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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Isomerization of Aspartate residue as a new indicator of aging

Research Project

Project/Area Number 17K13221
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

高田 匠  京都大学, 複合原子力科学研究所, 准教授 (80379007)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2021-03-31
Keywordsクリスタリン / 白内障 / 加齢 / 質量分析 / MRM法 / Asp異性化 / 結合型D-アミノ酸
Outline of Annual Research Achievements

アミノ酸は、本来キラル分子でありL-体とD-体の2種類の形態をとる。それにも関わらず、生体を構成する蛋白質中のアミノ酸残基は、L-アミノ酸のみであるという絶対的規則 (生体内ホモキラリティ) があった。しかしながら、蛋白質中に加齢に応じて部位特異的にD-体化しつつ、その過程で生じるβ-型を含む計4種として存在するAsp残基 (L-α-Asp, L-β-Asp, D-α-Asp, D-β-Asp) の存在が明らかとなってきた。
本研究では、蛋白質内部の各Aspに関して、異性化率の年齢依存性を高精度に定量比較するための手法開発に取り組んだ。その結果、MS/MS部位に四重極型質量分析装置を用い、Multiple Reaction Method(MRM法)を採用することで、従来より高精度の定量手法の開発に成功した。
本手法にて、ヒト眼内水晶体を構成するクリスタリン蛋白質中、部位特異的なAsp異性化率の加齢依存性を再評価した。続けて、蛋白質内部Asp残基の異性化形成に影響を及ぼす因子を評価するべく、In vitroで迅速に異性化するAsp残基(Asn残基脱アミド化を経由した)含有モデル蛋白質を作製した。
本手法では最終的な分析に質量分析装置を用いるため、試料の量は極めて少量で済む。加温は一般的なサーマルサイクラーおよびPCR用のチューブを用いており、蒸発を防ぐためのパラフィンオイルと、それを回収するパラフィルムがあれば実験可能であり、技術的な敷居も低い。本年度、質量分析装置部分を交換したが、交換前および交換後でも標的Asp異性化率の変化はなかったことからも本手法の精度かつ正確な定量性が示された。

  • Research Products

    (9 results)

All 2021 2020

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 3 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Elucidation of the mechanism of subunit exchange in αB crystallin oligomers2021

    • Author(s)
      Inoue Rintaro、Sakamaki Yusuke、Takata Takumi、Wood Kathleen、Morishima Ken、Sato Nobuhiro、Okuda Aya、Shimizu Masahiro、Urade Reiko、Fujii Noriko、Sugiyama Masaaki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-021-82250-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Site‐specific rapid deamidation and isomerization in human lens αA‐crystallin in vitro2020

    • Author(s)
      Takata Takumi、Ha Seongmin、Koide Tamaki、Fujii Noriko
    • Journal Title

      Protein Science

      Volume: 29 Pages: 941~951

    • DOI

      10.1002/pro.3821

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Asp isomerization increases aggregation of α-crystallin and decreases its chaperone activity in human lens of various ages2020

    • Author(s)
      Fujii Noriko、Takata Takumi、Kim Ingu、Morishima Ken、Inoue Rintaro、Magami Kousuke、Matsubara Toshiya、Sugiyama Masaaki、Koide Tamaki
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics

      Volume: 1868 Pages: 140446~140446

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2020.140446

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Simultaneous and Rapid Detection of Multiple Epimers and Isomers of Aspartyl Residues in Lens Proteins Using an LC-MS-MRM Method2020

    • Author(s)
      Fujii Noriko、Takata Takumi、Kim Ingu、Matsubara Toshiya
    • Journal Title

      ACS Omega

      Volume: 5 Pages: 27626~27632

    • DOI

      10.1021/acsomega.0c04197

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Effect of a Lens Protein in Low-Temperature Culture of Novel Immortalized Human Lens Epithelial Cells (iHLEC-NY2)2020

    • Author(s)
      Yamamoto Naoki、Takeda Shun、Hatsusaka Natsuko、Hiramatsu Noriko、Nagai Noriaki、Deguchi Saori、Nakazawa Yosuke、Takata Takumi、Kodera Sachiko、Hirata Akimasa、Kubo Eri、Sasaki Hiroshi
    • Journal Title

      Cells

      Volume: 9 Pages: 2670~2670

    • DOI

      10.3390/cells9122670

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] クリスタリン内部アミノ酸の翻訳後修飾からみる水晶体老化2020

    • Author(s)
      高田 匠
    • Organizer
      第59回日本白内障学会総会・第46回水晶体研究会
    • Invited
  • [Presentation] αA-クリスタリン中のAsp151をAsnに置換した組換え体では、同部位の異性化が10倍速く進行する2020

    • Author(s)
      高田 匠 , 藤井 紀子
    • Organizer
      第59回日本白内障学会総会・第46回水晶体研究会
  • [Presentation] 蛋白質結合型のアスパラギン酸残基の異性化修飾について2020

    • Author(s)
      高田 匠 , 藤井 紀子
    • Organizer
      第71回日本電気泳動学会総会
    • Invited
  • [Presentation] The Effects of Isomerization and Racemization of Asp Residues for Polypeptide Properties2020

    • Author(s)
      Takumi Takata, Naomi Hachiya and Noriko Fujii
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Invited

URL: 

Published: 2021-12-27  

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