェクト（JSPS科研15K07233）報告会シンポジウム（岡山理科大学）において，口頭発表を実施した．
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
2017年度より研究代表者の所属機関が変更となった．これにより，当初予定していた実験機器が使えなくなったため，進捗が遅れている．特に，本研究の要である集団遺伝解析について，現所属機関に設置してあるシーケンサーが前所属機関のものよりも古い型であり，作業効率が低下したことが，研究進捗状況が遅れた主因である．なお，以上の背景から，科学研究費助成事業（学術研究助成基金助成金）補助事業期間延長承認申請書を提出し，2018年度へ延長して本研究を実施させていただけることになった．
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| Strategy for Future Research Activity |
試料を保管する冷凍庫などの設備については，2017年度に購入，設置を行なった．一方で，解析に必要な試料については十分な数，確保することができた．
2018年度は，遺伝子解析，特にマイクロサテライト解析を実施する．得られた結果をまとめ，学術論文としての発表を目指す．
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| Causes of Carryover |
2017年度より研究代表者の所属機関が変更になり，申請時に利用を計画していた実験機器の利用が困難になるなど，研究の進捗が遅れた．2017年度は実験環境の確認やその構築に時間を費やしたため，当初の実験計画を進めることが困難になった．以上の背景から，次年度使用額が生じた．
2018年度は，すでに解析に必要な量の試料を得ることができたため，遺伝子解析，特にマイクロサテライト解析を行う．シーケンサーの状態によっては，外部機関に解析を委託するなどの判断を早めに行い，計画していた実験について今年度中に全て完了することを目指す．
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Research Products
(4 results)
