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2019 Fiscal Year Annual Research Report

初期翻訳系で使われたアミノ酸種類の時系列変化に関する研究

Research Project

Project/Area Number 17H03716
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

赤沼 哲史  早稲田大学, 人間科学学術院, 准教授 (10321720)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 横堀 伸一  東京薬科大学, 生命科学部, 講師 (40291702)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywords生命の起源 / アミノ酸組成 / 初期進化 / 原始タンパク質 / 翻訳系
Outline of Annual Research Achievements

10種類のアミノ酸で再構成した3種類の祖先型ヌクレオシドニリン酸キナーゼ、Arc1-10KS, Arc1-10RS, Arc1-10FIのうち、Arc1-10KSとArc1-10RSは検出可能なリン酸基転移活性を示さなかったが、80℃以上まで安定な立体構造を保つことが分かった。この結果から、10アミノ酸種類あれば、安定なタンパク質構造の形成に必要な情報を内包したアミノ酸配列がつくれることが示された。一方、Arc1-10FIは大腸菌で十分に発現できなかった。
Arc1-10KSとArc1-10FIの触媒活性に重要と思われる部位を元のアミノ酸に戻したArc1-10KS+HKNYとArc1-10FI+HNYを作製したところ、検出可能な活性を回復した。
アラニン、アスパラギン酸、グルタミン酸、グリシン、イソロイシン、ロイシン、プロリン、セリン、トレオニン、バリンの10アミノ酸種はしばしばプレバイオティックアミノ酸として参照され、原始地球にも比較的豊富に存在した可能性が指摘されている。本研究で構築したArc1-10KSとArc1-10RSでは、プレバイオティックアミノ酸が81.2%を占めた。触媒活性を回復したArc1-10KS+HKNYとArc1-10FI+HNYでは、プレバイオティックアミノ酸がそれぞれ78.2%と81.9%を占めた。
アミノアシルtRNA合成酵素の祖先型復元解析では、ProRS共通祖先、SerRS共通祖先、ProRS/SerRS共通祖先について、分子系統解析に基づく配列推定と祖先型復元をおこなった。これらと、IleRS共通祖先、ValRS共通祖先、IleRS/ValRS共通祖先のアミノアシル化触媒活性を、アミノアシル化反応で生成するピロリン酸をリン酸に分解して定量した。その結果、いずれの祖先ARSもアミノ酸特異的にリン酸の生成が生じることを見いだした。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Reconstruction and characterization of thermally stable and catalytically active proteins comprising an alphabet of ~13 amino acids2020

    • Author(s)
      Kimura M, Akanuma S.
    • Journal Title

      J. Mol. Evol.

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1007/s00239-020-09938-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Planktonic adaptive evolution to the sea surface temperature in the Neoproterozoic inferred from ancestral NDK of marine cyanobacteria2019

    • Author(s)
      Harada M, Nagano A, Yagi S, Furukawa R, Yokobori S, Yamagishi A.
    • Journal Title

      Earth and Planetary Science Letters

      Volume: 522 Pages: 98-106

    • DOI

      10.1016/j.epsl.2019.06.014

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 祖先アミノアシル tRNA 合成酵素の復元に基づく遺伝暗号の進化の解析2019

    • Author(s)
      横堀伸一,馬場柾,笹本峻弘,松田直樹,橋本ちひろ,村松あやか,佐藤陸, 遠藤有紀,宮下奈津実,丸山真歩,横川隆志,古川龍太郎,山岸明彦
    • Organizer
      第21回日本進化学会年会
  • [Presentation] 遺伝暗号は進化する2019

    • Author(s)
      横堀伸一
    • Organizer
      2019年度生命の起原・アストロバイオロジー夏の学校
  • [Presentation] ほぼ10アミノ酸種で再構成した酵素の解析2019

    • Author(s)
      赤沼哲史
    • Organizer
      2019年度アストロバイオロジーワークショップ
  • [Presentation] 祖先配列復元とその解析に基づくClass IaアミノアシルtRNA合成酵素の進化2019

    • Author(s)
      横堀伸一、古川龍太郎、松田直樹、笹本峻弘、横川隆志、山岸明彦
    • Organizer
      2019年度アストロバイオロジーワークショップ
  • [Presentation] 祖先配列の再構成とタンパク質単純化による原始アミノ酸組成の探索2019

    • Author(s)
      赤沼哲史、古川龍太郎
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 祖先Class IaアミノアシルtRNA合成酵素の基質特異性に基づく初期翻訳系の進化2019

    • Author(s)
      古川龍太郎、馬場柾、松田直樹、笹本峻弘、横川隆志、横堀伸一、山岸明彦
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会

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Published: 2021-01-27  

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