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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Soil gnotobiology: Microbial transplantation beween soils

Research Project

Project/Area Number 16K18665
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

加藤 広海  東北大学, 生命科学研究科, 助教 (90727265)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords細菌叢形成 / 黒ボク土 / 褐色森林土 / Swarming / ノトバイオロジー
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、土壌から抽出された微生物集団を異なる土壌に移植することで、細菌叢形成に影響を与える生物的因子と環境因子の特定を試みた。黒ボク土(A土)および褐色森林土(B土)の2種類の土壌を段階的に混合することで、両土壌を連続的に繋ぐ人工土壌を創出した。それぞれの滅菌混合土壌にA土またはB土から抽出した微生物集団を移植することで、新たに定着する細菌叢にどのような変化が起きるのかを観察した。移植後の生菌数を測定した結果、全ての混合土壌において微生物集団は良好な定着性を示し、半年間以上は有機物添加無しで10の8乗(CFU/g)を超える高い菌密度を維持できることがわかった。またA土の含有率が高い混合土壌ほど、(1)生菌数が高くなる、(2)放線菌群の占める割合が高くなる、などの傾向が観察された。AB両土壌から抽出された微生物集団のどちらを移植した際にも同様な結果が得られたことから、細菌叢形成における土壌環境因子の強い影響が示唆された。さらにA土に移植された微生物集団は長期間経過しても元の細菌叢構造を再構成できないことが明らかとなり、A土特有の細菌叢の復元には何らかの要素が必要であることが示された。一方で、元の細菌叢を属レベルで再構成できるB土では、swarmingやglidingといった移動性の高い分類群が移植後に優占することから、これら菌群の増殖が後の細菌叢形成に重要であると予想された。そこで土壌環境からのswarming細菌を分離して様々な細菌株と共培養を行なった結果、swarming細菌は相手株の土壌における生育を促進する効果があることが認められた。これらの結果は、細菌群間の逐次的増殖関係性(Sequential growth network: SGN)が細菌叢形成において重要であることを示唆しており、将来的にSGNを利用した特定細菌叢への誘導技術が期待できる。

  • Research Products

    (13 results)

All 2019 2018

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (10 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Suppression of substrate inhibition in phenanthrene-degrading Mycobacterium by co-cultivation with a non-degrading Burkholderia strain.2019

    • Author(s)
      Natsumi Ogawa, Hiromi Kato, Kouhei Kishida, Eikichi Ichihashi, Taichiro Ishige, Hirofumi Yoshikawa, Yuji Nagata, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1099/mic.0.000801

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 汚染物質分解コンソーシアムにおけるキープレイヤーとオーディエンス2018

    • Author(s)
      加藤 広海,小川なつみ,津田 雅孝,永田 裕二
    • Journal Title

      環境バイオテクノロジー学会誌

      Volume: 18 Pages: 15-20

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Mycobacterium sp. EPa45株におけるフェナントレン分解関連遺伝子群の転写解析2019

    • Author(s)
      市橋 永吉、小川 なつみ、加藤 広海、岸田 康平、野々山 翔太、永田 裕二、大坪 嘉行、津田 雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Mycobacterium sp. EPa45株の生育阻害因子の解析2019

    • Author(s)
      堀川慧太、池内倫子、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
  • [Presentation] 異なる土壌間における微生物集団の移植実験2019

    • Author(s)
      加藤 広海、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] 難培養性細菌の培養における細胞外多糖の重要性2019

    • Author(s)
      高橋 紳八、加藤 広海、永田 裕二、大塚 重人、大坪 嘉行、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] 人工汚染化土壌からの有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子取得の試み2019

    • Author(s)
      蘇立俊、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] 細菌間の接近と拡散が有機塩素系殺虫剤の分解コミュニティに与える影響2019

    • Author(s)
      羽賀千晃、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] アルコールデヒドロゲナーゼAdhX遺伝子依存的貧栄養環境適応機構の普遍性2019

    • Author(s)
      酒井洋範、稲葉慎之介、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] 土壌細菌叢の形成プロセスにおける再現性2018

    • Author(s)
      加藤 広海、森 宙史、黒川 顕、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第32回大会
  • [Presentation] Construction of Efficient Organochlorine Pesticide Degraders by Using an Artificial Gene Cluster2018

    • Author(s)
      Lijun Su, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
    • Organizer
      日本微生物生態学会第32回大会
  • [Presentation] 有機塩素系農薬の分解細菌コミュニティを構成する細菌間の関係性2018

    • Author(s)
      羽賀千晃、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝,永田裕二
    • Organizer
      第36回農薬環境科学研究会
  • [Book] DNA Traffic in the Environment2019

    • Author(s)
      Yuji Nagata, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, et al.
    • Total Pages
      278
    • Publisher
      Springer
    • ISBN
      978-981-13-3411-5

URL: 

Published: 2019-12-27  

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