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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Transglycosylation activity of alpha-1,3-glucanase Agl-KA under semi-dry condition

Research Project

Project/Area Number 17K07708
Research InstitutionYamagata University

Principal Investigator

矢野 成和  山形大学, 大学院理工学研究科, 准教授 (50411228)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 今野 博行  山形大学, 大学院理工学研究科, 教授 (50325247)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywordsα-1,3-グルカナーゼ / 転移反応 / 結晶構造解析
Outline of Annual Research Achievements

これまでに、Bacillus circulans KA-304由来α-1,3-グルカナーゼAgl-KAは、アルカリ反応条件下で転移活性を示すことを明らかにし、また、Agl-KA触媒ドメイン(Agl-KAΔDCD-UCD)の結晶構造を解析した。本年度は、結晶構造解析による反応機構の解明と、Agl-KAと真菌型α-1,3-グルカナーゼを用いた反応比較、を行うために以下の2項目について検討した。
1. Agl-KAΔDCD-UCDとニゲロースのドッキングシミュレーションを行った結果、酵素の変異解析から明らかになった触媒必須アミノ酸である1067、1090、1091番目のアスパラギン酸が位置する部位にニゲロースが結合すると予測された。加水分解と転移反応の反応機構の解明を目指し、基質と酵素の共結晶体の構造解析を試みたが、得られた結晶中には基質が存在していなかった。そこで、触媒ドメインの1067番目アスパラギン酸をアラニンに置換した変異体D1067Aを用いて結晶化条件を検討し、単結晶を得た。
2. Agl-KAと比較するため、分裂酵母Schizosaccharomyces pombe由来α-1,3-グルカナーゼAgn1-spのクローニングとPichia pastorisでの異種発現を試みた。発現用プラスミドpPICZαB-Agn1spをエレクトロポレーション法にて、P. pastorisに導入した。得られた形質転換体の培養液を濃縮することで得た粗酵素標品を用いて、酢酸緩衝液(pH 5)中で不溶性α-1-3-グルカンの加水分解反応を行ったところ、ニゲロペンタオースとニゲロヘキサオースが生成した。NaOHで可溶化したα-1,3-グルカンを用いてpH 8で反応を行ったところ、得られた生成物はニゲロペンタオースとニゲロヘキサオースであり、より長鎖のオリゴ糖は得られなかった。

  • Research Products

    (6 results)

All 2020 2019

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Crystal structure of the catalytic unit of GH 87-type α-1,3-glucanase Agl-KA from Bacillus circulans2019

    • Author(s)
      Yano Shigekazu、Suyotha Wasana、Oguro Natsuki、Matsui Takashi、Shiga Shota、Itoh Takafumi、Hibi Takao、Tanaka Yoshikazu、Wakayama Mamoru、Makabe Koki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: ー

    • DOI

      https://doi.org/10.1038/s41598-019-51822-5

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural insights into substrate recognition and catalysis by glycoside hydrolase family 87 α‐1,3‐glucanase from Paenibacillus glycanilyticus FH112019

    • Author(s)
      Itoh Takafumi、Intuy Rattanaporn、Suyotha Wasana、Hayashi Junji、Yano Shigekazu、Makabe Koki、Wakayama Mamoru、Hibi Takao
    • Journal Title

      The FEBS Journal

      Volume: ー Pages: ー

    • DOI

      10.1111/febs.15161

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Bacillus circulans KA-304 由来 α-1,3-グルカナーゼの 機能解析と構造解析2020

    • Author(s)
      大塚 唯,矢野成和,伊藤貴文,日び隆雄, 田中良和,若山 守,真壁幸樹
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
  • [Presentation] Paenibacillus glycanilyticus FH11 由来 α-1,3-グルカ ナーゼ触媒ドメインの反応機構と結晶化2020

    • Author(s)
      Intuy Rattanaporn,伊藤貴文,スヨタワサナ, 林 順司,矢野成和 ,真壁幸樹,豊竹洋佑,若山 守, 日び隆雄
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
  • [Presentation] Bacillus circulans KA-304 由来α-1,3-グルカナーゼを用いたオリゴ糖生産条件の検討2019

    • Author(s)
      石黒奈緒子,矢野成和,大塚 唯,上地敬子,平良東紀
    • Organizer
      日本農芸化学会 2019 年度西日本・中四国支部合同沖縄大会
  • [Presentation] Paenibacillus sp. 14B 株由来α-1,3-グルカナーゼの諸性質と抗真菌活2019

    • Author(s)
      石嶺悠悟,津波古遥奈,高島智也,矢野成和,上地敬子,平良東紀
    • Organizer
      日本農芸化学会 2019 年度西日本・中四国支部合同沖縄大会

URL: 

Published: 2021-01-27  

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