2018 Fiscal Year Research-status Report
Development of text data analysis based on statistical modeling in medical big data
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17K00047
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Research Institution | Shiga University |
Principal Investigator |
和泉 志津恵 (大久保志津恵) 滋賀大学, データサイエンス学部, 教授 (70344413)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐藤 健一 広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 准教授 (30284219)
冨田 哲治 県立広島大学, 経営情報学部, 准教授 (60346533)
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Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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Keywords | 生物統計 / データサイエンス / 共変量効果 / 出現頻度 / 可視化 |
Outline of Annual Research Achievements |
近年、国内外において、新たな治療技術の発見や創薬などの医学・医療の技術革新、そして、医療の効率化・最適化のために、医療ビッグデータからの新しい価値観の創出が期待されている。経時テキストデータの解析のため、和泉・佐藤ら(2015)は、特徴の時間変化を考慮して要約する方法を提案した。一方、加藤ら(2015)も、Word2Vec(Mikolov et al., 2013)と深層学習を用いたビッグテキストデータの解析方法を提案した。しかし、共変量の影響と、テキストの特徴の経時変化をともに考慮したテキストマイニング法の開発には至っていない。そこで、本研究では、大規模集団において経時的に観測されたテキストデータの解析方法を提案し、医療ビッグデータへ応用することを目的とする。 2018年度(2年次)には、2017年度(初年度)に得られた結果を基にして、まず、① 共変量付き経時テキストデータの解析方法の改善を検討した。提案方法の妥当性を検証するため、共変量が2値の場合におけるIzumiら(2017) の方法を用いて、広島と長崎の平和宣言のテキストデータを解析した(冨田ら, 2018)。共変量が2値以上の場合への理論の拡張についても、検討し始めた。次に、② アプリケーションの開発では、Shinyを用いてサンプルプログラムをテストした。さらに、③ 実データ解析への応用では、医療ビッグデータや防災など他分野のデータへの応用を、連携研究者と検討した。解析用作業データの加工に着手し、作業環境を整備した。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究では、大規模集団において経時的に観測されたテキストデータの解析方法を提案し、医療ビッグデータへ応用することを目的とする。2018 年度(2年次)の研究計画の概要は、主に、② アプリケーションの開発であった。 ② アプリケーションの開発では、サンプルプログラムのテストを行った。加えて、① 共変量付き経時テキストデータの解析方法の改善や、③ 実データ解析への応用に着手した。 これにより、研究はおおむね順調に進展しているといえる。
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Strategy for Future Research Activity |
2019年度は、2017年度および2018年度に得られた結果を基にして、主に、③ 実データへの応用を行い、研究成果を考察して、研究を総括する。具体的には、全国土木建築国民健康保険組合の医療ビッグデータを解析する。医学分野の観点から、解析結果を解釈することで、新たな知見を発掘する。加えて、解析結果に基づき提案方法の妥当性を検証し、提案方法の改善点を検討する。さらに、得られた結果を取りまとめ、成果の発表を行い、本研究を総括する。研究が当初計画どおりに進まない時は、別のソフトウェアや別のデータについても検討する。
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Causes of Carryover |
(理由) 招待講演の参加費や旅費が補助されたことから、旅費・その他について残高が生じた。加えて、大学院生の研究補助を必要な期間に得ることが出来なかったことから、人件費・謝金について残高が生じた。 (使用計画) 2019年度は、これまでと同様に、引き続き円滑に研究を進める。そのために、2019年度の研究費に対して、以下のような使用計画を立てている。物品として、PC周辺機器の購入を計画している。旅費として、国内学会での成果発表や研究打ち合わせのための国内旅費、および国際学会での成果発表のための外国旅費を計画している。謝金として、研究補助のための大学院生への謝金や文献複写への使用を計画している。その他として、英文校正や学術大会への参加費としての使用を計画している。
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