Molecular mechanism of the clock molecular machinery

2007 Fiscal Year Final Research Report Summary

• Project/Area Number: 17207001
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Genetics/Genome dynamics
• Research Institution: Nagoya University
• Principal Investigator: ISHIURA Masahiro Nagoya University, Cenhr for Gene Reseamh, Professor (20132730)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): IHARA Kunio Nagoya University, Center for Gene Reseamh.Reseamh, Assistant Professor (90223297) ; ITO Sigeru Nagoya University, Graduate Schoolof Science, Professor (40108634) ; NAMBA Keiichi Osaka University, Graduate SclnolofFrontierFrience, Professor, 教授 (30346142)
• Project Period (FY): 2005 – 2007
• Keywords: Biological clock / Clock gene / KaiB / KaiC / ATPase / Pex / Cyanobacteria / Chlamydomonas

Research Abstract

We developed two kinds of automated bioluminescence-monitoring apparatuses and the bioluminescence rhythm-analyzing program RAP.
In cyanobacteria, we established the followings : 1)The N-terminal domain of clock protein KaiC is involved in the hexamerization of KaiC, and the C-terminal domain is involved in the inter-subunit phosphorylation of kaiC.2)KaiC has extremely weak ATPase activity, and the activity is enhanced by KaiA and is repressed by the phosphorylation of KaiC. Both the N-terminal and C-terminal domain proteins of KaiC have ATPase activity. KaiC ATPase activity is temperature-compensated, but the lack of phosphorylation sites in KaiC results in the loss of the temperature compensation.3)We determined the crystal structure of KaiB. Based on the atomic structure, we predicted important substructures and functional residues of KaiB that are involved in the clock oscillation of the clock machinery and confirmed their importance.4)We also determined the crystal structure of Pex, which is one of major components of the circadian input pathway of light. Based on the atomic structure, we predicted the functional residues of Pex that are involved in the interaction with DNA and confirmed their importance.5)Using DNA microarrays, we identified circadian-regulated genes and clarified their expression patterns.
In Chlamydomonas, we developed a bioluminescence-rhythm-monitoring system of chloroplasts, isolated various types of rhythm mutants, and then identified clock genes and clock-related genes. Some of the clock genes share common motifs with higher plant clock genes, and others are specific to Chlamydomonas.
In Arabidopsis, we cloned "a true clock gene" in the higher plant, PHYTOCLOCK 1.

Research Products

• [Journal Article] A systematic forward genetic analysis identified components of the Chlamydomonas circadian system. (2008)
  • Author(s): Matsuo, et. al.
  • Journal Title: Genes Dev. 22 Pages: 918-930
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] ATPase activity and its temperature compensation of the cyanobacterial clock protein KaiC. (2008)
  • Author(s): Murakami, et. al.
  • Journal Title: Genes Cells 13 Pages: 387-395
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A systematic forward genetic analysis identified components of the Chlamydomonas circadian system (2008)
  • Author(s): Matsuo, T, Okamoto, K, Onai, K, Niwa, Y, Shimogawara, K, Ishiura, M
  • Journal Title: Genes Dev 22 Pages: 918-930
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] ATPase activity and its temperature compensation of the cyanobacterial clock protein KaiC (2008)
  • Author(s): Murakami, R, Miyake, A, Iwase, R, Hayashi, F, Uzumaki, T, Ishium, M
  • Journal Title: Genes Cells 13 Pages: 387-395
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] The circadian clock-related gene pex regulates a negative cis element in the kaiA promoter region. (2007)
  • Author(s): Kutsuna, et. al.
  • Journal Title: J. Bacteriol. 189 Pages: 7690-7696
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A compact multi-channel apparatus for automated real-time monitoring of bioluminescence. (2007)
  • Author(s): Okamoto, et. al.
  • Journal Title: J. Biochem. Biophys. Methods 70 Pages: 535-553
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A compact multi-channel apparatus for automated real-time monitoring of bioluminescence (2007)
  • Author(s): Okamoto, K, Ishiura, M, Torii, T, Aoki, S
  • Journal Title: J Biochem Biophys Methods 70 Pages: 535-553
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] The circadian clock-related gene pex regulates a negative cis element in the kaiA promoter region (2007)
  • Author(s): Kutsuna, S, Kondo, T, Ikegami, H, Uzumaki, T, Katayama, M, Ishiura, M
  • Journal Title: J Bacteriol 189 Pages: 7690-7696
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] Real-time monitoring of chloroplast gene expression by aluciferase reporter: evidence for nuclear regulation of chloroplast circadian period. (2006)
  • Author(s): Matsuo, T., Onai, K., Okamoto, K., Ito, G., Minagawa, J, Ishiura, M
  • Journal Title: Mol. Cell. Biol. 26 Pages: 863-870
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Hexamerization by the N-terminal domain and intersubunit phosphorylation by the C-terminal domain of cyanobacterial circadian clock protein KaiC. (2006)
  • Author(s): Hayashi, F., Iwase, R., Uzumaki, T., Ishiura, M
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun. 348 Pages: 864-872
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Real-time monitoring of chloroplast gene expression by a luciferase reporter : evidence for nuclear regulation of chloroplast circadian period (2006)
  • Author(s): Matsuo, T., Onai, K., Okamoto, K., Ito, G., Minagawa, J, Ishium, M
  • Journal Title: Mol Cell Biol 26 Pages: 863-870
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] Hexamerization by the N-terminal domain and intersubunit phosphorylation by the C-terminal domain of cyanobacterial circadian clock protein KaiC (2006)
  • Author(s): Hayashi, F., Iwase, R., Uzumaki, T., Ishium. M
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun 348 Pages: 864-872
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] Improvement of the bioluminescence reporter system for real-time monitoring of circadian rhythms in the cyanobacterium Synechosystis sp strain PCC 6803. (2005)
  • Author(s): Kucho K, Aoki K, Itoh S, Ishiura M.
  • Journal Title: Gene Genet. Sys. 80 Pages: 19-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Global Analysis of Circadian Expression in the cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC 6803 (2005)
  • Author(s): Kucho K, Okamoto K, Tsuchiya Y Nomura S, Nango M, Kanehisa M, Ishiura M.
  • Journal Title: J. Bacteriol 187 Pages: 2190-2199
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Identification of novel clock-regulated genes by cDNA macroarray analysis in Chlamydomonas reinhardtii. (2005)
  • Author(s): Kucho, K., Okamoto, K., Tabata, S., Fukuzawa, H., Ishiura, M
  • Journal Title: Plant Mol. Biol. 57 Pages: 889-906
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] An automated apparatus for the real-time monitoring of bioluminescence in plants (2005)
  • Author(s): Okamoto, K. Onai K., Ezaki, N., Ofuchi, T., Ishiura, M.
  • Journal Title: Anal. Biochem. 340 Pages: 187-192
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] RAP, an integrated program for monitoring bioluminescence and analyzing circadian rhythms in real time (2005)
  • Author(s): Okamoto, K., Onai, K., Ishiura, M.
  • Journal Title: Anal. Biochem. 340 Pages: 193-200
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Transcriptional regulation of the circadian clock operon kaiBC by upstream regions in cyanobacteria. (2005)
  • Author(s): Kutsuna S, Nakahira Y, Katayama M, Ishiura M, Kondo T.
  • Journal Title: Mol. Microbiol. 57 Pages: 1474-84
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A portable integrated automatic apparatus for the real-time monitoring of bioluminescence in plants. (2005)
  • Author(s): Okamoto, K., Onai, K., Furusawa, T., Ishiura, M
  • Journal Title: Plant Cell Environ. 28 Pages: 1305-1315
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] PHYTOCLOCK 1 encoding a novel GARP protein esstial for the Arabidopsis circadain clock. (2005)
  • Author(s): Onai K, Ishiura M
  • Journal Title: Genes Cells. 10 Pages: 963-972
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Functionally important substructures of circadian clock protein KaiB in unique tetramer complex. (2005)
  • Author(s): Iwase, R., Imada, K., Hayashi, F., Uzumaki, T., Morishita, M., Onai, K., Furukawa, Y., Namba, K., Ishiura, M.
  • Journal Title: J. Bio. Chem. 280 Pages: 43141-43149
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Improvement of the bioluminescence reporter system for real-time monitoring of circadian rhythms in the cyanobacterium Synechosystis sp strain PCC 6803 (2005)
  • Author(s): Kucho, K, Aoki, K, Itoh, S, Ishiura, M
  • Journal Title: Gene Genet Sys 80 Pages: 19-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] Global Analysis of Circadian Expression in the cvanobacterium Synechocystis sp. strain PCC 6803 (2005)
  • Author(s): Kucho, K, Okamoto, K, Tsuchiya, Y, Nomura, S, Nango, M, Kanehisa, M, Ishiura, M
  • Journal Title: J Bacteriol 187 Pages: 2190-2199
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] Identification of novel clock-regulated genes by cDNA macroarray analysis in Chlamydomonas reinhardtii (2005)
  • Author(s): Kucho, K. Okamoto, K. Tabata, S. Fukuzawa, H. Ishium, M
  • Journal Title: Plant Mol. BioL 57 Pages: 889-906
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] An automated apparatus for the real-time monitoring of bioluminescence in plants. Anal Biochem (2005)
  • Author(s): Okamoto, K. Onai, K. Ezaki, N. Ofuchi, T. Ishium. M
  • Journal Title: Anal Biochem 340 Pages: 187-192
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] RAP, an integrated program for monitoring bioluminescence and analyzing circadian rhythms in real time (2005)
  • Author(s): Okamoto, K. Onai, K. Ishiura, M
  • Journal Title: Anal Biochem 340 Pages: 193-200
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] Transcriptional regulation of the circadian clock operon kaiBC by upstream regions in cyanobacteria (2005)
  • Author(s): Kutsuna, S, Nakahira, Y, Katayama, M, Ishiura, M, Kondo, T
  • Journal Title: Mol Microbiol 57 Pages: 1474-84
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] A portable integrated automatic apparatus for the real-time monitoring of bioluminescence in plants (2005)
  • Author(s): Okamoto, K. Onai, K. Furusawa, T. Ishiura. M
  • Journal Title: Plant Cell Environ 28 Pages: 1305-1315
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] PHYTOCLOCK 1 encoding a novel GARP protein esstial for the Arebidopsis circadain clock (2005)
  • Author(s): Onai, K, Ishium, M
  • Journal Title: Genes Cells 10 Pages: 963-972
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Journal Article] Functionally important substructures of circadian clock protein KaiB in unique tetramer complex (2005)
  • Author(s): Iwase, R., Imada, K., Hayashi, F., Uzumaki, T., Morishita, M., Onai, K., Furukawa, Y., Namba, K., Ishium. M
  • Journal Title: J Biol Chem 280 Pages: 43141-43149
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] SDSL-ESR study of the cyanobacterial clock protein, (2008)
  • Author(s): Kentaro Ishii, et. al.
  • Organizer: 名古屋大学GCOE若いちからシンポジウム
  • Place of Presentation: 名古屋大学野依記念国際交流館
  • Year and Date: 2008-03-05
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] SDSL-ESR study of the cyanobacterial clock protein (2008)
  • Author(s): Kentaro, Ishii, Reiko, Murakami, Risa, Mutoh, Masahiro, Ishiura, Toshiaki, Arata
  • Organizer: The GCOE Young Scientist Symposium of Nagoya University
  • Place of Presentation: Noyori Conference Fall, Nagoya University, Nagoya, Poster
  • Year and Date: 2008-03-05
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] The ATPase activity of the cyanobacterial clock protein KaiC, (2007)
  • Author(s): Reiko Murakami, Ayumi Miyake, Ryo Iwase, Fumio Hayashi, Tatsuya Uzumaki, Masahiro Ishiura
  • Organizer: 日本生物物理学会第45回年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 20071221-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] The ESR analysis of the cyanobacterial circadian clock protein KaiB(シアノバクテリア時計タンパク質K:aiBのESR解析) (2007)
  • Author(s): 武藤梨沙、村上怜子、三野広幸, 伊藤繁、石浦正寛
  • Organizer: 日本生物物理学会第45回年会、
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 20071221-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Biochemical and structural analysis of the cyanobacterial clock-related protein SasA (2007)
  • Author(s): Jonathan Valencia, Kyouhei Bitou, Reiko Murakami, Katsumi Imada, Masahiro Ishiura
  • Organizer: 日本生物物理学会第45回年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 20071221-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] :SDSL-ESR study of the cyanobacterial clock protein (2007)
  • Author(s): Kentaro Ishii, Reiko Murakami, Risa Mutoh, Masahiro Ishiura, Toshiaki. Arata
  • Organizer: 日本生物物理学会第45回年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 20071221-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] The ATPase activity of the cyanobacterial clock protein KaiC (2007)
  • Author(s): Reiko, Murakami, Ayumi, Miyake, Ryo, Iwase, Fumio, Hayashi, Tatsuya, Uzumaki, Masahiro, Ishiura
  • Organizer: The 45th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • Place of Presentation: Pacifico Yokohama, Yokohama, Poster
  • Year and Date: 20071221-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] Biochemical and structural analysis of the cyanobacterial clock-related protein SasA (2007)
  • Author(s): Jonathan, Valencia, Kyouhei, Bitou, Reiko, Murakami, Katsumi, Imada, Masahiro, Ishiura
  • Organizer: The 45th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • Place of Presentation: Pacifico Yokohama, Yokohama, Poster
  • Year and Date: 20071221-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] SDSL-ESR study of the cyanobacterial clock protein (2007)
  • Author(s): Kentaro, Ishii, Reiko, Murakami, Risa, Mutoh, Masahiro, Ishiura, Toshiaki, Arata
  • Organizer: The 45th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • Place of Presentation: Pacifico Yokohama, Yokohama. Poster
  • Year and Date: 20071221-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] 生物発光を指標とした変異体スクリーニングとゲノム情報を利用した原因遺伝子の網羅的同定 (2007)
  • Author(s): 松尾拓哉、岡本和久、小内清、丹羽由美、石浦正寛
  • Organizer: 第6回クラミドモナス研究会
  • Place of Presentation: 高知工科大学
  • Year and Date: 20071123-24
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 時計タンパク質の構造と機能の解析 (2007)
  • Author(s): 村上怜子、三宅あゆみ、林史夫宇津巻竜也、石浦正寛
  • Organizer: 特定領域研究「タンパク質の一生」ポストシンポジウム
  • Place of Presentation: 熱海
  • Year and Date: 20071122-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] ハイスループット生物発光リアルタイムモニタリング法による変異体のスクリーニングと原因遺伝子の網羅的同定〜クラミドモナスの概日時計遺伝子へのアプローチ〜 (2007)
  • Author(s): 松尾拓哉、岡本和久、小内清、丹羽由美、石浦正寛
  • Organizer: 日本遺伝学会第79回大会ミニシンポジウム
  • Place of Presentation: 岡山大学理学部・岡山大学創立50周年記念館
  • Year and Date: 20070919-21
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 生物時計ナノ装置の原子レベルでの解明 (2007)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 特定領域研究「生体ナノシステム」班会議
  • Place of Presentation: 千里ライフサイエンスセンター
  • Year and Date: 20070913-14
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 時計タンパク質の核移行と核におけるリズム発振機能 (2007)
  • Author(s): 石浦正寛、小内清、岡本和久
  • Organizer: 特定領域研究「細胞核ダイナミクス」班会議
  • Place of Presentation: ナスパ・ニューオオタニ
  • Year and Date: 20070701-03
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 時系列データ統合解析プログラムの開発とこれによる生物時計ネットワークの網羅的解析 (2007)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 特定領域研究「ゲノム」4領域合同班会議
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル
  • Year and Date: 20070625-27
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] ハイスループット生物発光リアルタイムモニタリング・スクリーニングシステムによる遺伝子発現のリアルタイム測定 (2007)
  • Author(s): 石浦正寛、小内清、岡本和久
  • Organizer: 第6回国際バイオEXPOフォーラム
  • Place of Presentation: 東京国際展示場
  • Year and Date: 20070621-22
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 遺伝子発現のリズムを測る-生物発光リアルタイム・モニタリング・システムの開発と概日リズム研究への応用 (2007)
  • Author(s): 岡本和久、小内清、石浦正寛
  • Organizer: 第48回日本植物生理学会年会シンポジウム
  • Place of Presentation: 愛媛大学
  • Year and Date: 20070328-30
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Structure and function of cyanobacterial circadian clock proteins, (2007)
  • Author(s): Masahiro Ishiura
  • Organizer: International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems
  • Place of Presentation: Nagoya University
  • Year and Date: 2007-12-01
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Structure and function of cyanobacterial circadian clock proteins (2007)
  • Author(s): Masahiro, Ishiura
  • Organizer: Nagoya International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems
  • Place of Presentation: Room B5, Building B, Department of Physics, Graduate School of Science, Nagoya University, Nagoya, Invited talk
  • Year and Date: 2007-12-01
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] 試験管振盪培養装置用ODリアルタイム測定装置の開発 (2007)
  • Author(s): 岡本和久、小内清、西岡亮、富田悟志、石浦正寛
  • Organizer: 日本遺伝学会第79回大会
  • Place of Presentation: 岡山大学理学部
  • Year and Date: 2007-09-19
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 藍色細菌の時計遺伝子クラスターkaiABの比較解析 (2007)
  • Author(s): 小内清、森下めぐみ、石浦正寛
  • Organizer: 日本遺伝学会第79回大会
  • Place of Presentation: 岡山大学理学部
  • Year and Date: 2007-09-19
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 好熱性藍色細菌時計タンパク質KaiBの生化学機能解析 (2007)
  • Author(s): 武藤梨沙、村上怜子、三野広幸, 伊藤繁、石浦正寛
  • Organizer: 第71回日本生化学会中部支部会
  • Place of Presentation: 名古屋大学野依記念国際交流館
  • Year and Date: 2007-05-19
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 「ゲノム研究で何が分かるか」、植物の時計:藍色細菌、クラミドモナス、シロイヌナズナ、 (2007)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 第2回遺伝子実験施設シンポジウム
  • Place of Presentation: 名古屋大学野依記念学術交流館1階会議室
  • Year and Date: 2007-03-09
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 好熱性藍色細菌時計タンパク質の構造解析 (2007)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: タンパク3000総合シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京国際フォーラム
  • Year and Date: 2007-02-27
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 生物時計分子装置の作動原理の原子レベルでの理解に向けて (2007)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 統合脳プロテオミクス委員会・タンパク3000(脳・神経系)・大阪大学蛋白質研究所合同セミナー「プロテオミク講演会 脳科学に於けるプロテオミクスと構造解析研究の現状と将来展望」
  • Place of Presentation: 自然科学研究機構岡崎カンファレンスセンター
  • Year and Date: 2007-01-14
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 単細胞緑藻クラミドモナスにおける概日リズムリアルタイム測定系の開発 (2006)
  • Author(s): 松尾拓哉、小内清、岡本和久、皆川純、石浦正寛
  • Organizer: 第13回日本時間生物学
  • Place of Presentation: 東京国際フォーラム
  • Year and Date: 20061130-1202
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 時系列データ統合解析プログラムの開発とこれによる生物時計ネットワークの網羅的解析 (2006)
  • Author(s): 石浦正寛、小内清、岡本和久
  • Organizer: 2006年度特定領域研究「ゲノム」・生命システム情報 個別班会議
  • Place of Presentation: 奈良県新公会堂
  • Year and Date: 20061130-1202
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Aiming at one molecule measurement of cyanobacteria clock proteins (2006)
  • Author(s): Seiji Sakaguchi, Masahiro Ishiura
  • Organizer: EABS & BSJ 2006(Fifth East Asian Biophysics Symposium & Forty-Fourth Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)
  • Place of Presentation: Okinawa Convention Center
  • Year and Date: 20061112-16
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Crystalization of KaiA-KaiC complexes for structure analysis (2006)
  • Author(s): Kyouhei Bitou, Ryo Iwase, Seiji Sakaguchi, Reiko Murakami, Katsumi Imada, Keiichi Namba, Masahiro Ishiura
  • Organizer: EABS & BSJ 2006
  • Place of Presentation: Okinawa Convention Center
  • Year and Date: 20061112-16
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] The Biochemical function of the cyanobacterial circadian clock protein KaiB (2006)
  • Author(s): Risa Mutoh, Reiko Murakami, Ryo Iwase, Masahiro Ishiura
  • Organizer: EABS & BSJ 2006
  • Place of Presentation: Okinawa Convention Center
  • Year and Date: 20061112-16
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] The function of circadian clock Kai proteins in the cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC6803 (2006)
  • Author(s): Reiko Murakami, Masahiro Ishiura
  • Organizer: EABS & BSJ 2006
  • Place of Presentation: Okinawa Convention Center
  • Year and Date: 20061112-16
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Aiming at one molecule measurement of cyanobacteria clock proteins (2006)
  • Author(s): Seiji, Sakaguchi, Masahiro, Ishiura
  • Organizer: EABS & BSJ 2006 (Fifth East Asian Biophysics Symposium & Forty-Fourth Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)
  • Place of Presentation: Okinawa Convention Center, Okinawa, Japan, Poster
  • Year and Date: 20061112-16
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] Crystalization of KaiA-KaiC complexes for structure analysis (2006)
  • Author(s): Kyouhei, Bitou, Ryo, Iwase, Seiji, Sakaguchi, Reiko, Murakami, Katsumi, Imada, Keiichi, Namba, Masahiro, Isium
  • Organizer: EABS & BSJ 2006
  • Place of Presentation: Okinawa Convention Center, Okinawa, Japan, Poster
  • Year and Date: 20061112-16
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] The Biochemical function of the cyanobacterial circadian clock protein KaiB (2006)
  • Author(s): Risa, Mulch, Reiko, Murakami, Ryo, Iwase, Masahiro, Ishiura
  • Organizer: EABS & BSJ 2006
  • Place of Presentation: Okinawa Convention Center, Okinawa, Japan, Poster
  • Year and Date: 20061112-16
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] The function of circadian clock Kai proteins in the cyanobacterium Synechosystis sp. strain PCC6803 (2006)
  • Author(s): Reiko, Murakami, Masahiro, Ishiura
  • Organizer: EABS & BSJ 2006
  • Place of Presentation: Okinawa Convention Center, Okinawa, Japan. Poster
  • Year and Date: 20061112-16
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] 時系列データ統合解析プログラムの開発とこれによる生物時計ネットワークの網羅的解析 (2006)
  • Author(s): 石浦正寛、小内清、岡本和久
  • Organizer: 2006年度「ゲノム」4領域合同班会議
  • Place of Presentation: 大阪国際会議場
  • Year and Date: 20060920-22
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Real-time monitoring of chloroplast gene expression by a lucif erase reporter: evidence for nuclear regulation of chloroplast circadian period, (2006)
  • Author(s): Takuya Matsuo, Kiyoshi Onai, Kazuhisa Okamoto, Jun Minagawa, Masahiro Ishiura
  • Organizer: The 12th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas
  • Place of Presentation: Lloyd center, Portland, Oregon,
  • Year and Date: 20060509-14
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Real-time monitoring of chloroplast gene expression by a luciferase reporter (2006)
  • Author(s): Takuya, Matsuo, Kiyoshi, Onai, Kazuhisa, Okamoto, Jun, Minagawa, Masahiro, Ishiura
  • Organizer: evidence for nuclear regulation of chloroplast circadian period, The 12th Intemational Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas
  • Place of Presentation: Lloyd center, Portland, Oregon, Poster
  • Year and Date: 20060509-14
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] 時計タンパク質の構造と機能 (2006)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 平成18年度「タンパク質の一生」班会議
  • Place of Presentation: 宮城蔵王ロイヤルホテル
  • Year and Date: 2006-12-18
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] シアノバクテリア時計タンパク質の構造と機能 (2006)
  • Author(s): 村上怜子、石浦正寛
  • Organizer: 平成18年度「タンパク質の一生」班会議
  • Place of Presentation: 宮城蔵王ロイヤルホテル
  • Year and Date: 2006-12-18
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] ハイスループット生物発光リアルタイムモニタリング・スクリーニングシステムによる遺伝子発現のリアルタイム測定 (2006)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 第4回名古屋大学東京フォーラム
  • Place of Presentation: 経団連ホール
  • Year and Date: 2006-12-12
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] シアノバクテリアの時計関連タンパク質Pexの機能解析 (2006)
  • Author(s): 北島智美、石浦正寛
  • Organizer: 日本分子生物学会2006フォーラム
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場
  • Year and Date: 2006-12-07
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 時計関連タンパク質Pexの構造解析 (2006)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: タンパク3000プロジェクト個別的解析プログラム「脳・神経系」第5回ワークショップ
  • Place of Presentation: 大阪大学蛋白質研究所講堂
  • Year and Date: 2006-10-10
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 大きく生育させた植物の生物発光リアルタイム測定 (2006)
  • Author(s): 岡本和久、小内清、石浦正寛
  • Organizer: 日本遺伝学会第78回大会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場
  • Year and Date: 2006-09-27
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] シロイヌナズナの短周期変異体sp2のマップベースクローニングと解析-生物発光リアルタイム測定法を用いた突然変異体の分離・解析・遺伝子クローニング- (2006)
  • Author(s): 小内清、西本治美、森岡千里、飯田高広、石浦正寛
  • Organizer: 日本遺伝学会第78回大会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場
  • Year and Date: 2006-09-27
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 藍色細菌Synechocystis sp. PCC 6803のkai遺伝子群の機能 (2006)
  • Author(s): 小内清、森下めぐみ、岡本和久南正大、石浦正寛
  • Organizer: 日本遺伝学会第78回大会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場
  • Year and Date: 2006-09-27
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 植物時計 (2006)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 2006年度名古屋大学大学説明会施設見学
  • Place of Presentation: 名古屋大学遺伝子実験施設
  • Year and Date: 2006-08-10
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 生物時計分子装置の作動原理の原子レベルでの解明に向けて (2006)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 第13回高等研究院セミナー
  • Place of Presentation: 名古屋大学高等研究館カンファレンスホール
  • Year and Date: 2006-07-25
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 植物が持っている時計 (2006)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 2006年名大祭遺伝子実験施設研究室公開「植物の不思議な世界」
  • Place of Presentation: 名古屋大学遺伝子実験施設
  • Year and Date: 2006-06-03
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 生物時計分子装置の作動原理の原子レベルでの解明に向けて (2006)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 分子脳科学・タンパク3000(脳・神経系)合同セミナー
  • Place of Presentation: 大阪大学蛋白質研究所講堂
  • Year and Date: 2006-05-27
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 藍色細菌の時計タンパク質KaiAの構造と機能 (2005)
  • Author(s): 宇津巻竜也、藤田真康、中津亨林史夫、柴田洋之、伊藤典代、加藤博章、石浦正寛
  • Organizer: 第5回日本光合成研究会シンポジウム
  • Place of Presentation: 名古屋大学野依記念学術交流館
  • Year and Date: 20050528-29
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 葉緑体および核の遺伝子発現リアルタイム測定系の開発と生物時計研究への応用 (2005)
  • Author(s): 松尾拓哉、石浦正寛
  • Organizer: 第5回クラミドモナスワークショップ
  • Place of Presentation: 筑波大学
  • Year and Date: 2005-12-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 藍色細菌の時計タンパク質の構造と機能 (2005)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: かずさDNA研究所研究会「ラン藻の分子生物学」
  • Place of Presentation: かずさアカデミアパーク
  • Year and Date: 2005-12-06
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 生物時計装置の作動原理の原子レベルでの解明に向けて (2005)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: タンパク3000プロジェクト個別的解析プログラム「脳・神経系」第4回ワークショップ
  • Place of Presentation: 大阪大学蛋白質研究所
  • Year and Date: 2005-12-01
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 藍色細菌時計タンパク質KaiBの機能部位変異体の構造解析 (2005)
  • Author(s): 岩瀬亮、今田勝巳、林史夫、宇津巻竜也、難波啓一、石浦正寛
  • Organizer: 2005年度日本生物物理学会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター
  • Year and Date: 2005-11-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 好熱性藍色細菌の生物時計の分子機構に関わる時計タンパク質KaiCのATP加水分解とリン酸化反応のキネティクス (2005)
  • Author(s): 三宅歩、林史夫、岩瀬亮、石浦正寛
  • Organizer: 2005年度日本生物物理学会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター
  • Year and Date: 2005-11-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 藍色細菌時計タンパク質KaiCのN末端、C末端ドメインのはたらき (2005)
  • Author(s): 林史夫、岩瀬亮、宇津巻竜也、石浦正寛
  • Organizer: 2005年度日本生物物理学会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター
  • Year and Date: 2005-11-23
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] The domain structures and subdomain functions of cyanobacterial clock protein KaiC (2005)
  • Author(s): Fumio Hayashi, Ryo Iwase, Tatsuya Uzumaki, Masahiro Ishiura
  • Organizer: International Symposium on Life of Proteins-Maturation, Translation and Quality Control in the Cell.特定領域研究A「タンパク質の一生」班会議
  • Place of Presentation: 淡路夢舞台
  • Year and Date: 2005-10-30
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Structural analysis of mutants of cyanobacterial circadian clock protein KaiB (2005)
  • Author(s): Ryo Iwase, Katsumi Imada, Fumio Hayashi, Tatsuya Uzumaki, Keiichi Namba, Masahiro Ishiura
  • Organizer: .International Symposium on Life of Proteins-Maturation, Translation and Quality Control in the Cell.特定領域研究A「タンパク質の一生」班会議
  • Place of Presentation: 淡路夢舞台
  • Year and Date: 2005-10-30
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Kinetics of the ATPase and phosphorylation activities of circadian clock protein KaiC from Thermosynechococcus elongatus. (2005)
  • Author(s): Ayumi Miyake, Fumio Hayashi, Ryo Iwase, Masahiro Ishiura
  • Organizer: International Symposium on Life of Proteins-Maturation, Translation and Quality Control in the Cell.特定領域研究A「タンパク質の一生」班会議
  • Place of Presentation: 淡路夢舞台
  • Year and Date: 2005-10-30
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] The domain structures and subdomain functions of cyanobacterial clock protein KaiC. International Symposium on Life of Proteins- Maturation (2005)
  • Author(s): Fumio, Hayashi, Ryo, Iwase, Tatsuya, Uzumaki, Masahiro, Ishium
  • Organizer: Translation and Quality Control in the Cell
  • Place of Presentation: Awaii-Yumebutai, Awaii, Poster
  • Year and Date: 2005-10-30
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] Structural analysis of mutants of cyanobacterial circadian clock protein KaiB (2005)
  • Author(s): Ryo, Iwase, Katsumi, Imada, Fumio, Hayashi, Tatsuya, Uzumaki, Keiichi, Namba, Masahiro, Ishiura
  • Organizer: International Symposium on Life of Proteins- Maturation, Translation and Quality Control in the Cell
  • Place of Presentation: Awaji-Yumebutai, Awaji, Poster
  • Year and Date: 2005-10-30
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] Kinetics of the ATPase and phosphorylation activities of circadian clock protein KaiC from Thermosynechococcus elongatus (2005)
  • Author(s): Ayumi, Miyake, Fumio, Hayashi, Ryo, Iwase, Masahiro, Ishiura
  • Organizer: Interational Symposium on Life of Proteins- Maturation, Translation and Quality Control in the Cell
  • Place of Presentation: Awaji-Yumebutai, Awaji, Poster
  • Year and Date: 2005-10-30
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] シアノバクテリア時計蛋白質の立体構造解析に基づく分子機構解析 (2005)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 大阪大学蛋白質研究所セミナー「体内時計と体内恒常性維持機構」
  • Place of Presentation: 大阪大学蛋白質研究所
  • Year and Date: 2005-10-24
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Toward the understanding of the molecular mechanisms for the cyanobacterial circadian clock at the atomic level, (2005)
  • Author(s): Masahiro Ishiura
  • Organizer: The 78th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society, Mini symposium" The structural basis of the protein-protein interactions of photosynthesis, "
  • Place of Presentation: Portopia Hotel, Kobe
  • Year and Date: 2005-10-20
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Toward the understanding of the molecular mechanisms for the cyanobacterial circadian clock at the atomic level (2005)
  • Author(s): Masahiro, Ishiura
  • Organizer: The 78th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society, Mini symposium "The structural basis of the protein-protein interactions of photosynthesis"
  • Place of Presentation: Portopia Hotel, Kobe, Invited talk
  • Year and Date: 2005-10-20
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] 藍色細菌の凍結保存法 (2005)
  • Author(s): 小内清、森下めぐみ、石浦正寛
  • Organizer: 日本遺伝学会第77回大会
  • Place of Presentation: 国立オリンピック記念青少年総合センター
  • Year and Date: 2005-09-29
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 核による葉緑体遺伝子発現リズムの制御 (2005)
  • Author(s): 松尾拓哉、小内清、岡本和久、皆川純、石浦正寛
  • Organizer: 第77回日本遺伝学会
  • Place of Presentation: 国立オリンピック記念青少年総合センター
  • Year and Date: 2005-09-29
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 細胞分裂速度と生物発光をリアルタイム測定できる連続培養装置の開発 (2005)
  • Author(s): 岡本和久、小内清、松尾拓也、九町健一、岩瀬亮、森下めぐみ石浦正寛
  • Organizer: 日本遺伝学会第77回大会
  • Place of Presentation: 国立オリンピック記念青少年総合センター
  • Year and Date: 2005-09-29
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 高等植物の時計遺伝子の網羅的クローニングに向けて (2005)
  • Author(s): 小内清、石浦正寛
  • Organizer: 日本遺伝学会第77回大会ミニシンポジウム「植物における生物時計と時計が関与する生命現象の分子機構」
  • Place of Presentation: 国立オリンピック記念青少年総合センター
  • Year and Date: 2005-09-28
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 共同研究の背景と意義、成果 (2005)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 研究交流クラブ第94回定例会(財団法人科学技術交流財団先導的科学技術共同研究成果発表会)
  • Place of Presentation: 名古屋銀行協会
  • Year and Date: 2005-09-21
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 好熱性藍色細菌のオリゴDNAアレイの開発と作製 (2005)
  • Author(s): 九町健一, ら
  • Organizer: 研究交流クラブ第94回定例会(財団法人科学技術交流財団先導的科学技術共同研究成果発表会)
  • Place of Presentation: 名古屋銀行協会
  • Year and Date: 2005-09-21
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] DNAアレイを用いた生物時計研究のための実験系の開発 (2005)
  • Author(s): 岡本和久, ら
  • Organizer: 研究交流クラブ第94回定例会(財団法人科学技術交流財団先導的科学技術共同研究成果発表会)
  • Place of Presentation: 名古屋銀行協会
  • Year and Date: 2005-09-21
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 藍色細菌の時計タンパク質KaiCのドメイン構造とドメインサブ機能 (2005)
  • Author(s): 林史夫、石浦正寛
  • Organizer: ラン藻ゲノム研究交流会
  • Place of Presentation: 東京大学駒場キャンパス
  • Year and Date: 2005-07-30
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 藍色細菌における概日発現リズムのDNAアレイを用いた網羅的解析 (2005)
  • Author(s): 九町健一、石浦正寛
  • Organizer: 三学会九州支部合同例会
  • Place of Presentation: 鹿児島大学
  • Year and Date: 2005-07-09
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] 高等植物の時計遺伝子の網羅的クローニングに向けて (2005)
  • Author(s): 小内清、石浦正寛
  • Organizer: イネ・シロイヌナズナ合同ワークショップ
  • Place of Presentation: 奈良県文化会館
  • Year and Date: 2005-07-06
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Toward the understanding of the molecular mechanism for the cyanobacterial circadian clock at the atomic level, (2005)
  • Author(s): Masahiro Ishiura
  • Organizer: The 3rd Japan-Germany Joint Seminor "Functional Genomics in Cyanobacteria: New Approaches for Investigation of Diversity"
  • Place of Presentation: Tomita、 Chiba
  • Year and Date: 2005-06-08
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Presentation] Toward the understanding of the molecular mechanism for the cyanobacterial circadian clock at the atomic level (2005)
  • Author(s): Masahiro, Ishium
  • Organizer: The 3rd Japan-Germany Joint Seminor "Functional Genomics in Cyanobacteria : New Approaches for Investigation of Diversity"
  • Place of Presentation: Tomita, Chiba, Invited talk
  • Year and Date: 2005-06-08
  • Description: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [Presentation] 生物時計装置の作動原理の原子レベルでの解明に向けて (2005)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Organizer: 品川出夫教授退職記念シンポジウム「ゲノム動態と環境応答」
  • Place of Presentation: 千里ライフサイエンスセンター
  • Year and Date: 2005-05-14
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Book] 生物時計装置を原子レベルで解明する. (2005)
  • Author(s): 宇津巻竜也、林史夫、石浦正寛
  • Total Pages: 50:111-120
  • Publisher: 蛋白質・核酸・酵素
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Book] 分子装置としての生物時計 (2005)
  • Author(s): 石浦正寛
  • Total Pages: 34-35
  • Publisher: 名大トピックス No.139
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Remarks] 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • URL: http://www.gene.nagoya-u.ac.jp:16080/~ishiura-g/
• [Patent(Industrial Property Rights)] 培養装置 (2008)
  • Inventor(s): 石浦正寛、岡本和久
  • Industrial Property Rights Holder: 名古屋大学総長
  • Industrial Property Number: 特願2008-078421
  • Filing Date: 2008-03-25
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Patent(Industrial Property Rights)] 葉緑体で機能するホタルルシフェラーゼ遺伝子とそれを用いた葉緑体遺伝子発現のリアルタイムモニタリング (2005)
  • Inventor(s): 石浦正寛、松尾拓哉、小内清
  • Industrial Property Rights Holder: 国立大学法人名古屋大学
  • Industrial Property Number: 特願2005-029217
  • Filing Date: 2005-02-04
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [Patent(Industrial Property Rights)] 核酸、当該核酸をコードするアミノ酸、当該核酸及びアミノ酸からなるプローブ、及び当該プローブを用いたスクリーニング法 (2005)
  • Inventor(s): 石浦正寛、小内清
  • Industrial Property Rights Holder: 国立大学法人名古屋大学
  • Industrial Property Number: 特願2005-169795
  • Filing Date: 2005-06-09
  • Description: 「研究成果報告書概要(和文)」より