2007 Fiscal Year Annual Research Report
腸管出血性大腸菌を中心とした腸管感染菌の病原性ゲノム基盤の解明と臨床応用
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17019058
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| Research Institution | University of Miyazaki |
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Principal Investigator |
林 哲也 University of Miyazaki, フロンティア科学実験総合センター, 教授 (10173014)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
小椋 義俊 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 助教 (40363585)
大岡 唯祐 宮崎大学, 医学部, 助教 (50363594)
戸邉 亨 大阪大学, 医学系研究科, 准教授 (70207596)
飯田 哲也 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (90221746)
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| Keywords | 病原性大腸菌 / 腸炎ビブリオ / 疫学ツールの開発 / 病原性 / 腸内常在菌叢 / III型分泌系 / 発現制御 / O抗原合成遺伝子 |
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| Research Abstract |
本研究では、全ゲノム情報に基づいたO157およびnon-O157腸管出血性大腸菌(EHEC)の病原性とゲノム多様性の解明、他の病原性大腸菌や腸炎ビブリオなどの腸管病原菌との比較解析、および腸管常在細菌との相互作用の解明をめざした腸管内常在細菌叢のゲノム解析に取り組んでいる。本年度の主な成果は以下の通りである。
1.EHEC:
(1)タイリングアレイを用いたPchタンパク質のゲノム結合部位の解析を行い、PchがIII型分泌系(TTSS)遺伝子群などの外来性遺伝子領域に選択的に結合し、その発現を制御していることを明らかにした。
(2)O157のゲノム多様性解析の成果を応用して開発した迅速菌株識別キットが完成し、TOYOBO(株)よりマーケッティング販売を開始した。
(3)昨年度までに配列決定を終了したO26,O111,O103の全ゲノム配列のアノーテーション、プロファージの同定、ISの同定など、基本的な解析作業を行い、Ol57と同様に、これらのnon-O157EHECも多数のプロファージやintegrativeelementsを獲得しており、それらのエレメント上に、O157のものとよく似た病原遺伝子群が存在していることが明らかになった。
2.その他:
(1)EPEC O55株のO抗原合成遺伝子領域の比較ゲノム解析を行い、O55:H7株には2つの異なる系統が存在すること、またO55抗原の獲得にはO抗原合成遺伝子領域を含む40kbものゲノム領域の組換えが関与していることを明らかにした。
(2)腸炎ビブリオの大染色体と小染色体上に存在する2種類のTTSS(TTSS-1とTTSS-2)のうち、TTSS-2の発現制御に関わる2種類の蛋白質を同定した。
(3)基盤ゲノム・服部班らと共同で、日本人13名の腸管フローラのメタゲノム解析を行い、成人型フローラと乳児型フローラの違いやその特徴などを明らかにした。また、各タイプのフローラで共通に増加している遺伝子ファミリーを同定した。
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