2019 Fiscal Year Annual Research Report
Estimating effectiveness and its mechanism of case isolation
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17H04701
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
西浦 博 北海道大学, 医学研究院, 教授 (70432987)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 感染症情報 / 疫学 / 数理モデル / 危機管理 / 保健情報 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
隔離を含む非医学的（非薬物的）対策は病原体に非特異的なため、未だワクチンや治療法が開発されていない感染症など、幅広い対象に実施可能である。しかし、隔離による2次感染予防効果は具体的な数値として明らかにされておらず、例えば2014-16年に西アフリカで流行したエボラ出血熱に対して隔離が2次感染をどれだけ防ぎ得たかは未だ疫学的・統計学的に分析されていない。本研究の目的は、感染者の感染後経過時刻の関数として隔離実施を加味した2次感染発生の数理モデルを構築し、疫学情報およびゲノム情報の両方を含む観察データを分析することにより、隔離の効果を明示的に推定することである。これまでに、流行データを利用して感染性や相対的感染頻度を具体的に分析し、欠損情報を含むデータや様々な種類の観察情報からの推定に取り組んできた。具体的には、伝播ネットワーク再構築および接触者追跡調査に基づく2次感染リスクのモデル化を行った。前者の分析ではコンゴ民主共和国におけるエボラ出血熱流行のナウキャスティングおよびリアルタイム分析に取り組んだほか、同情報に基づくリアルタイム予測研究を発表することができた。また、2014-16年におけるナイジェリアおよびシエラレオネでのエボラ出血熱の際の隔離の効果推定に関する原著論文の執筆と一部の提出を実施することができた。折しも研究期間の途中、特に研究内容が熟成した段階で新型コロナウイルス感染症の流行が発生した。リアルタイムでの隔離他の効果推定に取り組んでいる。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
申請書で計画した通りに進んでおり、原著論文の執筆ができている。他方、これから新型コロナウイルス感染症の流行に応じて分析を要するため、そこに注力した研究計画の重点のシフトを検討している。
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| Strategy for Future Research Activity |
(1)接触毎の感染確率モデル定式化、(2)欠損情報を含むMERSとエボラ出血熱の隔離効果推定、(3)隔離内容の分解と研究デザイン整備、に取り組み、最終年度となる2020年度には特に（2）と(3)に関連する新型コロナウイルス感染症の研究を強化する予定である。(1)接触毎の感染確率の推定では、流行と別に履歴調査を実施し、様々な接触行動iの頻度情報Ciを収集する。それに基づき接触行動iの1回毎の感染回避確率Π(1-pi)^{Ci}を季節性流行から推定する。(2)病原体ゲノム情報を利用した伝播ネットワーク再構築では、疫学情報に加えて病原体ゲノム情報が各感染者から分離された際に誰が誰に感染させたのかを再構築するモデルを実装する。引き続き積分方程式を用いる方向を模索する。接触者追跡情報がなくても推定可能なモデルでなければ実用化することが難しいので、対応するモデルの導出と信頼性評価に注力する。
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