• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Annual Research Report

Gene regulatory network underlying the diversity of reproductive traits in Fagaceae

Research Project

Project/Area Number 17H01449
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

佐竹 暁子  九州大学, 理学研究院, 教授 (70506237)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 韓 慶民  国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (40391180)
北島 薫  京都大学, 農学研究科, 教授 (40721379)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2021-03-31
Keywords植物 / 遺伝子ネットワーク / マスティング / フェノロジー / 進化 / 開花 / 受精 / 胚嚢発生
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、送粉様式、結実までの経過時間、開花季節、花・種子量の年変動の程度など、多様な繁殖形質をもつブナ科樹木を対象に、① 花と種子生産に必要とされる資源投資量の測定、② 網羅的遺伝子発現解析による遺伝子制御ネットワークの推定と種間比較、③ 開花遺伝子発現制御の進化モデルの開発と解析、を行うことによって、繁殖資源分配戦略と開花戦略の多様化メカニズムを遺伝子ネットワーク進化の視点から明らかにすることを目的とする。2019年度は2017年度より蓄積されたサンプルを用いた分析をもとに上の②と③を中心に研究に進めた。アラカシとマテバシイにおいて1対1のペアとして存在する相同遺伝子9,258個を抽出し野外環境条件における発現パターンを2年間継続して分析した結果、季節の進行とともに、開花・結実時期の制御、窒素や糖の輸送、ストレス応答に関与する遺伝子の発現プロファイルが協調的に変化し適切な環境応答を示すことが明らかとなった。多くの相同遺伝子は種間で保存された発現パターンを示したが、種間で明らかに異なる発現パターンを示す遺伝子群が検出された。これらの詳細を分析した結果、夏の活性酸素応答、花粉管伸長、RNA指向型DNAメチル化に関わる遺伝子群の発現プロファイルがマテバシイとアラカシでは大きく異なっていることが明らかとなった。これらの遺伝子を、受粉後から種子成熟まで1年以上必要とする2年成の特徴に関与する候補遺伝子として選定した。花粉管伸長とDNAメチル化に加えて胚嚢発生や受精後の胚発生に関与する遺伝子も含めて遺伝子制御ネットワークの因果推論を行った結果、極核の融合に関与する遺伝子が制御ネットワークの上流に位置することが示された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

●受粉後から種子成熟まで1年以上必要とする2年成の特徴に関与する候補遺伝子をさらに絞り込むことができた。
●胚嚢発生に関与する遺伝子の発現が半年以上遅延することがマテバシイにおける受精遅延を引き起こし、最終的に受粉後から種子成熟まで1年以上必要とする2年成の特徴を獲得した可能性を示唆する結果が得られた。

Strategy for Future Research Activity

次年度は、これまでに得られた結果を検証するために胚嚢発生過程の詳細な観察と定量PCRによる発現定量を行う予定である。また、花組織における発現分析も合わせて進めるため、花サンプルの採取とRNA抽出、遺伝子発現分析を実施することで、組織間で整合性のとれた発現が見られるかを検証する。

  • Research Products

    (19 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 4 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Turin(イタリア)

    • Country Name
      ITALY
    • Counterpart Institution
      University of Turin
  • [Int'l Joint Research] Adam Mickiewicz University(ポーランド)

    • Country Name
      POLAND
    • Counterpart Institution
      Adam Mickiewicz University
  • [Int'l Joint Research] University of Liverpool/Keele University/University of Cambridge(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Liverpool/Keele University/University of Cambridge
  • [Int'l Joint Research] Swiss Federal Institute for Forest(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      Swiss Federal Institute for Forest
  • [Journal Article] Small temperature variations are a key regulator of reproductive growth and assimilate storage in oil palm (Elaeis guineensis)2020

    • Author(s)
      Tani Naoki、Abdul Hamid Zubaidah Aimi、Joseph Natra、Sulaiman Othman、Hashim Rokiah、Arai Takamitsu、Satake Akiko、Kondo Toshiaki、Kosugi Akihiko
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 10

    • DOI

      10.1038/s41598-019-57170-8

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] From theory to experiments for testing the proximate mechanisms of mast seeding: an agenda for an experimental ecology2019

    • Author(s)
      Bogdziewicz Michal、Ascoli Davide、Hacket‐Pain Andrew、Koenig Walter D.、Pearse Ian、Pesendorfer Mario、Satake Akiko、Thomas Peter、Vacchiano Giorgio、Wohlgemuth Thomas、Tanentzap Andrew
    • Journal Title

      Ecology Letters

      Volume: 23 Pages: 210~220

    • DOI

      10.1111/ele.13442

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Reproduction affects partitioning between new organs of a pulse of 15N applied during seed ripening in Fagus crenata2019

    • Author(s)
      Han Qingmin、Kabeya Daisuke、Inagaki Yoshiyuki
    • Journal Title

      New Forests

      Volume: 51 Pages: 739~752

    • DOI

      10.1007/s11056-019-09757-2

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Unravelling the molecular mechanism of bud dormancy transition and predicting flowering time in Somei-yoshino by multi-site field transcriptomics2020

    • Author(s)
      清水正明・北村系子・韓慶民・佐竹暁子
    • Organizer
      第62回植物生理学会年会
  • [Presentation] フィールドトランスクリプトームから明らかとなる植物の環境応答2019

    • Author(s)
      佐竹暁子
    • Organizer
      第8回 九州山口沖縄リズム研究会
  • [Presentation] Comparative field transcriptomics in trees2019

    • Author(s)
      佐竹暁子
    • Organizer
      International Symposium: Principles of pluripotent stem cells underlying plant vitality
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Flowering Season in Aseasonal Tropical Rain Forests2019

    • Author(s)
      佐竹暁子
    • Organizer
      Gordon research conference on chronobiology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Unravelling floweringu phenology shift under climate warming by field transcriptome2019

    • Author(s)
      佐竹暁子
    • Organizer
      SEB’s Annual Meeting in Seville, Spain
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Testing the environmental prediction hypothesis for general flowering using flowering phenology data monitored at the Pasoh Forest Reserve in Malaysia2019

    • Author(s)
      佐竹暁子
    • Organizer
      56th Annual meeting of the ASSOCIATION FOR TROPICAL BIOLOGY AND CONSERVATION
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Phase response of plant circadian clocks leads to robust metabolic rhythms under seasonal variations in day lengt2019

    • Author(s)
      佐竹暁子
    • Organizer
      Forum Math-for Industry 2019
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 遺伝子発現によるフェノロジー研究2019

    • Author(s)
      佐竹暁子
    • Organizer
      第51回種生物学シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Comparative field transcriptome in masting species to unravel the evolution of reproductive strategies in trees2019

    • Author(s)
      Wang Yufei・北島薫 ・韓慶民・佐竹暁子
    • Organizer
      第51回種生物学シンポジウム
  • [Presentation] 長期群集フェノロジーデータを用いた半島マレーシアにおける植物の開花・結実の解析2019

    • Author(s)
      山口香春・森本彩夏・保坂哲朗・沼田真也・佐竹暁子
    • Organizer
      第51回種生物学シンポジウム
  • [Presentation] Field transcriptome analysis of flowering phenology of flowering cherry blossom, Somei-Yoshino2019

    • Author(s)
      清水正明・北村系子・韓慶民・佐竹暁子
    • Organizer
      第51回種生物学シンポジウム
  • [Presentation] Influence of reproduction on seasonal variations of carbon and nitrogen in mature forest trees2019

    • Author(s)
      Qingmin Han
    • Organizer
      アメリカ地球物理学連合学会
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi