2005 Fiscal Year Annual Research Report
腸管出血性大腸菌を中心とした腸管感染菌の病原性ゲノム基盤の解明と臨床応用
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17019058
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| Research Institution | University of Miyazaki |
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Principal Investigator |
林 哲也 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 教授 (10173014)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
小椋 義俊 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 助手 (40363585)
大岡 唯祐 宮崎大学, 医学部, 助手 (50363594)
戸邉 亨 大阪大学, 医学系研究科, 助教授 (70207596)
飯田 哲也 大阪大学, 微生物病研究科, 助教授 (90221746)
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| Keywords | 病原性大腸菌 / 腸炎ビブリオ / 多様性 / 病原性 / 常在菌 / III型分泌系 / 発現制御 / バクテリオファージ |
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| Research Abstract |
本研究では、全ゲノム情報に基づいたO157およびnon-O157腸管出血性大腸菌(EHEC)の病原性とゲノム多様性の解明、他の病原性大腸菌や腸炎ビブリオなどの腸管病原菌との比較解析、腸管常在細菌との相互作用の解明をめざした腸管内常在細菌叢のゲノム解析に取り組んでいる。本年度の主な成果は以下の通りである。
1.EHEC:(1)III型分泌系(TTSS)のエフェクターとして37種類の蛋白質を同定した。(2)マイクロアレイ解析により、LEE遺伝子群の転写調節因子であるPchAとLerの支配下にある遺伝子を多数同定した。また、その制御に関与するcis-elementを見出した。(3)RcsCDB二成分制御系がLEE遺伝子群の発現調節に関与していることを見出し、これを媒介するO157特異的制御遺伝子(grvA)を新たに同定した。また、LEE遺伝子群の発現が緊縮応答によっても制御されていることを明らかにした。(4)O157のゲノム多様性解析が終了し、O157菌株間に見られるゲノム多様性がプロファージとISのバリエーションやこれらを介したゲノムの再編性によることを明らかにした。また、その成果を応用して迅速菌株識別法の開発を行い、プロトタイプが完成した。(5)O26・O111・O103 EHECのO157とのゲノム比較解析を行い、異なる血清型間では、遺伝子レパートリーに大きな違いがあることを見出した。(6)O26とO111のゲノム配列決定が終了した。
2.その他:(1)腸管病原性大腸菌(EPEC)B171株の菌株特異領域の網羅的な同定に成功した。(2)腸炎ビブリオの大染色体と小染色体上に存在する2種類のTTSS(TTSS-1とTTSS-2)が、それぞれ細胞毒性と下痢原性に関与することを見いだした。また、各TTSSにはエフェクター選択性があることを見出した。さらに、環境株と患者由来株のマイクロアレイ解析により、TTSS-2領域が患者由来株にのみに存在することを明らかにした。(3)他のビブリオ属細菌も2つの染色体をもつことを明らかにした。(4)腸炎ビブリオの鞭毛の発現制御に関わる新規のH-NS様蛋白質の同定に成功した。(5)ボツリヌス菌のC型神経毒素伝達ファージのゲノム解析を行い論文発表した。(6)基盤ゲノム・服部班らと共同で、常在細菌叢のゲノム解析を開始した。
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