ビフィズス菌(B.adolescentis)の全ゲノム塩基配列の決定に関する研究

2006 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17510164
• Research Institution: Gifu University
• Principal Investigator: 鈴木 徹 岐阜大学, 生命科学総合研究支援センター, 淮教授 (20235972)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 須賀 晴久 岐阜大学, 生命科学総合研究支援センター, 助教 (20283319)
• Keywords: ビフィズス菌 / プロバイオティクス / テーラーメードプロバイオティクス / ゲノム解析 / ゲノミクス / 腸内細菌

Research Abstract

ビフィズス菌は、下痢防止・便秘改善といった整腸作用、免疫活性化作用、皮膚アレルギー低減などの効果を持っことが報告されている。ヒトの健康維持に大きく関わっているビフィズス菌は近年たいへん注目されている。
今回は、成人大腸内の主要菌株であるB.adolescentisに注目し、その基準株であるATCC15703株のゲノム解析を行った。
約27,000クローンを解析し16.2Mbの配列情報を得た。その結果、完全長のゲノム配列を得ることに成功した。本菌のゲノムサイズは2,089,645bpであり、GC含量は59%であった。ゲノム解析の結果、推定のORF数は2,094個で、そのうち遺伝子をコードするProtein coding sequence (CDS)は1,631個、tRNAは54個、rRNAオペロンは5コピー存在した。B.longum NCC2705との比較ゲノム解析を行った結果、両菌共通の遺伝子候補は1203個、本菌独自の遺伝子候補は428個検出された。そのうち機能が推定されたものは290個、機能未知のものは138個であった。糖代謝関連遺伝子について、KEGGのpathwayマップにて確認したところ、本菌は様々な糖を利用できることが示唆された。