2007 Fiscal Year Annual Research Report
生理活性物質と標的蛋白質の微視的相互作用解明のための化学構造生物学
| Project/Area Number |
17GS0221
|
|---|
| Research Institution | The Institute of Physical and Chemical Research |
|---|
Principal Investigator |
長田 裕之 The Institute of Physical and Chemical Research, 長田抗生物質研究室, 主任研究員 (80160836)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
吉田 稔 独立行政法人理化学研究所, 吉田化学遺伝学研究室, 主任研究員 (80191617)
城 宜嗣 独立行政法人理化学研究所, 城生体金属科学研究室, 主任研究員 (70183051)
掛谷 秀昭 京都大学, 薬学研究科, 教授 (00270596)
臼井 健郎 筑波大学, 生命環境科学研究科, 准教授 (60281648)
林 雄二郎 東京理科大学, 工学部, 教授 (00198863)
|
|---|
| Keywords | 受容体 / リガンド / 化合物アレイ / ライブラリー / 蛋白質 / 低分子化合物 / 結晶構造解析 / 標的分子 |
|---|
| Research Abstract |
以下3体制の連携強化のために有機合成では清水猛氏、機能解析研究では小嶋聡一氏を加えた。
1.受容体・リガンドの効率的検出:ガラス基板を用い約8000化合物をマイクロアレイ化し、種々の蛋白質との結合実験を行い、結合した低分子化合物の構造を3次元的に解析した。RFP融合蛋白質の過剰発現細胞破砕液を用いてもリガンド探索が可能であることを確認した。ヒト疾患関連遺伝子産物のうち抗がん標的である翻訳開始因子elF4Gの分裂酵母ホモログTif471の機能を阻害する化合物スクリーニングを行い候補化合物を得た。また、GFP融合型NAD依存的脱アセチル化酵素SIRT3を精製し、低分子マイクロアレイにより結合活性のある候補化合物を得た。
2.蛋白質と低分子化合物の微視的相互作用解析:cytC1蛋白質-AMP-基質複合体の構造をもとに各種変異体を調製し、結合に関与する微視的構造解析を試みている。また、別の相互作用モデルとしてインドールカルバゾール系抗生物質の生合成系酵素群中の2つの酵素(StaP、VioE)の結晶構造解析に成功した。
3.蛋白質リガンドの相互作用の実証:有機合成により得られた各種の誘導体は、受容体蛋白質の解析や動物実験による作用機作解析、蛋白質の動的な相互作用解析に重要である。cytotrienin不斉全合成、Azaspirenと類似の構造を有するFD-838全合成を行い絶対立体構造を決定するとともに、各種誘導体合成を進めている。また、リベロマイシン-標的蛋白質の結合評価にむけて、リベロマイシン誘導体合成を行なった。作用解析の成果として、血管新生抑制剤エポキシキノールBの標的蛋白質の1つとしてVEGFR2を同定し、不可逆的にVEGFR2のシステイン残基を介して結合することを明らかにした。また、動物実験によるAzaspirenの作用機作解析により、血管新生阻害作用を確認した。
|
