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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Biosynthetic study on bioactive compounds from marine sponges

Research Project

Project/Area Number 17F17114
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

脇本 敏幸  北海道大学, 薬学研究院, 教授 (70363900)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) URIA AGUSTINUS  北海道大学, 薬学研究科(研究院), 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2017-07-26 – 2019-03-31
Keywords海綿 / メタゲノム / 生合成
Outline of Annual Research Achievements

海綿動物は多種多様な共生微生物を宿す付着性の多細胞動物である。世界中の海に生息し、1万種が現存するといわれる海綿動物からは、これまで2万以上の生理活性物質が単離、報告されてきた。ランダムスクリーニングに由来するため細胞毒性物質の数が多く、pM程度の濃度で強力な細胞毒性を示す化合物も少なくない。しかしながら、それらの多くが稀少かつ複雑な構造を有するために、抗がん剤として研究開発がなされた化合物は極めて少ない。一方で、それら海綿由来細胞毒性物質のほとんどは共生微生物によって生産されることが示唆されている。本研究では医薬品資源として有望な海綿由来稀少生理活性物質の生合成遺伝子および生産菌を同定し、可培養化や異種生産を目指した基礎的知見を得る。昨年度より海綿動物から微量成分として見出されたspongistatinの生合成遺伝子の特定を進めてきた。Spongistatinはtrans AT型PKSによる生合成経路が予想される化合物であり、その生合成遺伝子には特徴的な配列を有するketosynthase (KS)が含まれる。したがってKSの縮重プライマーを用いたtrans AT型PKSの探索を重点的に行った。その結果、海綿メタゲノムDNAよりtrans AT型PKSに属するKS配列を得た。さらに海綿メタゲノムライブラリーを構築し、得られたtrans AT型KS配列に基づくスクリーニングを行った。その結果、複数のヒットクローンを得ることに成功した。現在詳細なシークエンス解析を進めている。また、海綿共生微生物の可培養化を目指し、沖縄産海綿Theonella swinhoeiから様々な組成の培地を用いた培養を試みた。その結果、既知微生物と相同性が低い微生物を含む数百種類の微生物を単離した。その中にはPKSやNRPS遺伝子を有する微生物群も数多く含まれており今後さらに物質生産能の検証を進める。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (16 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 7 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 6 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] スイス連邦工科大学チューリッヒ校(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      スイス連邦工科大学チューリッヒ校
  • [Journal Article] SurE is a trans-acting thioesterase cyclizing two distinct non-ribosomal peptides2019

    • Author(s)
      Matsuda Kenichi、Kobayashi Masakazu、Kuranaga Takefumi、Takada Kentaro、Ikeda Haruo、Matsunaga Shigeki、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 17 Pages: 1058~1061

    • DOI

      10.1039/C8OB02867B

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The revised structure of surugamide A2019

    • Author(s)
      Matsuda Kenichi、Kuranaga Takefumi、Ayae Sano, Akihiro Ninomiya、Takada Kentaros、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: - Pages: in press

    • DOI

      -

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biosynthetic Insights of Calyculin- and Misakinolide-Type Compounds in “ Candidatus Entotheonella sp.”2018

    • Author(s)
      Uria Agustinus R.、Piel Joern、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      Methods in Enzymology

      Volume: 604 Pages: 287~330

    • DOI

      10.1016/bs.mie.2018.02.017

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Discovery of Unprecedented Hydrazine-Forming Machinery in Bacteria2018

    • Author(s)
      Matsuda Kenichi、Tomita Takeo、Shin-ya Kazuo、Wakimoto Toshiyuki、Kuzuyama Tomohisa、Nishiyama Makoto
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 140 Pages: 9083~9086

    • DOI

      10.1021/jacs.8b05354

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Total Synthesis of the Nonribosomal Peptide Surugamide B and Identification of a New Offloading Cyclase Family2018

    • Author(s)
      Kuranaga Takefumi、Matsuda Kenichi、Sano Ayae、Kobayashi Masakazu、Ninomiya Akihiro、Takada Kentaro、Matsunaga Shigeki、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 57 Pages: 9447~9451

    • DOI

      10.1002/anie.201805541

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Diastereoselective Total Synthesis and Structural Confirmation of Surugamide F2018

    • Author(s)
      Kuranaga Takefumi、Fukuba Atsuki、Ninomiya Akihiro、Takada Kentaro、Matsunaga Shigeki、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 66 Pages: 637~641

    • DOI

      10.1248/cpb.c18-00072

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Palmitoyl lactic acid induces adipogenesis and a brown fat-like phenotype in 3T3-L1 preadipocytes2018

    • Author(s)
      Unno Yuka、Yamamoto Hirona、Takatsuki Shuto、Sato Yoshinori、Kuranaga Takefumi、Yazawa Kazunaga、Ono Yasuo、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids

      Volume: 1863 Pages: 772~782

    • DOI

      10.1016/j.bbalip.2018.04.003

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Investigating spongistatin biosynthesis in complex sponge-bacteria association2018

    • Author(s)
      Agustinus R. Uria, Kenichi Matsuda, Toshiyuki Wakimoto
    • Organizer
      3rd International Symposium on Sponge Microbiology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A new off-loading enzyme in non-ribosomal peptide biosynthesis2018

    • Author(s)
      Toshiyuki Wakimoto
    • Organizer
      2nd China-Japan Joint Symposium on Natural Product Biosynthesis
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Marine Sponge-derived Metagenomes/uncultured Bacteria - a Rich Source of Novel Natural Product Biosynthetic Genes2018

    • Author(s)
      Toshiyuki Wakimoto
    • Organizer
      International Seminar on Natural Products Medicines 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Unusual Processes of PKS and NRPS Assembly Lines in Marine Bacteria2018

    • Author(s)
      Toshiyuki Wakimoto
    • Organizer
      1st German-Japanese Joint Symposium on the Biosynthesis of Natural Products
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 生合成遺伝子から見出した新規天然物と難培養微生物2018

    • Author(s)
      脇本敏幸
    • Organizer
      新化学技術推進協会ライフサイエンス技術部会講演会
    • Invited
  • [Presentation] 難培養微生物を起源とする希少医薬品資源の量産2018

    • Author(s)
      脇本敏幸
    • Organizer
      生物合成系の再設計による複雑骨格機能分子の革新的創成科学、第2回公開シンポジウム
    • Invited
  • [Remarks] 北海道大学大学院薬学研究院天然物化学研究室

    • URL

      http://www.pharm.hokudai.ac.jp/tennen/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] ペプチド類の大環状化酵素2018

    • Inventor(s)
      脇本敏幸、倉永健史、松田研一
    • Industrial Property Rights Holder
      北海道大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2019-50797
    • Overseas

URL: 

Published: 2019-12-27  

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