国際コンソーシアムにおける原発開放隅角緑内障責任遺伝子の同定

2019 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17H04046
• Research Institution: Kyoto Prefectural University of Medicine
• Principal Investigator: 田代 啓 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (10263097)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 木下 茂 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (30116024) ; 外園 千恵 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (30216585) ; 森 和彦 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (40252001) ; 池田 陽子 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 客員講師 (00433243) ; 上野 盛夫 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (40426531) ; 中野 正和 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (70381944) ; 吉井 健悟 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (90388471)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: 緑内障 / 全ゲノム関連解析 / GWAS / 多因子疾患 / ゲノム / DNAアレイ / DNAチップ

Outline of Annual Research Achievements

2018年にアジア人に特化して質の高いゲノム情報を取得できるイルミナ社ASAチップがアジア各国の共同研究先と歩調を合わせて使用可能になったので、本年度は2018年度に引き続いてイルミナ社HiScaSQ装置を用いてハイブリダイゼーション実験によりゲノム情報取得を実行した。 一方、国際緑内障遺伝学コンソーシアム(IGGC)のガイトラインに準拠し、インフォームトコンセントが得られた症例ついて、緑内障専門医である分担研究者が前眼部、眼圧、隅角、眼底検査等を行い、視野(静的/動的/FDT)、前房隅角および網膜神経線維層厚の測定(OCT; 光干渉断層計)、 視神経乳頭形状解析(HRT)、網膜視神経線維層解析(GDx)、前角膜厚・前眼部形状解析(Pentacam)データを検討した上で、「緑内障診断および緑内障病型」を厳格に決定し、対照群も同じ検査項目について検討して厳選した。連結可能匿名化バーコードを付与し、全血、血漿、抽出DNA、抽出RNAを収集した。新たに今年度約150例を収集して、 イルミナ社製ASAアレイを用いてジェノタイピングした検体数は、緑内障症例約1350例、緑内障陰性の対照例約650例となった。イルミナ社が供給しているクラスタリングプロトタイプでは、約4割のSNPについて本研究のハイブリダイゼーション結果と微妙にずれるため微修正を行って、より正確な結果を得た。この結果をSingapore National Eye centreの結果と照合して緑内障発症関連解析を行っている。特に落屑緑内障発症リスクについて重要なレアバリアントが同定され、現在、染色体13番q12のPOMP、染色体11番23.3のTMEM136、染色体6番p21のAGPAT1、染色体5番q23のSEMA6A、染色体3番p24のRBMS3などの確認の解析を実施中である。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Isolation and Characterization of Mammalian Otic Progenitor Cells that Can Differentiate into Both Sensory Epithelial and Neuronal Cell Lineages (2020)
  • Author(s): Kojima Ken、Nishida Akiko T.、Tashiro Kei、Hirota Kiichi、Nishio Takeshi、Murata Miyahiko、Kato Nobuo、Kawaguchi Saburo、Zine Azel、Ito Juichi、Water Thomas R.
  • Journal Title: The Anatomical Record Volume: 303 Pages: 451～460
  • DOI: 10.1002/ar.24335
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Association of rs613872 and Trinucleotide Repeat Expansion in the TCF4 Gene of German Patients With Fuchs Endothelial Corneal Dystrophy (2019)
  • Author(s): Okumura Naoki、Hayashi Ryousuke、Nakano Masakazu、Tashiro Kei、Yoshii Kengo、Aleff Ross、Butz Malinda、Highsmith Edward W.、Wieben Eric D.、Fautsch Michael P.、Baratz Keith H.、Komori Yuya、Ueda Emi、Nakahara Makiko、Weller Julia、Tourtas Theofilos、Schloetzer-Schrehardt Ursula、Kruse Friedrich、Koizumi Noriko
  • Journal Title: Cornea Volume: 38 Pages: 799～805
  • DOI: 10.1097/ICO.0000000000001952
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Differential expression of individual transcript variants of PD-1 and PD-L2 genes on Th-1/Th-2 status is guaranteed for prognosis prediction in PCNSL (2019)
  • Author(s): Takashima Yasuo、Kawaguchi Atsushi、Sato Ryuichi、Yoshida Kenichi、Hayano Azusa、Homma Jumpei、Fukai Junya、Iwadate Yasuo、Kajiwara Koji、Ishizawa Shin、Hondoh Hiroaki、Nakano Masakazu、Ogawa Seishi、Tashiro Kei、Yamanaka Ryuya
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 9 Pages: -
  • DOI: 10.1038/s41598-019-46473-5
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Trinucleotide repeat expansion in the transcription factor 4 (TCF4) gene in Thai patients with Fuchs endothelial corneal dystrophy (2019)
  • Author(s): Okumura Naoki、Puangsricharern Vilavun、Jindasak Raina、Koizumi Noriko、Komori Yuya、Ryousuke Hayashi、Nakahara Makiko、Nakano Masakazu、Adachi Hiroko、Tashiro Kei、Yoshii Kengo、Chantaren Patchima、Ittiwut Rungnapa、Shotelersuk Vorasuk、Suphapeetiporn Kanya
  • Journal Title: Eye Volume: - Pages: -
  • DOI: 10.1038/s41433-019-0595-8
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Towards genomic database of Alexander disease to identify variations modifying disease phenotype (2019)
  • Author(s): Yasuda Rei、Nakano Masakazu、Yoshida Tomokatsu、Sato Ryuichi、Adachi Hiroko、Tokuda Yuichi、Mizuta Ikuko、Saito Kozo、Matsuura Jun、Nakagawa Masanori、Tashiro Kei、Mizuno Toshiki
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 9 Pages: -
  • DOI: 10.1038/s41598-019-51390-8
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Nafamostat and sepimostat identified as novel neuroprotective agents via NR2B N-methyl-D-aspartate receptor antagonism using a rat retinal excitotoxicity model (2019)
  • Author(s): Fuwa Masahiro、Kageyama Masaaki、Ohashi Koji、Sasaoka Masaaki、Sato Ryuichi、Tanaka Masami、Tashiro Kei
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 9 Pages: -
  • DOI: 10.1038/s41598-019-56905-x
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] BRD4-Regulated Molecular Targets in Mantle Cell Lymphoma: Insights into Targeted Therapeutic Approach (2019)
  • Author(s): TSUKAMOTO TAKU、NAKAHATA SHINGO、SATO RYUICHI、KANAI AKINORI、NAKANO MASAKAZU、CHINEN YOSHIAKI、MAEGAWA-MATSUI SAORI、MATSUMURA-KIMOTO YAYOI、TAKIMOTO-SHIMOMURA TOMOKO、MIZUNO YOSHIMI、KUWAHARA-OTA SAEKO、KAWAJI YUKA、TANIWAKI MASAFUMI、INABA TOSHIYA、TASHIRO KEI、MORISHITA KAZUHIRO、KURODA JUNYA
  • Journal Title: Cancer Genomics - Proteomics Volume: 17 Pages: 77～89
  • DOI: 10.21873/cgp.20169
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 中枢神経系原発悪性リンパ腫におけるTh1/Th2バランスとPD-1およびPD-L2遺伝子発現による予後予測 (2019)
  • Author(s): 高島康郎, 川口淳, 佐藤隆一, 吉田健一, 早野あづさ, 本間順平, 深井順也, 岩立康男, 梶原浩司, 石澤伸, 本道洋昭, 中野正和, 小川誠司, 田代啓, 山中龍也.
  • Organizer: 第42回日本分子生物学会年会
• [Presentation] 新規遺伝子転座UBAP2L-ABL1を有するT細胞性急性リンパ性白血病 (2019)
  • Author(s): 川原勇太, 新島瞳, 翁由紀子, 早瀬朋美, 今村俊彦, 中野正和, 田代啓, 森本哲.
  • Organizer: 第81回日本血液学会学術集会
• [Presentation] 新生仔期マウス網膜の遺伝子発現情報のパスウェイ解析, 第92回日本生化学会大会 (2019)
  • Author(s): 徳田雄市, 足立博子, 富永洋之, 丸山悠子, 米田一仁, 丸山和一, 外園千恵, 木下茂, 中野正和, 田代啓.
  • Organizer: 第92回日本生化学会大会
• [Presentation] Association of trinucleotide repeat expansion length in TCF4 with the severity of Fuchs Endothelial Corneal Dystrophy. (2019)
  • Author(s): Komori Y, Okumura N, Weller J, Nakano M, Tashiro K, Yoshii K, Aleff R, Butz M, Highsmith EW, Wieben ED, Fautsch MP, Baratz KH, Tourtas T, Kruse FE, Koizumi N et al.
  • Organizer: 10th EuCornea Congress