2007 Fiscal Year Annual Research Report
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17019063
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| Research Institution | Tokai University |
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Principal Investigator |
猪子 英俊 Tokai University, 医学部, 教授 (10101932)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
間野 修平 名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 准教授 (20372948)
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| Keywords | GWAS / マイクロサテライト / 相関解析 / 尋常性乾鮮 / 同祖性 / ネットワーク解析 / NFKB alternative pathway / 破骨細胞 |
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| Research Abstract |
我々が開発した3万個のマイクロサテライトを用いたゲノムワイドな相関解析による遺伝子マッピング法を評価・改善・応用と機能解析を進めるため研究を遂行し、次のような成果・進捗をえた。
1.遺伝子マッピングの検出力を高めるために、4回の独立集団の関連解析やpooling法の改善などにより3万個のマイクロサテライトを用いたゲノムワイドな相関解析の戦略を確立した。本法を用いて新たに尋常性乾癬とベーチェット病について3個の感受性遺伝子を同定し、またX線感受性については、第3次スクリーニングまで進捗し、30個あまりの候補遺伝子まで絞り込んだ。
2.多因子性形質に関する新しい遺伝子マッピング法として考えられている、集団中の個体間の同祖性IBD(identical by descent)の推定による連鎖解析を行うLander-Green algorithm 法の拡張として、一般集団を対象とする一般化推定方程式で行う方法の開発を試みた。その結果、例えば日本人集団各200入について、ゲノムワイドレベルで1,000個のマイクロサテライトの多型情報を検索することにより、多因子性形質の新しい遺伝子マッピング法を現在の相関解析に代わる、あるいは補完する検出力の高い方法として開発した。本法を用いて、モデル系として尋常性乾癬の感受性遺伝子のマッピングに応用し、その有効性が確認された。
3.1.で遺伝学的に同定したリウマチ感受性遺伝子の一つであるNFkBIL1について、遺伝的要因から発症にいたるパスウェイ回路についてタンパク化学的解析を行い、破骨細胞におけるNFkBシグナル伝達系の一つであるalternative pathway NIK/p100経路のp52/RelB蛋白による転写調節機能の制御を通じて、NFkBIL1が破骨細胞の分化を誘導することにより、リウマチの発症に至ることを明らにし、マイクロサテライトの相関解析により遺伝学的に同定した感受性遺伝子が機能的にも発症に関わることを証明した。
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[Journal Article] Donner killer immunoglobulin-like receptor (KIR) genotype-patient cognate KIR lgand combination and antithymocyte globulin preadministration are critical factors in outcome of HLA-C-KIR ligand-mismatched T Cell-replete unrelated bone marrow transplantation.2008
Author(s)
Yabe, T・Matsuo, T・Hirayasu, K・Kashiwase, K・Kawamura-Ishii, S・Tanaka, H・Ogawa, A・Takanashi, M・Satake, M・Nakajima, K・Tokunaga, K・Inoko, H・Saji, H・Ogawa, S・Juji, T・Sasazuki, T・Kodera, Y・Morishima
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Journal Title
Biology of Blood and Marrow Transplantation (BBMT) 14
Pages: 75-87
Peer Reviewed
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[Journal Article] Synergistic association of mitochondrial uncoupling (UCP) genes with schizophrenia.2007
Author(s)
Yasuno, K・Ando, S・Misumi, S・Makino, S・Kulski, JK・Muratake, T・Kaneko, N・Amagane, H・Someya, T・Inoko, H・Suga, H・Kanemoto, K・Tamiya, G
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Journal Title
Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet ochem 144
Pages: 250-253
Peer Reviewed
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[Journal Article] Two critical genes (HLA-DRB1 and ABCF1)in the HLA region are associated with the susceptibility to autoimmune pancreatitis.2007
Author(s)
Ota, M・Katsuyama, Y・Hamano, H・Umemura, T・Kimura, A・Yoshizawa, K・Kiyosawa, K・Fukushima, H・Bahram, S・Inoko, H・Kawa, S
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Journal Title
Immunogenetics 59
Pages: 45-52
Peer Reviewed
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[Journal Article] Mapping of susceptibility and protective loci for acute GVHD in unrelated HLA-matched bone marrow transplantation donors and recipients using 155 microsatellite markers on cheromosome 222007
Author(s)
Kikuchi, T・Naruse, TK・Onizuka, M・Li, S・Kimura, T・Oka, A・Morishima, Y・Kulshi, JK・Ichimiya, S・Sato, N・Inoko, H
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Journal Title
Immunogenetics 59
Pages: 99-108
Peer Reviewed
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[Journal Article] High-resolution mapping for essential hypertension using microsatellite markers.2007
Author(s)
Yatsu, K・Mizuki, N・Hirawa, N・Oka, A・Itoh, N・Yamane, T・Ogawa, M・Shiwa, T・Tabara, Y・Ohno, S・Soma, M・Hata, A・Nakao, K・Ueshima, H・Ogihara, T・Tomoike, H・Miki, T・Kimura, A・Mano, S・Kulshi, JK・Umemura, S・Inoko, H
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Journal Title
Hypertension 49
Pages: 446-452
Peer Reviewed
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[Journal Article] Effects of HLA allele and killer immunoglobulin-like receptor ligand matching on clinical outcome in leukemia patients undergoing transplantation with T-cell-replete marrow from an unrelated donor.2007
Author(s)
Morishima, Y・Yabe, T・Matsuo, K・Kashiwase, K・Inoko, H・Saji, H・Yamamoto, K・Maruya, E・Akatsuka, Y・Onizuka, M・Sakamaki, H・Sao, H・Ogawa, S・Kato, S・Juji, T・Sasazuki, T・Kodera, Y
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Journal Title
Biol Blood Marrow Transplant 13
Pages: 315-328
Peer Reviewed
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[Journal Article] Alternative splicing due to an intronic SNP in HMSD generates a novel minor histocompatibility antigen.2007
Author(s)
Kawase, T・Akatsuka, Y・Torikai, H・Morishima, S・Oka, A・Tsujimura, A・Miyazaki, M・Tsujimura, K・Miyamura, K・Ogawa, S・Inoko, H・Morishima, Y・Kodera, Y・Kuzushima, K・Takahashi, T
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Journal Title
Blood 110
Pages: 1055-1063
Peer Reviewed
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[Journal Article] The COL1A1 gene and high myopia susceptibility in Japanese.2007
Author(s)
Inamori, Y・Ota, M・Inoko, H・Okada, E・Nishizaki, R・Shiota, T・Mok, J・Oka, A・Ohno, S・Mizuki, N.
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Journal Title
Hum Genet 112
Pages: 151-157
Peer Reviewed
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[Journal Article] Human leukocyte antigen may predict outcome of primary recurrent spontaneous abortion treated with paternal lymphocyte alloimmunization therapy.2007
Author(s)
Kano, T・Mori, T・Furudono, M・Ishikawa, H・Watanabe, H・Kikkawa, E・Warita, T・Onizuka, M・Takahashi, M・Maeda, Y・Naruse, T・Inoko, H・Kimura, A
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Journal Title
AMERICAN JOURNAL OF REPRODUCTIVE IMMUNOLOGY 58
Pages: 383-387
Peer Reviewed
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[Journal Article] A single nucleotide polymorphism analysis of the LAMAAl gene in Japanese patients with high myopia.2007
Author(s)
Sasaki, S・Ota, M・Nishizuka, R・Okada, E・Mok, J・Kimura, T・Oka, A・Katsuyama, Y・Ohono, S・Inoko, H・Mizuki, N
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Journal Title
Clinical Opthalmology 1
Pages: 289-295
Peer Reviewed
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[Journal Article] Lack of association with high myopia and the MYP2 locus in the Japanese population by high resolution analysis on chromosome 18.2007
Author(s)
Yamane, T・Mok, J・Nishizuka, R・Oka, A・Nishizaki, R・Meguro, A・Yonemoto, J・Kulski, JK・Ohono, S・Inoko, H・Mizuki, N
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Journal Title
Clinical Opthalmology 1
Pages: 311-316
Peer Reviewed
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[Presentation] ニワトリMHC領域におけるゲノム多様性2007
Author(s)
細道一善、椎名隆、鈴木進悟、Ronald, Goto 、西堀正英、半深恵、Mareia, M, MIUer 、猪子英俊
Organizer
第30回日本分子生物学会、第80回日本生化学会合同大会
Place of Presentation
パシフィコ横浜
Year and Date
20071211-15
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[Remarks] 研究室のweb site
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