2017 Fiscal Year Annual Research Report

適応放散の分子機構解明に向けたビクトリア湖沼生物ゲノムの多様性の網羅比較

Research Project

Project/Area Number	17H04606
Research Institution	Tokyo Institute of Technology
Principal Investigator	二階堂雅人東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 (70432010)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	佐々木剛東京農業大学, 農学部, 教授 (00581844) 高橋鉄美兵庫県立大学, 自然・環境科学研究所, 教授 (70432359)
Project Period (FY)	2017-04-01 – 2020-03-31
Keywords	シクリッド / ビクトリア湖 / 適応放散 / ゲノム多様性
Outline of Annual Research Achievements	本研究は、ビクトリア湖において適応放散を遂げたシクリッド類と放散を遂げていないその他湖沼生物について、ゲノム配列を網羅的に決定・比較することで、適応放散のゲノム基盤を探ることにある。そのために、シクリッドのDNA解析や生態調査に実績のある東京工業大、東京農業大、兵庫県立大、およびタンザニア水産研究所が協力体制を構築し、3年間をかけて上記の湖沼生物群の採集調査およびゲノム情報解析を進め、さらには各生物群における生態形質データの収集をおこなう。H29年度はまずタンザニア水産研究所と東工大の間で共同研究契約書を取り交わし、それに基づいて現地での調査許可書の発行も受けることができた。実際のビクトリア湖の野外調査に関しては東工大から１名が１ヶ月の調査を実施し、シクリッド各種サンプルを約300個体、その他ナマズ類、貝類、エビ類、トゲウナギ類のサンプルを採集し、タンザニア側の取り決めに従って我が国に輸入した。また兵庫県立大から１名がタンガニィカ湖の調査も実施し、同様にシクリッド類、エビ類のサンプルを採集することに成功し、これらも法律に乗っ取り我が国に輸入した。ビクトリア湖産シクリッドに関しては野生の３種各６個体（計１８個体）についてゲノム配列の取得もおこなっており、質の高いゲノム配列が揃ったため、これらの種間・種内における遺伝的多様性をゲノム情報学・集団遺伝学的に解析を開始した。また、ゲノム中に散在するレトロポゾンの網羅的な単離も開始しており、多くのゲノム情報を統合しながら、シクリッドの適応放散のゲノム基盤を明らかにしていく。
Current Status of Research Progress	Current Status of Research Progress 2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned. Reason 現地の調査許可が無事えられ、タンザニア水産研究所職員とも綿密な調査スケジュール案を打ち立てることができたのは非常に大きな収穫であった。また、現地野生種の全ゲノム配列の取得も進んでいるため、その進展はおおむね順調であると考えられる。
Strategy for Future Research Activity	H30年度には、H29年度に採集の叶わなかった種について集中的に調査を進めていこうと考えている。全ゲノム配列の集団遺伝解析に関しては、学会発表をおこない多くの専門家の指示を仰ぎたいと考えている。