2018 Fiscal Year Research-status Report
ウイルスゲノムとヒトゲノムとの相互作用によるガン発症メカニズム解明
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16KT0112
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| Research Institution | Nagasaki University |
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Principal Investigator |
吉浦 孝一郎 長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 教授 (00304931)
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| Project Period (FY) |
2016-07-19 – 2020-03-31
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| Keywords | HPVウイルス / HPV型 / ヒトゲノム / 相互作用 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は，ヒトパピローマウイルス（HPV: human papilloma virus）による子宮頸がん発症過程の解明による予測システムの開発と，その過程への介入による発症予防のための基礎研究を行うことで，以下の項目を目標として挙げた。
１．子宮頸がん検診で得られたパップスメアからヒトパピローマウイルスゲノムの塩基配列決定を行う。２．L1タンパクによるHPVの系統分類をおこない，L1タンパクと相関する初期遺伝子型を探索する。３．子宮頸がん（上皮内ガン等の初期がん）患者から得られたパップスメアを利用して，がん化組織特異的なウイルスゲノムの integration site の探索を行う。４．Exome 解析による高odds比 発症関連バリアント探索を行う。
平成30年度までに，パップスメアから抽出したDNA約325例の HPVの型判定（ウイルスゲノム塩基配列決定）とTP53, NOTCH1 などの子宮頸がん関連遺伝子約10遺伝子（ヒト遺伝子）の塩基配列決定を終了した。現在 DNA 解析を進めている。L1領域のみを使った検査としての HPVタイピング法と型判定の結果には大きな違いはなさそうであったが，パップスメア内のHPVのコピー数には大きな違いがある。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
本研究において，HPV型と患者の最終的転帰が必要である。HPV型判定については，実験室での作業であり順調に進んだが，患者転帰の情報は個人情報であるため，これに時間を要している。
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| Strategy for Future Research Activity |
HPVのコピー数や変異と予後（５～１０年後の帰結）についての相関について解析を進め，パップスメアからの HPV ウイルスゲノム解析による予後判定法確立，ヒトゲノム内の integration site 同定による予後判定法確立，ワクチン候補となる共通領域検索を進めていきたい。
特に，患者転帰とHPV型，HPVゲノムシーケンスとの相関を確認する必要があり，早々に患者転帰情報を収集する。
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| Causes of Carryover |
本年度は，患者情報が収集出来た後のゲノムシーケンス，解析費用として考えていた分が，患者転帰情報の収集に手間取り，予算消化が進まず，翌年へ予算の繰り越しとなった。
一年間の研究期間延長が認められており，最終年度に向けて，これまでの結果を統合して目標達成を目指す。
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[Journal Article] A Hot-spot Mutation in CDC42 (p.Tyr64Cys) and Novel Phenotypes in a Third Patient with Takenouchi-Kosaki Syndrome.2018
Author(s)
Motokawa M, Watanabe S, Nakatomi A, Kondoh T, Matsumoto T, Morifuji K, Sawada H, Nishimura T, Nunoi H, Yoshiura KI, Moriuchi H, Dateki S.
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Journal Title
J Hum Genet
Volume: 63
Pages: 387-390
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] MicroRNA-204-3p inhibits lipopolysaccharide-induced cytokines in familial Mediterranean fever via the phosphoinositide 3-kinase γ pathway.2018
Author(s)
Koga T, Migita K, Sato T, Sato S, Umeda M, Nonaka F, Fukui S, Kawashiri SY, Iwamoto N, Ichinose K, Tamai M, Nakamura H, Origuchi T, Ueki Y, Masumoto J, Agematsu K, Yachie A, Yoshiura KI, Eguchi K, Kawakami A.
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Journal Title
Rheumatology (Oxford)
Volume: 57
Pages: 718-726
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] A novel heterozygous GLI2 mutation in a patient with congenital urethral stricture and renal hypoplasia/dysplasia leading to end-stage renal failure.2018
Author(s)
Shirakawa T, Nakashima Y, Watanabe S, Harada S, Kinoshita M, Kihara T, Hamasaki Y, Shishido S, Yoshiura KI, Moriuchi H, Dateki S.
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Journal Title
CEN Case Rep.
Volume: 7
Pages: 94-97
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Clonal dynamics in a case of acute monoblastic leukemia that later developed myeloproliferative neoplasm.2018
Author(s)
Sato S, Itonaga H, Taguchi M, Sawayama Y, Imanishi D, Tsushima H, Hata T, Moriuchi Y, Mishima H, Kinoshita A, Yoshiura KI, Miyazaki Y.
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Journal Title
Int J Hematol.
Volume: 108
Pages: 213-217
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Patients with SATB2-associated syndrome exhibiting multiple odontomas.2018
Author(s)
Kikuiri T, Mishima H, Imura H, Suzuki S, Matsuzawa Y, Nakamura T, Fukumoto S, Yoshimura Y, Watanabe S, Kinoshita A, Yamada T, Shindoh M, Sugita Y, Maeda H, Yawaka Y, Mikoya T, Natsume N, Yoshiura KI.
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Journal Title
Am J Med Genet A.
Volume: 176
Pages: 2614-2622
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Comprehensive methylation analysis of imprinting-associated differentially methylated regions in colorectal cancer.2018
Author(s)
Hidaka H, Higashimoto K, Aoki S, Mishima H, Hayashida C, Maeda T, Koga Y, Yatsuki H, Joh K, Noshiro H, Iwakiri R, Kawaguchi A, Yoshiura KI, Fujimoto K, Soejima H.
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Journal Title
Clin Epigenetics
Volume: 10
Pages: 150only
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Analysis of mice varying a novel mutation in a proteasome subunit gene identified in an autoinflammatory disease -Proteasome-associated autoinflammation and immunodeficiency disease (PRAID).2018
Author(s)
Toshiya Ozasa, Hiroaki Hemmi, Akira Kinoshita, Takashi Kato, Takashi Orimo, Izumi Sasaki, Yuri Fukuda-Ohta, Noriko Kinjo, Koh-Ichiro Yoshiura, Tsunehiro Mizushima, Nobuo Kanazawa, Tsuneyasu Kaisho.
Organizer
第47回日本免疫学会学術集会
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[Presentation] Impaired development of dendritic cells in proteasome subunit mutant mice．2018
Author(s)
Hiroaki Hemmi, Toshiya Ozasa, Akira Kinoshita, Takashi Kato, Takashi Orimo, Izumi Sasaki, Yuri Fukuda-Ohta, Noriko Kinjo, Koh-Ichiro Yoshiura, Tsunehiro Mizushima, Nobuo Kanazawa, Tsuneyasu Kaisho.
Organizer
第47回日本免疫学会学術集会
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